Steven Albert Benner (nacido el 23 de octubre de 1954) es un químico estadounidense . Ha sido profesor en la Universidad de Harvard , ETH Zurich y, más recientemente, en la Universidad de Florida , donde fue profesor distinguido de química VT & Louise Jackson. En 2005, fundó el Instituto Westheimer de Ciencia y Tecnología (TWIST) y la Fundación para la Evolución Molecular Aplicada. Benner también ha fundado las empresas EraGen Biosciences y Firebird BioMolecular Sciences LLC.
Benner y sus colegas fueron los primeros en sintetizar un gen, lo que dio inicio al campo de la biología sintética . Fue fundamental en el establecimiento del campo de la paleogenética . Está interesado en el origen de la vida y las condiciones y procesos químicos necesarios para producir ARN . Benner ha trabajado con la NASA para desarrollar detectores de materiales genéticos alienígenas, utilizando la definición de vida desarrollada por el Grupo de Trabajo de Disciplina de Exobiología de la NASA en 1992, "un sistema químico autosuficiente capaz de evolución darwiniana". [2] [3] [4] [5]
Educación
Benner asistió a la Universidad de Yale , donde recibió su licenciatura y maestría en biofísica molecular y bioquímica en 1976. Luego fue a la Universidad de Harvard , donde recibió su doctorado en química en 1979. [6] Trabajó bajo la supervisión de Robert Burns Woodward , completando su trabajo de tesis con Frank Westheimer después de la muerte de Woodward. Su tesis doctoral fue Estereoquímica absoluta de la acetoacetato descarboxilasa, la betaína-homocisteína transmetilasa y la 3-hidroxibutirato deshidrogenasa. [7]
Carrera
Después de graduarse de la Universidad de Harvard , Benner se convirtió en miembro de Harvard y recibió el Premio Dreyfus para Jóvenes Profesores en 1982. Fue profesor asistente en el Departamento de Química de la Universidad de Harvard de 1982 a 1986. [8]
En 1986, Benner se trasladó a la ETH de Zúrich , el Instituto Federal Suizo de Tecnología en Zúrich. [9] Ocupó los puestos de profesor asociado de química bioorgánica de 1986 a 1993 y profesor de química bioorgánica de 1993 a 1996. [8]
En 1996 [10] Benner se unió a la facultad de la Universidad de Florida , como profesor de química y biología celular y molecular. Fue nombrado Profesor Distinguido de Química VT & Louise Jackson en el Departamento de Química de la Universidad de Florida en 2004. [11]
Benner abandonó la Universidad de Florida a finales de diciembre de 2005 para fundar el Instituto Westheimer de Ciencia y Tecnología (TWIST) en honor a Frank Westheimer . Forma parte de la Fundación para la Evolución Molecular Aplicada (FfAME) en Alachua, Florida , que Benner fundó en 2001. [12]
Benner fundó EraGen Biosciences en 1999. La empresa fue adquirida por Luminex en 2011. [13] [14] Fundó Firebird BioMolecular Sciences LLC en 2005. [12] [15] [16]
Investigación
La investigación de Benner se divide en cuatro áreas principales:
Ampliación del alfabeto genético mediante la síntesis de estructuras artificiales
Química prebiótica, la recreación del origen químico de la vida
Paleogenética, el estudio de proteínas antiguas de especies extintas hace mucho tiempo.
Detección de vida extraterrestre [17]
El laboratorio Benner es el creador del campo de la " biología sintética ", que busca generar, mediante síntesis química , moléculas que reproduzcan el comportamiento complejo de los sistemas vivos, incluyendo su genética, herencia y evolución. A continuación se enumeran algunos puntos destacados del trabajo anterior en genética química.
