Sincitina-2

ERVFRD-1
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	1 año y 4 meses
Identificadores
Alias	ERVFRD-1 , ERVFRDE1, GLLL6191, HERV-FRD, HERV-W/FRD, UNQ6191, envFRD, miembro 1 del grupo FRD de retrovirus endógenos, miembro 1 del grupo FRD de retrovirus endógenos, envoltura
Identificaciones externas	OMIM : 610524; MGI : 3045308; HomoloGene : 86779; Tarjetas genéticas : ERVFRD-1; OMA :ERVFRD-1 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 6 (humano)
Fin	11.111.725 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 14 (ratón)
Fin	69.531.748 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	placenta; ; tendón del bíceps braquial; ; epitelio pigmentario de la retina; ; vesícula biliar; ; corteza suprarrenal derecha; ; fondo de ojo; ; glándula suprarrenal izquierda; ; corteza suprarrenal izquierda; ; tejido muscular liso; ; vejiga urinaria;
	Top expresado en
	placenta; ; corion; ; ovario; ; yeyuno;
	Más datos de expresión de referencia
	n / A
Ortólogos
	405754
	239167
	ENSG00000244476
	ENSMUSG00000047977
	P60508
	Q8BI41
	Número nuevo_207582
	Número nuevo_173420
	NP_997465
	Número de serie 775596
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Proteína que se encuentra en los humanos

La sincitina-2, también conocida como miembro 1 del grupo de retrovirus endógenos FRD, es una proteína que en los humanos está codificada por el gen ERVFRD-1 . ^[5] Esta proteína juega un papel clave en la implantación de embriones humanos en el útero. ^[6]

Este gen se conserva en todos los primates y se estima que tiene una edad de 45 millones de años. El receptor de esta proteína env fusogénica es MFSD2 . Las sincitinas de ratón no son ortólogos verdaderos. ^[7]

El virus, junto con algunas inserciones muy similares, pertenece a un grupo de ERV de clase I similares a Gammaretrovirus . Se encuentran ERV similares en artiodáctilos , resultado de un evento de integración independiente. ^[8] Una nomenclatura propuesta sugiere colocar todos esos elementos de "clase I" en un taxón a nivel de género separado de Gammaretrovirus . ^[9]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000244476 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000047977 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
^ "Entrez Gene: poliproteína Env ancestral del provirus HERV-FRD HERV-FRD".
^ Vargas A, Moreau J, Landry S, LeBellego F, Toufaily C, Rassart E, Lafond J, Barbeau B (2009). "La sincitina-2 desempeña un papel importante en la fusión de células del trofoblasto humano". Revista de Biología Molecular . 392 (2): 301–18. doi :10.1016/j.jmb.2009.07.025. PMID 19616006.
^ Lavialle C, Cornelis G, Dupressoir A, Esnault C, Heidmann O, Vernochet C, Heidmann T (septiembre de 2013). "Paleovirología de las 'sincitinas', genes env retrovirales exaptados para un papel en la placentación". Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences . 368 (1626): 20120507. doi :10.1098/rstb.2012.0507. PMC 3758191 . PMID 23938756.
^ Vargiu, L; Rodríguez-Tomé, P; Sperber, VAMOS; Cadeddu, M; Grandi, N; Blikstad, V; Tramontano, E; Blomberg, J (22 de enero de 2016). "Clasificación y caracterización de retrovirus endógenos humanos; las formas en mosaico son comunes". Retrovirología . 13 : 7. doi : 10.1186/s12977-015-0232-y . PMC 4724089 . PMID 26800882.
^ Gifford, RJ; Blomberg, J; Coffin, JM; Fan, H; Heidmann, T; Mayer, J; Stoye, J; Tristem, M; Johnson, WE (28 de agosto de 2018). "Nomenclatura para loci de retrovirus endógenos (ERV)". Retrovirology . 15 (1): 59. doi : 10.1186/s12977-018-0442-1 . PMC 6114882 . PMID 30153831.

