Cepa (biología)

Variante genética, subtipo o cultivo dentro de una especie biológica

En biología , una cepa es una variante genética, un subtipo o un cultivo dentro de una especie biológica . Las cepas suelen considerarse conceptos inherentemente artificiales, caracterizados por una intención específica de aislamiento genético. [1] Esto se observa más fácilmente en microbiología , donde las cepas se derivan de una colonia de células individuales y generalmente se ponen en cuarentena debido a las limitaciones físicas de una placa de Petri . Las cepas también se mencionan comúnmente en virología , botánica y con roedores utilizados en estudios experimentales . [ cita requerida ]

Microbiología y virología

Se ha dicho que "no existe una definición universalmente aceptada para los términos 'cepa', ' variante ' y 'aislado' en la comunidad virológica, y la mayoría de los virólogos simplemente copian el uso de términos de otros". [2]

Una cepa es una variante genética o subtipo de un microorganismo (por ejemplo, un virus , bacteria u hongo ). Por ejemplo, una "cepa de gripe" es una forma biológica determinada del virus de la influenza o "gripe". Estas cepas de gripe se caracterizan por sus diferentes isoformas de proteínas de superficie. Se pueden crear nuevas cepas virales debido a la mutación o intercambio de componentes genéticos cuando dos o más virus infectan la misma célula en la naturaleza. [3] Estos fenómenos se conocen respectivamente como deriva antigénica y cambio antigénico . Las cepas microbianas también se pueden diferenciar por su composición genética utilizando métodos metagenómicos para maximizar la resolución dentro de las especies. [4] Esto se ha convertido en una herramienta valiosa para analizar el microbioma . [ cita requerida ]

Construcciones artificiales

Los científicos han modificado cepas de virus para estudiar su comportamiento, como en el caso del virus de la gripe H5N1 . Si bien la financiación de este tipo de investigaciones ha suscitado controversias en ocasiones debido a preocupaciones sobre la seguridad, lo que ha llevado a una pausa temporal, posteriormente se ha continuado. [5] [6]

En biotecnología, se han construido cepas microbianas para establecer vías metabólicas adecuadas para tratar una variedad de aplicaciones. [7] Históricamente, se ha dedicado un gran esfuerzo de investigación metabólica al campo de la producción de biocombustibles. [8] Escherichia coli es la especie más común para la ingeniería de cepas procariotas. Los científicos han tenido éxito en establecer genomas mínimos viables a partir de los cuales se pueden desarrollar nuevas cepas. [9] Estas cepas mínimas proporcionan una garantía casi total de que los experimentos con genes fuera del marco mínimo no se verán afectados por vías no esenciales. Las cepas optimizadas de E. coli se utilizan típicamente para esta aplicación. La E. coli también se utiliza a menudo como un chasis para la expresión de proteínas simples. Estas cepas, como BL21, se modifican genéticamente para minimizar la actividad de la proteasa, lo que permite la producción de proteínas a escala industrial de alta eficiencia . [10]

Las cepas de levaduras son los sujetos más comunes de modificación genética eucariota, especialmente con respecto a la fermentación industrial . [11]

Plantas

El término no tiene un estatus de clasificación oficial en botánica; el término se refiere a los descendientes colectivos producidos a partir de un ancestro común que comparten un carácter morfológico o fisiológico uniforme. [12] Una cepa es un grupo designado de descendientes que descienden de una planta modificada (producida por cría convencional o por medios biotecnológicos), o que resultan de una mutación genética. [ cita requerida ]

Por ejemplo, algunas variedades de arroz se obtienen insertando nuevo material genético en una planta de arroz, [13] todos los descendientes de la planta de arroz modificada genéticamente son una variedad con información genética única que se transmite a generaciones posteriores; la designación de la variedad, que normalmente es un número o un nombre formal, cubre todas las plantas que descienden de la planta modificada originalmente. Las plantas de arroz de la variedad se pueden cruzar con otras variedades o cultivares de arroz y, si se producen plantas deseables, se las vuelve a cruzar para estabilizar los rasgos deseables; las plantas estabilizadas que se pueden propagar y "volverse verdaderas" (permanecer idénticas a la planta madre) reciben un nombre de cultivar y se liberan para la producción para que las utilicen los agricultores. [ cita requerida ]

Roedores

La rata Wistar, que fue la primera cepa modelo de rata desarrollada

Una cepa de ratón o rata de laboratorio es un grupo de animales que es genéticamente uniforme. Las cepas se utilizan en experimentos de laboratorio. Las cepas de ratón pueden ser endogámicas , mutadas o modificadas genéticamente , mientras que las cepas de rata suelen ser endogámicas . Una población de roedores endogámicos determinada se considera genéticamente idéntica después de 20 generaciones de apareamiento entre hermanos. Se han desarrollado muchas cepas de roedores para una variedad de modelos de enfermedades y también se utilizan a menudo para probar la toxicidad de los fármacos. [14] [15] [16]

Insectos

La mosca común de la fruta ( Drosophila melanogaster ) fue uno de los primeros organismos utilizados para el análisis genético , tiene un genoma simple y se la conoce muy bien. Ha seguido siendo un organismo modelo popular por muchas otras razones, como la facilidad de su crianza y mantenimiento, y la velocidad y el volumen de su reproducción. Se han desarrollado varias cepas específicas, incluida una versión no voladora con alas atrofiadas (también utilizada en el comercio de mascotas como alimento vivo para pequeños reptiles y anfibios). [ cita requerida ]