Síntesis de genes
En 1984, el laboratorio de Benner en Harvard fue el primero en informar sobre la síntesis química de un gen que codifica una enzima, [18] [19] [20] después de la síntesis de Khorana de un gen más corto para ARNt en 1970. [21] Este fue el primer gen diseñado de cualquier tipo, un logro pionero que sentó las bases para la ingeniería de proteínas . [22] Las estrategias de diseño introducidas en esta síntesis ahora se utilizan ampliamente para apoyar la ingeniería de proteínas. [23]
Sistemas genéticos artificiales
Los esfuerzos hacia el objetivo de los sistemas genéticos artificiales fueron reportados por primera vez por Benner y colaboradores en 1989, cuando desarrollaron el primer par de bases no natural . [24] [25] [26] [27] Benner y sus colegas han desarrollado desde entonces un sistema de información genética expandido artificialmente de seis letras llamado Sistema de Información Genética Expandido Artificialmente (AEGIS) que incluye dos nucleótidos no estándar adicionales (Z y P) además de los cuatro nucleótidos estándar (G, A, C y T). [28] [29] [30] [31] AEGIS tiene su propia biología molecular de apoyo. [5] Permite la síntesis de proteínas con más de los 20 aminoácidos codificados naturalmente y proporciona información sobre cómo los ácidos nucleicos forman estructuras dúplex, cómo las proteínas interactúan con los ácidos nucleicos, [32] y cómo podrían aparecer sistemas genéticos alternativos en la vida no terrestre. [33]
Benner es uno de los investigadores, entre los que se incluyen Eric T. Kool, Floyd E. Romesberg, Ichiro Hirao, Mitsuhiko Shionoya y Andrew Ellington, que han creado un alfabeto extendido de bases sintéticas que se pueden incorporar al ADN (así como al ARN) utilizando enlaces Watson-Crick (así como enlaces no Watson-Crick). Si bien la mayoría de estas bases sintéticas son derivadas de las bases A, C, G, T, algunas son diferentes. Mientras que algunas están en pares Watson-Crick (A/T, C/G), algunas se autocomplementan (X/X). De este modo, se ha ampliado el alfabeto genético. [15] [25] [27] [34] [35] [36] [37] [38] : 88–98
El número de posibles tripletes de nucleótidos, o codones , disponibles en la síntesis de proteínas depende del número de nucleótidos disponibles. El alfabeto estándar (G, A, C y T) produce 4 3 = 64 codones posibles, mientras que un alfabeto de ADN expandido con 9 bases de ADN tendría 9 3 = 729 codones posibles, muchos de ellos codones sintéticos. Para que estos codones sean útiles, se ha creado la aminoacil ARNt sintetasa de manera que el ARNt pueda codificar el posible aminoácido sintético que se va a acoplar con su anticodón sintético correspondiente. Benner ha descrito un sistema de este tipo que utiliza ADN sintético iso-C/iso-G que utiliza el codón de ADN sintético [iso-C/A/G] que él llama el codón 65. El ARNm sintético con anticodón sintético [iso-G/U/C] con aminoacil-ARNt sintetasa sintética da como resultado un experimento in vivo que puede codificar un aminoácido sintético incorporado en polipéptidos sintéticos ( proteómica sintética ). [38] : 100–106
Un modelo de “segunda generación” para los ácidos nucleicos
Benner ha utilizado la química orgánica sintética y la biofísica para crear un modelo de "segunda generación" para la estructura de los ácidos nucleicos. El modelo de primera generación del ADN fue propuesto por James Watson y Francis Crick , basándose en las estructuras de rayos X cristalizadas que estudiaba Rosalind Franklin . Según el modelo de doble hélice , el ADN está compuesto por dos cadenas complementarias de nucleótidos enrolladas una alrededor de la otra. [39] El modelo de Benner enfatiza el papel de la cadena principal de azúcar y fosfato en el evento de reconocimiento molecular genético. La cadena principal polianiónica es importante para crear la estructura extendida que ayuda al ADN a replicarse. [40] [41] [42]
En 2004, Benner informó sobre el primer intento exitoso de diseñar una molécula artificial similar al ADN capaz de reproducirse a sí misma. [22]
Secuenciación del genoma y predicción de la estructura de las proteínas