Lectura adicional

de Parseval N, Lazar V, Casella JF, Benit L, Heidmann T (octubre de 2003). "Estudio de genes humanos de origen retroviral: identificación y transcriptoma de los genes con capacidad codificante para proteínas de envoltura completas". Journal of Virology . 77 (19): 10414–22. doi :10.1128/JVI.77.19.10414-10422.2003. PMC 228468 . PMID 12970426.
Blaise S, de Parseval N, Bénit L, Heidmann T (octubre de 2003). "La detección en todo el genoma de las envolturas de retrovirus endógenos humanos fusogénicos identifica la sincitina 2, un gen conservado en la evolución de los primates". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 100 (22): 13013–8. Bibcode :2003PNAS..10013013B. doi : 10.1073/pnas.2132646100 . PMC 240736 . PMID 14557543.
Blaise S, Ruggieri A, Dewannieux M, Cosset FL, Heidmann T (enero de 2004). "Identificación de una proteína de la envoltura de la familia FRD de retrovirus endógenos humanos (HERV-FRD) que confiere infectividad y conservación funcional entre los simios". Revista de Virología . 78 (2): 1050–4. doi :10.1128/JVI.78.2.1050-1054.2004. PMC 368808 . PMID 14694139.
Renard M, Varela PF, Letzelter C, Duquerroy S, Rey FA, Heidmann T (octubre de 2005). "Estructura cristalina de un dominio fundamental de la sincitina-2 humana, un gen de envoltura fusogénica de retrovirus endógeno de 40 millones de años capturado por primates". Journal of Molecular Biology . 352 (5): 1029–34. doi :10.1016/j.jmb.2005.07.058. PMID 16140326.
Malassiné A, Blaise S, Handschuh K, Lalucque H, Dupressoir A, Evain-Brion D, Heidmann T (2007). "La expresión de la glicoproteína fusogénica HERV-FRD Env (sincitina 2) en la placenta humana está restringida a las células citotrofoblásticas vellosas". Placenta . 28 (2–3): 185–91. doi :10.1016/j.placenta.2006.03.001. PMID 16714059.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000244476 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000047977 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .

[entrez-5] "Entrez Gene: poliproteína Env ancestral del provirus HERV-FRD HERV-FRD".

[pmid19616006-6] Vargas A, Moreau J, Landry S, LeBellego F, Toufaily C, Rassart E, Lafond J, Barbeau B (2009). "La sincitina-2 desempeña un papel importante en la fusión de células del trofoblasto humano". Revista de Biología Molecular . 392 (2): 301–18. doi :10.1016/j.jmb.2009.07.025. PMID 19616006.

[pmid23938756-7] Lavialle C, Cornelis G, Dupressoir A, Esnault C, Heidmann O, Vernochet C, Heidmann T (septiembre de 2013). "Paleovirología de las 'sincitinas', genes env retrovirales exaptados para un papel en la placentación". Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological Sciences . 368 (1626): 20120507. doi :10.1098/rstb.2012.0507. PMC 3758191 . PMID 23938756.

[pmid26800882-8] Vargiu, L; Rodríguez-Tomé, P; Sperber, VAMOS; Cadeddu, M; Grandi, N; Blikstad, V; Tramontano, E; Blomberg, J (22 de enero de 2016). "Clasificación y caracterización de retrovirus endógenos humanos; las formas en mosaico son comunes". Retrovirología . 13 : 7. doi : 10.1186/s12977-015-0232-y . PMC 4724089 . PMID 26800882.

[9] Gifford, RJ; Blomberg, J; Coffin, JM; Fan, H; Heidmann, T; Mayer, J; Stoye, J; Tristem, M; Johnson, WE (28 de agosto de 2018). "Nomenclatura para loci de retrovirus endógenos (ERV)". Retrovirology . 15 (1): 59. doi : 10.1186/s12977-018-0442-1 . PMC 6114882 . PMID 30153831.