Véase también

Referencias

  1. ^ DIJKSHOORN, L.; URSING, BM; URSING, JB (2000). "Cepa, clon y especie: comentarios sobre tres conceptos básicos de bacteriología". Journal of Medical Microbiology . 49 (5): 397–401. doi : 10.1099/0022-1317-49-5-397 . PMID  10798550.
  2. ^ Kuhn, Jens H.; Bao, Yiming; Bávaro, Sina; Becker, Stephan; Bradfute, Steven; Brister, J. Rodney; Bukreyev, Alexander A.; Chandran, Kartik; Davey, Robert A.; Dolnik, Olga; Tinte, John M.; Enterlein, Sven; Hensley, Lisa E.; Honko, Anna N.; Jahrling, Peter B.; Johnson, Karl M.; Kobinger, Gary ; Leroy, Eric M.; Palanca, Mark S.; Mühlberger, Elke; Netesov, Sergey V.; Olinger, Gene G.; Palacios, Gustavo; Patterson, Jean L.; Paweska, Janusz T.; Pitt, Luisa; Radoshitzky, Sheli R.; Saphire, Erica Ollmann; Smither, Sophie J.; Swanepoel, Robert; Towner, Jonathan S.; van der Groen, Guido; Volchkov, Viktor E.; Wahl-Jensen, Victoria; Warren, Travis K.; Weidmann, Manfred; Nichol, Stuart T. (2012). "Nomenclatura de virus por debajo del nivel de especie: una nomenclatura estandarizada para variantes naturales de virus asignados a la familia Filoviridae". Archivos de Virología . 158 (1): 301–311. doi : 10.1007/s00705-012-1454-0 . ISSN  0304-8608. PMC 3535543 . PMID  23001720. 
  3. ^ Yong, Ed (2013). "Los científicos crean una gripe híbrida que puede transmitirse por el aire". Nature . doi :10.1038/nature.2013.12925. S2CID  181077199.
  4. ^ Marx, Vivien (28 de abril de 2016). "Microbiología: el camino hacia la identificación a nivel de cepa". Nature Methods . 13 (5): 401–404. doi : 10.1038/nmeth.3837 . PMID  27123815.
  5. ^ Butler, Declan (2012). "Los científicos piden que se suspendan durante 60 días las investigaciones sobre la gripe mutante". Nature . doi :10.1038/nature.2012.9873. S2CID  84203734.
  6. ^ "Gripe mutante". Especial de Nature News . Consultado el 21 de abril de 2019 .
  7. ^ Lee, Sang Yup (16 de noviembre de 2012). "Biología sintética y metabólica alterada en el desarrollo de cepas". ACS Synthetic Biology . 1 (11): 491–492. doi : 10.1021/sb300109d . PMID  23656224.
  8. ^ Liu, Tiangang; Khosla, Chaitan (3 de noviembre de 2010). "Modificación genética de Escherichia coli para la producción de biocombustibles". Revisión anual de genética . 44 (1): 53–69. doi :10.1146/annurev-genet-102209-163440. ISSN  0066-4197. PMID  20822440.
  9. ^ Sung, Bong Hyun; Choe, Donghui; Kim, Sun Chang; Cho, Byung-Kwan (30 de noviembre de 2016). "Construcción de un genoma mínimo como chasis para la biología sintética". Ensayos en bioquímica . 60 (4): 337–346. doi : 10.1042/ebc20160024 . ISSN  0071-1365. PMID  27903821.
  10. ^ Jeong, H; Kim, HJ; Lee, SJ (19 de marzo de 2015). "Secuencia completa del genoma de la cepa BL21 de Escherichia coli". Anuncios del genoma . 3 (2). doi :10.1128/genomeA.00134-15. PMC 4395058 . PMID  25792055. 
  11. ^ Steensels, enero; Snoek, Tim; Meersman, Esther; Nicolino, Martina Picca; Voordeckers, Karin; Verstrepen, Kevin J. (1 de septiembre de 2014). "Mejora de las cepas de levadura industriales: explotación de la diversidad natural y artificial". Reseñas de microbiología FEMS . 38 (5): 947–995. doi :10.1111/1574-6976.12073. ISSN  0168-6445. PMC 4293462 . PMID  24724938. 
  12. ^ Usher, George (1996), Diccionario Wordsworth de botánica , Ware, Hertfordshire: Wordsworth Reference, pág. 361, ISBN 978-1-85326-374-3
  13. ^ Maugh II, Thomas H. (18 de febrero de 2008). "Los genetistas han dado forma a las cepas híbridas de arroz - Los Angeles Times". Los Angeles Times .
  14. ^ Anderson, Mark S.; Bluestone, Jeffrey A. (29 de noviembre de 2004). "EL RATÓN NOD: Un modelo de desregulación inmunitaria". Revista anual de inmunología . 23 (1): 447–485. doi :10.1146/annurev.immunol.23.021704.115643. ISSN  0732-0582. PMID  15771578.
  15. ^ Cheon, Dong-Joo; Orsulic, Sandra (24 de enero de 2011). "Modelos murinos de cáncer". Revisión anual de patología: mecanismos de la enfermedad . 6 (1): 95–119. doi :10.1146/annurev.pathol.3.121806.154244. ISSN  1553-4006. PMID  20936938.
  16. ^ Yang, Guang; Zhao, Lifen; Liu, Bing; Shan, Yujia; Li, Yang; Zhou, Huimin; Jia, Li (2018). "El apoyo nutricional contribuye a la recuperación en un modelo de rata de anemia aplásica al mejorar la función mitocondrial". Nutrition . 46 : 67–77. doi :10.1016/j.nut.2017.09.002. PMID  29290359.
  • Centro de stock genético de coli
  • Índice de cepas de E. coli de EcoliWiki Archivado el 19 de mayo de 2019 en Wayback Machine.
  • Recurso internacional sobre cepas de ratones (IMSR)
  • Índice de tensión de la rata
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