A finales de los años 1980, Benner reconoció el potencial de los proyectos de secuenciación del genoma para generar millones de secuencias y permitir a los investigadores hacer un mapeo extenso de las estructuras moleculares en la química orgánica. A principios de los años 1990, Benner conoció a Gaston Gonnet , iniciando una colaboración que aplicó las herramientas de Gonnet para la búsqueda de texto a la gestión de secuencias de proteínas. [43] [44] En 1990, en colaboración con Gaston Gonnet , el laboratorio de Benner presentó el banco de trabajo de bioinformática DARWIN. DARWIN (Análisis y recuperación de datos con secuencias de ácidos nucleicos y péptidos indexadas) era un entorno de programación de alto nivel para examinar secuencias genómicas. Respaldaba la coincidencia de secuencias genómicas en bases de datos y generaba información que mostraba cómo las proteínas naturales podían evolucionar de manera divergente bajo restricciones funcionales mediante la acumulación de mutaciones, inserciones y deleciones. [45] Basándose en Darwin, el laboratorio de Benner proporcionó herramientas para predecir la estructura tridimensional de las proteínas a partir de datos de secuencias. La información sobre las estructuras proteicas conocidas fue recopilada y comercializada como una base de datos comercial, el Catálogo Maestro, por la empresa emergente EraGen de Benner. [45]
El uso de información de secuencias múltiples para predecir la estructura secundaria de las proteínas se hizo popular como resultado del trabajo de Benner y Gerloff. [46] [47] [48] Las predicciones de la estructura secundaria de las proteínas realizadas por Benner y sus colegas lograron una gran precisión. [49] Se hizo posible modelar los pliegues de las proteínas, detectar homólogos distantes, habilitar la genómica estructural y unir la secuencia, la estructura y la función de las proteínas. Además, este trabajo sugirió límites a la predicción de la estructura por homología, definiendo lo que se puede y no se puede hacer con esta estrategia. [45]
Herramientas prácticas de genotipado
El enfoque de Benner abrió nuevas perspectivas sobre cómo funcionan los ácidos nucleicos, así como herramientas para diagnósticos y nanotecnología. La FDA ha aprobado productos que utilizan AEGIS DNA en diagnósticos humanos. Estos monitorean las cargas de virus en pacientes infectados con hepatitis B , hepatitis C y VIH . [50] AEGIS ha sido la base del desarrollo de herramientas para la detección multiplexada de marcadores genéticos como células cancerosas [51] y polimorfismos de un solo nucleótido en muestras de pacientes. Estas herramientas permitirán la medicina personalizada utilizando análisis genéticos " point-of-care ", [52] así como herramientas de investigación que miden el nivel de moléculas de ARNm individuales dentro de procesos únicos de neuronas vivas individuales. [53]
Proteómica interpretativa
Al interpretar datos genómicos y retrotraerlos a un ancestro genético común, "Luca", el laboratorio Benner ha introducido herramientas que analizan patrones de conservación y variación utilizando la biología estructural, estudian la variación de estos patrones a lo largo de diferentes ramas de un árbol evolutivo y correlacionan eventos en el registro genético con eventos en la historia de la biosfera conocidos a partir de la geología y los fósiles. De esto han surgido ejemplos que muestran cómo se pueden entender los roles de las biomoléculas en la vida contemporánea a través de modelos del pasado histórico. [54] [55]
Paleogenética experimental
Benner fue un creador del campo de la paleogenética experimental , donde los genes y proteínas de organismos antiguos se resucitan utilizando bioinformática y tecnología de ADN recombinante. [56] El trabajo experimental sobre proteínas antiguas ha probado hipótesis sobre la evolución de funciones biológicas complejas, incluyendo la bioquímica de la digestión de los rumiantes, [57] [58] : 209 la termofilia de las bacterias antiguas y la interacción entre plantas, frutas y hongos en el momento de la extinción del Cretácico . [58] : 17 Estos desarrollan nuestra comprensión del comportamiento biológico que se extiende desde la molécula a la célula al organismo, ecosistema y planeta, a veces denominado biología planetaria. [58] : 221
