Sumo2

Sumo2
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	1WM2, 1WM3, 1WZ0, 2AWT, 2CKH, 2D07, 2IO0, 2IO3, 2IYD, 2RPQ, 3UIN, 3UIO, 3ZO5, 4BKG, 4NPN, 2N9E, 5D2M, 2N1W
Identificadores
Alias	SUMO2 , HSMT3, SMT3B, SMT3H2, SUMO3, Smt3A, pequeño modificador similar a la ubiquitina 2, pequeño modificador similar a la ubiquitina 2
Identificaciones externas	OMIM : 603042; MGI : 2158813; HomoloGene : 87858; Tarjetas genéticas : SUMO2; OMA :SUMO2 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 17 (humano)
Fin	75.182.959 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 11 (ratón)
Fin	115.427.102 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	eminencia ganglionar; ; zona ventricular; ; mucosa del seno paranasal; ; célula endotelial; ; lóbulo inferior del pulmón; ; arteria temporal superficial; ; Islote de Langerhans; ; vermis cerebeloso; ; ovocito; ; monocito;
	Top expresado en
	cola del embrión; ; mórula; ; tubo neural; ; mesencéfalo; ; epiblast; ; eminencia ganglionar; ; embrión; ; zona ventricular; ; tubérculo genital; ; ovario;
	Más datos de expresión de referencia
	n / A
Ontología genética
Función molecular	unión de proteínas; unión de la proteína ligasa ubiquitina; etiqueta de proteína; Unión de ARN; unión del correpresor de transcripción; Actividad de la transferasa SUMO; unión de la proteína ligasa similar a la ubiquitina;
Componente celular	Cuerpo de PML; núcleo; nucleoplasm;
Proceso biológico	reparación por escisión de nucleótidos del genoma global; Regulación positiva del proceso catabólico proteico dependiente de la ubiquitina proteosomal; sumoilación de proteínas; Regulación positiva de la transcripción por la ARN polimerasa II.;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	6613
	170930
	ENSG00000188612
	ENSMUSG00000020738
	P61956
	P61957
	Número de serie 001005849 Número de ; serie 006937
	Número nuevo_133354
	NP_001005849 ; NP_008868
	NP_579932
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

El modificador pequeño relacionado con la ubiquitina 2 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen SUMO2 . ^[5]

Función

Este gen codifica una proteína que es miembro de la familia de proteínas SUMO (modificador pequeño similar a la ubiquitina). Es una proteína similar a la ubiquitina y funciona de manera similar a la ubiquitina en el sentido de que está unida a proteínas diana como parte de un sistema de modificación postraduccional . Sin embargo, a diferencia de la ubiquitina, que se asocia principalmente con la selección de proteínas para la degradación proteasomal , SUMO2 está involucrado en una variedad de procesos celulares, como el transporte nuclear, la regulación transcripcional, la apoptosis y la estabilidad proteica. No está activo hasta que se han escindido los dos últimos aminoácidos del extremo carboxilo . Se han descrito numerosos pseudogenes para este gen. Se han caracterizado variantes de empalme transcripcional alternativas que codifican diferentes isoformas . ^[6]

Interacciones

Se ha demostrado que SUMO2 interactúa con TRIM63 ^[7] y CFAP298 . ^[8]

Importancia clínica

La hipotermia profunda protege al cerebro de las lesiones isquémicas, por lo que se emplea en procedimientos cardiovasculares importantes que requieren una derivación cardiopulmonar y un período de paro circulatorio. En un experimento ^[9] realizado con hipotermia moderada, se activó significativamente la conjugación del modificador pequeño similar a la ubiquitina (SUMO1-3) en el cerebro. Los efectos de la hipotermia en la conjugación de SUMO se evaluaron en este experimento ^[9] mediante Western blot e inmunohistoquímica en animales que estaban normotérmicos (37 °C) o con una hipotermia profunda a moderada (18 °C, 24 °C, 30 °C) en derivación cardiopulmonar. En estas células, incluso una hipotermia de 30 °C fue suficiente para aumentar significativamente los niveles de proteína conjugada con SUMO2/3 y la acumulación de núcleos. La hipotermia profunda provocó que la enzima conjugadora de SUMO Ubc9 se translocara al núcleo, lo que implica que el aumento de los niveles nucleares de proteínas conjugadas con SUMO2/3 observado en los cerebros de animales hipotérmicos es un proceso activo. La hipotermia profunda provocó solo un pequeño aumento en las cantidades de proteínas conjugadas con SUMO2/3 en las células neuronales primarias. Esto demuestra que las neuronas in vivo tienen una mayor capacidad para activar este mecanismo endógeno posiblemente neuroprotector cuando se exponen a la hipotermia que las neuronas in vitro. La identificación de proteínas conjugadas con SUMO2/3 durante la hipotermia podría ayudar al desarrollo de nuevas terapias preventivas y terapéuticas para hacer que las neuronas sean más resistentes a una interrupción transitoria del suministro de sangre.

