Selección de fondo

Fenómeno que induce pérdida de diversidad genética

La selección de fondo describe la pérdida de diversidad genética en un locus debido a la selección negativa contra alelos deletéreos con los que está en desequilibrio de ligamiento . [1] El nombre enfatiza el hecho de que el fondo genético, o entorno genómico, de una mutación tiene un impacto significativo en si se conservará o se perderá de una población. La selección de fondo contradice el supuesto de la teoría neutral de la evolución molecular de que la fijación o pérdida de un alelo neutral puede describirse mediante modelos de un locus de deriva genética , independientemente de otros loci. Además de reducir la diversidad de nucleótidos neutrales , la selección de fondo reduce la probabilidad de fijación de mutaciones beneficiosas y aumenta la probabilidad de fijación de mutaciones deletéreas.

Efecto sobre la diversidad neutral

El grado en el que la diversidad de nucleótidos neutrales , que se cuantifica como el " tamaño efectivo de la población ", se reduce debido a la selección de fondo, depende de si los sitios neutrales están vinculados a sitios deletéreos. [2] Para los sitios no vinculados, se reduce por exp(-8Ush), donde U es la tasa de mutación deletérea de todo el genoma , s es el coeficiente de selección de mutaciones deletéreas y h es el coeficiente de dominancia . [1] [3] Esto corresponde a la probabilidad de que un individuo no pueda contribuir apreciablemente a la siguiente generación porque su carga genética es demasiado alta. La reducción es menor para s grandes porque las mutaciones deletéreas se eliminan más rápidamente de la población. Para los sitios vinculados, la diversidad se reduce por exp(-u/r), donde u/r es la relación entre la mutación deletérea y la recombinación dentro de una ventana genómica que rodea al alelo neutral de interés. [4] [5] Esto corresponde a la probabilidad de que una copia del gen pueda escapar a través de la recombinación de alelos deletéreos cercanos. La selección de fondo en sitios vinculados domina cuando U<1, mientras que la selección de fondo en sitios no vinculados domina cuando U>1. [2]

La selección de fondo contribuye a una explicación selectiva de la correlación positiva entre las tasas locales de recombinación y el polimorfismo en todo el genoma. En áreas de alta recombinación, es más probable que las nuevas mutaciones "escapen" de los efectos de la selección cercana y se mantengan en la población. [6] La misma correlación también se produce por el autoestopismo genético . Las dos teorías son más fáciles de distinguir en regiones de baja recombinación. [7]

No tener en cuenta la selección de antecedentes puede llevar a errores en la inferencia de la historia demográfica de las poblaciones. [8] [9] [10]

Implicaciones para las poblaciones asexuales

La selección de antecedentes en poblaciones asexuales produce el trinquete de Müller , la acumulación de mutaciones deletéreas irreversibles. La selección de antecedentes reduce el tamaño efectivo de la población para representar solo a aquellos individuos con la menor cantidad de mutaciones y, a veces, este tamaño cae estocásticamente a cero, lo que produce un clic del trinquete. [4]

Referencias

  1. ^ ab Charlesworth, B., MT Morgan y D. Charlesworth. 1993. El efecto de las mutaciones deletéreas sobre la variación molecular neutral. Genética. 134: 1289-1303.
  2. ^ ab Matheson, Joseph; Masel, Joanna (2 de marzo de 2024). "La selección de antecedentes a partir de sitios no vinculados provoca una evolución no independiente de mutaciones deletéreas". Genome Biology and Evolution . 16 (3). doi :10.1093/gbe/evae050. PMC  10972689 . PMID  38482769.
  3. ^ Charlesworth, D., B. Charlesworth y MT Morgan. 1995. El patrón de variación molecular neutral según el modelo de selección de fondo. Genética. 141: 1619-1632.
  4. ^ ab Charlesworth, Brian. 2012. Los efectos de las mutaciones deletéreas en la evolución en sitios ligados. Genética. 190: 5-22.
  5. ^ Hudson, Richard R. y Norman L. Kaplan. 1995. Selección de fondo perjudicial con recombinación. Genética. 141: 1605-1617.
  6. ^ Lewontin, RC 1974. La base genética del cambio evolutivo. Columbia Univ. Press, Nueva York, NY.
  7. ^ Innan, Hideki y Wolfgang Stephan. 2003. Distinguiendo los modelos de autostop y selección de antecedentes. Genética. 165: 2307-2312.
  8. ^ Ewing, Gregory B.; Jensen, Jeffrey D. (enero de 2016). "Las consecuencias de no tener en cuenta la selección de antecedentes en la inferencia demográfica". Ecología molecular . 25 (1): 135–141. Bibcode :2016MolEc..25..135E. doi :10.1111/mec.13390. PMID  26394805.
  9. ^ Pouyet, Fanny; Aeschbacher, Simon; Thiéry, Alexandre; Excoffier, Laurent (23 de agosto de 2018). "La selección de antecedentes y la conversión genética sesgada afectan a más del 95 % del genoma humano y sesgan las inferencias demográficas". eLife . 7 . doi : 10.7554/eLife.36317 . PMC 6177262 . 
  10. ^ Johri, Parul; Riall, Kellen; Becher, Hannes; Excoffier, Laurent; Charlesworth, Brian; Jensen, Jeffrey D. (25 de junio de 2021). "El impacto de la purificación y la selección de antecedentes en la inferencia de la historia de la población: problemas y perspectivas". Biología molecular y evolución . 38 (7): 2986–3003. doi :10.1093/molbev/msab050. PMC 8233493 . PMID  33591322. 
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