Astrobiología
Benner está profundamente interesado en el origen de la vida y las condiciones necesarias para sustentar un modelo de mundo de ARN en el que el ARN autorreplicante sea un precursor de la vida en la Tierra. Ha identificado el calcio , el borato y el molibdeno como importantes para la formación exitosa de carbohidratos y la estabilización del ARN. [59] Sugirió que el planeta Marte puede haber tenido condiciones más deseables que la Tierra para la producción inicial de ARN, [60] [61] pero más recientemente estuvo de acuerdo en que los modelos de la Tierra primitiva que muestran tierra seca y agua intermitente, desarrollados por Stephen Mojzsis, presentan condiciones suficientes para el desarrollo del ARN. [12]
El grupo de Benner ha trabajado para identificar estructuras moleculares que probablemente sean características universales de los sistemas vivos independientemente de su génesis, y no productos probables de procesos no biológicos. Estas son " biofirmas ", tanto para la vida similar a la terrestre como para las formas de vida "extrañas". [3] [62] [63]
Uno de estos identificadores universales de vida fue propuesto en la Teoría Polielectrolítica del Gen. Esta idea propone que para que un biopolímero genético lineal disuelto en agua, como el ADN , experimente una evolución darwiniana en cualquier parte del universo, debe ser un polielectrolito , un polímero que contiene cargas iónicas repetidas . [64] Este concepto fue vinculado por Benner a la visión del "cristal aperiódico" del gen propuesta por Erwin Schrödinger en su libro " ¿Qué es la vida? " para hacer una visión robusta y universalmente generalizable de la biomolécula genética. [65] Esta idea ha sido sugerida como un marco mediante el cual los científicos pueden buscar vida en otros cuerpos solares además de la Tierra. [66]
Referencias
^ "Benner, Steven A. (Steven Albert), 1954-". Registros de autoridad de la Biblioteca del Congreso . Consultado el 30 de junio de 2016 .
^ Mullen, Leslie (1 de agosto de 2013). "Definiendo la vida: preguntas y respuestas con el científico Gerald Joyce". Astrobiology Magazine . Consultado el 5 de julio de 2016 .
^ ab Benner, Steven A. (diciembre de 2010). "Definiendo la vida". Astrobiología . 10 (10): 1021–1030. Código Bibliográfico :2010AsBio..10.1021B. doi :10.1089/ast.2010.0524. PMC 3005285 . PMID 21162682.
^ Klotz, Irene (27 de febrero de 2009). «Una forma de vida sintética crece en un laboratorio de Florida». Science . Archivado desde el original el 13 de enero de 2016. Consultado el 5 de julio de 2016 .
^ ab Lloyd, Robin (14 de febrero de 2009). «Nuevo ADN artificial apunta a vida extraterrestre». LiveScience . Consultado el 5 de julio de 2016 .
^ Impey, Chris Impey; Spitz, Anna H.; Stoeger, William, eds. (2013). Encuentro con la vida en el universo: fundamentos éticos e implicaciones sociales de la astrobiología. Tucson: University of Arizona Press. p. 259. ISBN978-0-8165-2870-7. Recuperado el 30 de junio de 2016 .
^ "Steven A. Benner". Chemistry Tree . Consultado el 30 de junio de 2016 .
^ ab "Eventos en Rice". Universidad Rice . Archivado desde el original el 19 de septiembre de 2016. Consultado el 1 de julio de 2016 .
^ Kwok, Roberta (21 de noviembre de 2012). "Biología química: el nuevo alfabeto del ADN". Nature . 491 (7425): 516–518. Bibcode :2012Natur.491..516K. doi : 10.1038/491516a . PMID 23172197.
^ Benner, Steven A. "Pares de bases no estándar como herramientas de investigación biomédica". Grantome . Consultado el 1 de julio de 2016 .
^ "Participantes". The Humble Approach Initiative . Consultado el 1 de julio de 2016 .
^ abc Clark, Anthony (24 de marzo de 2016). "Un equipo local encabezará una misión de 5,4 millones de dólares para estudiar los orígenes de la vida en la Tierra". The Gainesville Sun. Consultado el 30 de junio de 2016 .
^ Wyzan, Andrew (12 de julio de 2011). "Ex empresa de biotecnología de Gainesville vendida por 34 millones de dólares". The Gainesville Sun. Consultado el 1 de julio de 2016 .