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000188612 – Ensembl , mayo de 2017
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^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
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^ "Gen Entrez: supresor SUMO2 SMT3 del homólogo 2 de mif dos 3 (S. cerevisiae)".
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^ ab Wang, Liangli; Ma, Qing; Yang, Wei; Mackensen, G. Burkhard; Paschen, Wulf (noviembre de 2012). "La hipotermia moderada induce un marcado aumento en los niveles y la acumulación nuclear de proteínas conjugadas con SUMO2/3 en neuronas". Journal of Neurochemistry . 123 (3): 349–359. doi :10.1111/j.1471-4159.2012.07916.x. PMC 3466336 . PMID 22891650.

Lectura adicional

Maruyama K, Sugano S (enero de 1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de capuchón de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Lapenta V, Chiurazzi P, van der Spek P, Pizzuti A, Hanaoka F, Brahe C (marzo de 1997). "SMT3A, un homólogo humano del gen SMT3 de S. cerevisiae, se asigna al cromosoma 21qter y define una nueva familia de genes". Genomics . 40 (2): 362–6. doi :10.1006/geno.1996.4556. PMID 9119407.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (octubre de 1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y enriquecida en el extremo 5'". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Kamitani T, Nguyen HP, Kito K, Fukuda-Kamitani T, Yeh ET (febrero de 1998). "Modificación covalente de PML por la familia de proteínas similares a la ubiquitina de la familia sentrina". The Journal of Biological Chemistry . 273 (6): 3117–20. doi : 10.1074/jbc.273.6.3117 . PMID 9452416.
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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000188612 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020738 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[pmid8630065-5] Mannen H, Tseng HM, Cho CL, Li SS (mayo de 1996). "Clonación y expresión de homólogo humano HSMT3 a SMT3 de levadura supresor de mutaciones MIF2 en un gen de proteína del centrómero". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 222 (1): 178–80. doi :10.1006/bbrc.1996.0717. PMID 8630065.

[entrez-6] "Gen Entrez: supresor SUMO2 SMT3 del homólogo 2 de mif dos 3 (S. cerevisiae)".

[pmid11283016-7] Dai KS, Liew CC (junio de 2001). "Una nueva proteína de dedo de zinc RING del músculo estriado humano, SMRZ, interactúa con SMT3b a través de su dominio RING". The Journal of Biological Chemistry . 276 (26): 23992–9. doi : 10.1074/jbc.M011208200 . PMID 11283016.

[pmid19471022-8] Golebiowski F, Matic I, Tatham MH, Cole C, Yin Y, Nakamura A, Cox J, Barton GJ, Mann M, Hay RT (2009). "Cambios en todo el sistema en las modificaciones de SUMO en respuesta al choque térmico". Science Signaling . 2 (72): ra24. doi :10.1126/scisignal.2000282. PMID 19471022. S2CID 33450256.

[:0-9] Wang, Liangli; Ma, Qing; Yang, Wei; Mackensen, G. Burkhard; Paschen, Wulf (noviembre de 2012). "La hipotermia moderada induce un marcado aumento en los niveles y la acumulación nuclear de proteínas conjugadas con SUMO2/3 en neuronas". Journal of Neurochemistry . 123 (3): 349–359. doi :10.1111/j.1471-4159.2012.07916.x. PMC 3466336 . PMID 22891650.