^ Carroll, John. "Luminex compra EraGen Biosciences en un acuerdo de 34 millones de dólares". Fierce Biotech . Consultado el 22 de junio de 2011 .
^ ab Howgego, Josh (25 de febrero de 2014). "On stranger nucleotides" (Sobre nucleótidos extraños). Chemistry World . Consultado el 1 de julio de 2016 .
^ "Firebird BioMolecular Sciences LLC".
^ "Coloquio sobre el sueño del presidente". Universidad Simon Fraser . Consultado el 1 de julio de 2016 .
^ Gross, Michael (agosto de 2011). "¿Qué es exactamente la biología sintética?". Current Biology . 21 (16): R611–R614. Bibcode :2011CBio...21.R611G. doi : 10.1016/j.cub.2011.08.002 .
^ Nambiar, K.; Stackhouse, J.; Stauffer, D.; Kennedy, W.; Eldredge, J.; Benner, S. (23 de marzo de 1984). "Síntesis total y clonación de un gen que codifica la proteína ribonucleasa S" (PDF) . Science . 223 (4642): 1299–1301. Bibcode :1984Sci...223.1299N. doi :10.1126/science.6322300. PMID 6322300 . Consultado el 5 de julio de 2016 .
^ D'Alessio, Giuseppe; Riordan, James F. (1997). Estructuras y funciones de las ribonucleasas. San Diego: Academic Press. p. 214. ISBN9780125889452. Recuperado el 5 de julio de 2016 .
^ Khorana, HG; Agarwal, KL; Büchi, H.; Caruthers, MH; Gupta, NK; Klbppe, K.; Kumar, A.; Ohtsuka, E.; RajBhandary, UL; van de Sande, JH; Sgaramella, V.; Tebao, T.; Weber, H.; Yamada, T. (diciembre de 1972). "CIII. Síntesis total del gen estructural para la transferencia de alanina al ácido ribonucleico de la levadura". Revista de biología molecular . 72 (2): 209–217. doi :10.1016/0022-2836(72)90146-5. PMID 4571075.
^ ab Gramling, Carolyn (2005). "Para el profesor de química Steven Benner, la vida tal como la conocemos puede no ser la única alternativa". Amazing Science . 10 (1) . Consultado el 9 de julio de 2016 .
^ Köhrer, Carolina; RajBhandary, Uttam L., eds. (2009). Ingeniería de proteínas. Berlín: Springer. págs. 274–281, 297. ISBN978-3-540-70941-1. Recuperado el 5 de julio de 2016 .
^ Fikes, Bradley J. (8 de mayo de 2014). "Vida diseñada con código genético expandido". San Diego Union Tribune . Consultado el 5 de julio de 2016 .
^ ab Matsuda, Shigeo; Fillo, Jeremiah D.; Henry, Allison A.; Rai, Priyamrada; Wilkens, Steven J.; Dwyer, Tammy J.; Geierstanger, Bernhard H.; Wemmer, David E.; Schultz, Peter G.; Spraggon, Glen; Romesberg, Floyd E. (agosto de 2007). "Esfuerzos hacia la expansión del alfabeto genético: estructura y replicación de pares de bases no naturales". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 129 (34): 10466–10473. doi :10.1021/ja072276d. PMC 2536688. PMID 17685517 .
^ Switzer, Christopher; Moroney, Simon E.; Benner, Steven A. (octubre de 1989). "Incorporación enzimática de un nuevo par de bases en el ADN y el ARN". Journal of the American Chemical Society . 111 (21): 8322–8323. doi :10.1021/ja00203a067.
^ ab Piccirilli, Joseph A.; Benner, Steven A.; Krauch, Tilman; Moroney, Simon E.; Benner, Steven A. (4 de enero de 1990). "La incorporación enzimática de un nuevo par de bases en el ADN y el ARN extiende el alfabeto genético". Nature . 343 (6253): 33–37. Bibcode :1990Natur.343...33P. doi :10.1038/343033a0. PMID 1688644. S2CID 4363955.
^ Benner, SA; Hutter, D; Sismour, AM (2003). "Biología sintética con sistemas de información genética expandidos artificialmente. De la medicina personalizada a la vida extraterrestre". Nucleic Acids Research. Suplemento . 3 (3): 125–6. doi :10.1093/nass/3.1.125. PMID 14510412.
^ Yang, Z; Hutter, D; Sheng, P; Sismour, AM; Benner, SA (2006). "Sistema de información genética expandido artificialmente: un nuevo par de bases con un patrón de enlace de hidrógeno alternativo". Nucleic Acids Research . 34 (21): 6095–101. doi :10.1093/nar/gkl633. PMC 1635279 . PMID 17074747.
^ Yang, Zunyi; Chen, Fei; Alvarado, J. Brian; Benner, Steven A. (28 de septiembre de 2011). "Amplificación, mutación y secuenciación de un sistema genético sintético de seis letras". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 133 (38): 15105–15112. doi :10.1021/ja204910n. PMC 3427765 . PMID 21842904.
^ Merritt, Kristen K; Bradley, Kevin M; Hutter, Daniel; Matsuura, Mariko F; Rowold, Diane J; Benner, Steven A (9 de octubre de 2014). "Ensamblaje autónomo de oligonucleótidos sintéticos construidos a partir de un alfabeto de ADN expandido. Síntesis total de un gen que codifica la resistencia a la kanamicina". Beilstein Journal of Organic Chemistry . 10 : 2348–2360. doi :10.3762/bjoc.10.245. PMC 4222377 . PMID 25383105.
^ Laos, Roberto; Thomson, J. Michael; Benner, Steven A. (31 de octubre de 2014). "ADN polimerasas diseñadas mediante evolución dirigida para incorporar nucleótidos no estándar". Frontiers in Microbiology . 5 : 565. doi : 10.3389/fmicb.2014.00565 . PMC 4215692 . PMID 25400626.
^ Comité sobre los Límites de la Vida Orgánica en Sistemas Planetarios, Comité sobre los Orígenes y la Evolución de la Vida; Junta de Estudios Espaciales, División de Ingeniería y Ciencias Físicas; Junta de Ciencias de la Vida, División de la Tierra y Ciencias de la Vida; Consejo Nacional de Investigación de las Academias Nacionales (2007). "4. Alternativas a la bioquímica terrestre en el agua". Los límites de la vida orgánica en sistemas planetarios . Washington, DC: National Academies Press. ISBN978-0-309-10484-5.{{cite book}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
^ Pollack, Andrew (24 de julio de 2001). «Los científicos están empezando a añadir letras al alfabeto de la vida». The New York Times . Consultado el 30 de junio de 2016 .
^ Singer, Emily (10 de julio de 2015). «Nuevas letras añadidas al alfabeto genético». Quanta Magazine . Consultado el 30 de junio de 2016 .
^ Switzer, CY; Moroney, SE; Benner, SA (5 de octubre de 1993). "Reconocimiento enzimático del par de bases entre isocitidina e isoguanosina". Bioquímica . 32 (39): 10489–96. CiteSeerX 10.1.1.690.1426 . doi :10.1021/bi00090a027. PMID 7691174.
^ Takezawa, Yusuke; Shionoya, Mitsuhiko (18 de diciembre de 2012). "Emparejamiento de bases de ADN mediado por metales: alternativas a los pares de bases Watson-Crick unidos por enlaces de hidrógeno". Accounts of Chemical Research . 45 (12): 2066–2076. doi :10.1021/ar200313h. PMID 22452649.
^ ab Simon, Matthew (2005). Computación emergente con énfasis en la bioinformática . Nueva York: AIP Press/Springer Science+Business Media. ISBN978-0-387-27270-2.
^ Watson JD, Crick FH (1953). "La estructura del ADN". Cold Spring Harb. Symp. Quant. Biol . 18 : 123–31. doi :10.1101/SQB.1953.018.01.020. PMID 13168976.
^ Comité sobre los Límites de la Vida Orgánica en Sistemas Planetarios, Comité sobre los Orígenes y la Evolución de la Vida; Junta de Estudios Espaciales, División de Ingeniería y Ciencias Físicas; Junta de Ciencias de la Vida, División de la Tierra y Ciencias de la Vida; Consejo Nacional de Investigación de las Academias Nacionales (2007). "4. Alternativas a la bioquímica terrestre en el agua". Los límites de la vida orgánica en sistemas planetarios . Washington, DC: National Academies Press. ISBN978-0-309-10484-5.{{cite book}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
^ Benner, Steven (2004). "Análisis del genoma basado en la evolución: una alternativa para analizar el plegamiento y la función de las proteínas". En Westhof, E.; Hardy, N. (eds.). Plegado y autoensamblaje de moléculas biológicas y macromoléculas: actas de los deuxièmes Entretiens de Bures, Bures-sur-Yvette, Francia, 27 de noviembre - 1 de diciembre de 2001. Singapur: World Scientific. págs. 1–42. ISBN978-981-238-500-0. Recuperado el 6 de julio de 2016 .
^ Benner, Steven A.; Hutter, Daniel (febrero de 2002). "Fosfatos, ADN y la búsqueda de vida no terrestre: un modelo de segunda generación para moléculas genéticas" (PDF) . Química bioorgánica . 30 (1): 62–80. doi :10.1006/bioo.2001.1232. PMID 11955003 . Consultado el 6 de julio de 2016 .
^ "Prof. Gaston Gonnet: cuando la tecnología es la clave de la evolución". ETH Zurich . Consultado el 9 de julio de 2016 .
^ Gonnet, GH; Cohen, MA; Benner, SA (5 de junio de 1992). "Coincidencia exhaustiva de la base de datos completa de secuencias de proteínas" (PDF) . Science . 256 (5062): 1443–5. Bibcode :1992Sci...256.1443G. doi :10.1126/science.1604319. PMID 1604319 . Consultado el 9 de julio de 2016 .
^ abc "La genómica se encuentra con la geología". Revista AstroBiology . 10 de septiembre de 2001. Consultado el 1 de julio de 2016 .
^ Jones, David T. (1999). "Protein Secondary Structure Prediction Based on Position-specific Scoring Matrices" (PDF) . Journal of Molecular Biology . 292 (2): 195–202. doi :10.1006/jmbi.1999.3091. PMID 10493868. Archivado desde el original (PDF) el 2016-08-18 . Consultado el 6 de julio de 2016 .
^ Benner, SA; Gerloff, D (1991). "Patrones de divergencia en proteínas homólogas como indicadores de estructura secundaria y terciaria: una predicción de la estructura del dominio catalítico de las proteínas quinasas". Advances in Enzyme Regulation . 31 : 121–81. doi :10.1016/0065-2571(91)90012-b. PMID 1877385.
^ Gonnet, Gaston H.; Korostensky, Chantal; Benner, Steve (febrero de 2000). "Medidas de evaluación de alineaciones de secuencias múltiples". Revista de biología computacional . 7 (1–2): 261–276. CiteSeerX 10.1.1.48.4250 . doi :10.1089/10665270050081513. PMID 10890401.
^ Russell, RB; Sternberg, MJE (mayo de 1995). "Predicción de la estructura: ¿Qué tan buenos somos?". Current Biology . 5 (5): 488–490. Bibcode :1995CBio....5..488R. doi : 10.1016/S0960-9822(95)00099-6 . PMID 7583096.
^ Spoto, Giuseppe; Corradini, Roberto, eds. (2012). Detección de ADN genómico no amplificado. Dordrecht: Springer. pag. 104.ISBN978-94-007-1226-3. Recuperado el 6 de julio de 2016 .
^ Dambrot, Stuart Mason (24 de enero de 2014). "Los lazos que unen: Recreando la evolución darwiniana de los ligandos in vitro". Phys.org . Consultado el 6 de julio de 2016 .
^ Jannetto, Paul J.; Laleli-Sahin, Elvan; Wong, Steven H. (1 de enero de 2004). "Metodologías de genotipado farmacogenómico". Química clínica y medicina de laboratorio . 42 (11): 1256–64. doi :10.1515/CCLM.2004.246. PMID 15576288. S2CID 34338787.
^ "Resumen del premio n.º 0304569 Matrices a nanoescala para el perfilado directo de ARN en células individuales y sus compartimentos". National Science Foundation . Consultado el 6 de julio de 2016 .
^ Plaxco, Kevin W.; Gross, Michael (2006). Astrobiología: una breve introducción. Baltimore: Johns Hopkins University Press. págs. 165-170. ISBN978-0801883675. Recuperado el 6 de julio de 2016 .
^ Benner, Steven A. (junio de 2003). "Proteómica interpretativa: búsqueda de significado biológico en bases de datos de genoma y proteoma" (PDF) . Avances en la regulación enzimática . 43 (1): 271–359. CiteSeerX 10.1.1.104.7549 . doi :10.1016/S0065-2571(02)00024-9. PMID 12791396. Consultado el 6 de julio de 2016 .
^ Jermann, TM; Opitz, JG; Stackhouse, J; Benner, SA (2 de marzo de 1995). "Reconstructing the evolutionary history of the artiodactyl ribonuclease superfamily" (PDF) . Nature . 374 (6517): 57–9. Bibcode :1995Natur.374...57J. doi :10.1038/374057a0. PMID 7532788. S2CID 4315312 . Consultado el 6 de julio de 2016 .
^ Benner, SA; Caraco, MD; Thomson, JM; Gaucher, EA (3 de mayo de 2002). "Biología planetaria: historias paleontológicas, geológicas y moleculares de la vida". Science . 296 (5569): 864–8. Bibcode :2002Sci...296..864B. doi :10.1126/science.1069863. PMID 11988562. S2CID 2316101.
^ abc Liberles, David A. (2007). Reconstrucción de secuencias ancestrales. Oxford: Oxford University Press. p. 221. ISBN9780199299188.
^ Ward, Peter; Kirschvink, Joe (2014). Una nueva historia de la vida: los nuevos y radicales descubrimientos sobre los orígenes y la evolución de la vida en la Tierra. EE. UU.: Bloomsbury. págs. 55–60. ISBN978-1608199075. Recuperado el 6 de julio de 2016 .
^ Zimmer, Carl (26 de junio de 2004). "¿Qué había antes del ADN?". Discover . ISSN 0274-7529.
^ Zimmer, Carl (12 de septiembre de 2013). "Una posibilidad lejana para el origen de la vida". The New York Times . Consultado el 1 de julio de 2016 .
^ Boyd, Robert S. (11 de noviembre de 2002). "¿HAY ALGUNA VEZ ALLÁ? Los entornos terrestres extremos ponen a prueba las ideas astrobiológicas". Philadelphia Inquirer . Archivado desde el original el 17 de agosto de 2016. Consultado el 6 de julio de 2016 .
^ Greenwood, Veronique (9 de noviembre de 2009). "Lo que la vida deja atrás de lo que sabemos: la búsqueda de vida más allá de nuestro pálido punto azul está plagada de esperanzas frustradas. ¿Se aplicarán las huellas químicas y minerales de los organismos terrestres a otros mundos?". Seed Magazine . Archivado desde el original el 15 de noviembre de 2009. Consultado el 6 de julio de 2016 .{{cite journal}}: CS1 maint: URL no apta ( enlace )
^ Benner, Steven A.; Hutter, Daniel (1 de febrero de 2002). "Fosfatos, ADN y la búsqueda de vida no terrestre: un modelo de segunda generación para moléculas genéticas". Química bioorgánica . 30 (1): 62–80. doi :10.1006/bioo.2001.1232. PMID 11955003.
^ Benner, Steven A. (27 de febrero de 2023). "Replanteamiento de los ácidos nucleicos desde sus orígenes hasta sus aplicaciones". Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences . 378 (1871). doi :10.1098/rstb.2022.0027. ISSN 0962-8436. PMC 9835595 . PMID 36633284.
^ Špaček, Jan; Benner, Steven A. (1 de octubre de 2022). "Buscador de vida agnóstico (ALF) para el cribado a gran escala de vida marciana durante el reabastecimiento in situ". Astrobiología . 22 (10): 1255–1263. Código Bibliográfico :2022AsBio..22.1255S. doi :10.1089/ast.2021.0070. ISSN 1531-1074. PMID 35796703.