SATB2
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| Identificadores | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alias | SATB2 , GLSS, SATB homeobox 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identificaciones externas | OMIM : 608148; MGI : 2679336; HomoloGene : 32249; Tarjetas genéticas : SATB2; OMA :SATB2 - ortólogos | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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La proteína de unión a secuencia rica en AT especial 2 (SATB2), también conocida como proteína de unión al ADN SATB2, es una proteína que en los seres humanos está codificada por el gen SATB2 . [5] SATB2 es una proteína de unión al ADN que se une específicamente a las regiones de unión de la matriz nuclear y está involucrada en la regulación transcripcional y la remodelación de la cromatina . [6] SATB2 muestra un modo de expresión restringido [1] y se expresa en ciertos núcleos celulares [2]. La proteína SATB2 se expresa principalmente en las células epiteliales del colon y el recto, seguidas de los núcleos de las neuronas en el cerebro. [7]
Función
Con una prevalencia mundial promedio de 1/800 nacidos vivos, las hendiduras orales son uno de los defectos congénitos más comunes. [8] Aunque más de 300 síndromes de malformación pueden incluir una hendidura oral, las formas no sindrómicas representan alrededor del 70% de los casos con labio leporino con o sin paladar hendido (CL/P) y aproximadamente el 50% de los casos con paladar hendido (CP) solamente. Las hendiduras orales no sindrómicas se consideran "complejas" o "multifactoriales" en el sentido de que tanto los genes como los factores ambientales contribuyen a la etiología. La investigación actual sugiere que es probable que varios genes controlen el riesgo, así como factores ambientales como el tabaquismo materno . [9]
Los estudios de resecuenciación para identificar mutaciones específicas sugieren que varios genes diferentes pueden controlar el riesgo de hendiduras orales, y se han encontrado muchas variantes o mutaciones distintas en genes aparentemente causales que reflejan un alto grado de heterogeneidad alélica. Aunque la mayoría de estas mutaciones son extremadamente raras y a menudo muestran una penetración incompleta (es decir, un padre no afectado u otros familiares también pueden ser portadores de la mutación), combinadas pueden representar hasta el 5% de las hendiduras orales no sindrómicas. [9]
Se ha descubierto que las mutaciones en el gen SATB2 causan paladares hendidos aislados. [10] Es probable que SATB2 también influya en el desarrollo cerebral. Esto es coherente con los estudios realizados en ratones que muestran que SATB2 es necesario para el establecimiento adecuado de conexiones neuronales corticales en todo el cuerpo calloso , a pesar del cuerpo calloso aparentemente normal en ratones knockout heterocigotos . [11]
Estructura
SATB2 es una proteína humana que contiene un homeodominio de 733 aminoácidos con un peso molecular de 82,5 kDa codificada por el gen SATB2 en 2q33. La proteína contiene dos regiones degeneradas de homeodominio conocidas como dominios CUT (aminoácidos 352-437 y 482-560) y un homeodominio clásico (aminoácidos 614-677). Existe un grado extraordinariamente alto de conservación de la secuencia, con solo tres sustituciones de aminoácidos predichas en la proteína de 733 residuos, siendo I481V, A590T e I730T las diferencias de aminoácidos entre la proteína humana y la de ratón.
Importancia clínica
Se ha implicado al SATB2 como causante del paladar hendido o alto en individuos con síndrome de microdeleción 2q32q33. [11]
Se encontró que SATB2 estaba interrumpido en dos casos no relacionados con translocaciones cromosómicas aparentemente equilibradas de novo asociadas con paladar hendido y secuencia de Pierre Robin . [12]
El papel de SATB2 en el desarrollo de los dientes y la mandíbula está respaldado por la identificación de una mutación de novo de SATB2 en un hombre con discapacidades intelectuales profundas y anomalías de la mandíbula y los dientes y una translocación que interrumpe SATB2 en un individuo con secuencia de Robin. Además, los modelos de ratón han demostrado que la haploinsuficiencia de SATB2 da lugar a defectos craneofaciales que fenocopian los causados por la deleción 2q32q33 en humanos; además, la pérdida funcional completa de SATB2 amplifica estos defectos. [11]
La expresión de SATB2 es altamente específica para el cáncer en el tracto gastrointestinal inferior y se la ha implicado como un biomarcador del cáncer colorrectal . [13] [14]
Referencias
- ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000119042 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000038331 – Ensembl , mayo de 2017
- ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ^ Kikuno R, Nagase T, Ishikawa K, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, et al. (junio de 1999). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XIV. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro". DNA Research . 6 (3): 197–205. doi : 10.1093/dnares/6.3.197 . PMID 10470851.
- ^ "Entrez Gene: SATB homeobox 2".
- ^ Uhlén M, Fagerberg L, Hallström BM, Lindskog C, Oksvold P, Mardinoglu A, et al. (enero de 2015). "Proteómica. Mapa tisular del proteoma humano". Science . 347 (6220): 1260419. doi :10.1126/science.1260419. PMID 25613900. S2CID 802377.
- ^ Jugessur A, Shi M, Gjessing HK, Lie RT, Wilcox AJ, Weinberg CR, et al. (julio de 2010). "Genes maternos y hendiduras faciales en la descendencia: una búsqueda exhaustiva de asociaciones genéticas en dos estudios de hendiduras basados en la población de Escandinavia". PLOS ONE . 5 (7): e11493. Bibcode :2010PLoSO...511493J. doi : 10.1371/journal.pone.0011493 . PMC 2901336 . PMID 20634891.
- ^ ab Beaty TH, Hetmanski JB, Fallin MD, Park JW, Sull JW, McIntosh I, et al. (noviembre de 2006). "Análisis de genes candidatos en el cromosoma 2 en tríos de padres y casos de fisura oral de tres poblaciones". Human Genetics . 120 (4): 501–518. doi :10.1007/s00439-006-0235-9. PMID 16953426. S2CID 7836461.
- ^ Dixon MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (marzo de 2011). "Labio leporino y paladar hendido: comprensión de las influencias genéticas y ambientales". Nature Reviews. Genética . 12 (3): 167–178. doi :10.1038/nrg2933. PMC 3086810 . PMID 21331089.
- ^ abc Rosenfeld JA, Ballif BC, Lucas A, Spence EJ, Powell C, Aylsworth AS, et al. (agosto de 2009). "Pequeñas deleciones de SATB2 causan algunas de las características clínicas del síndrome de microdeleción 2q33.1". PLOS ONE . 4 (8): e6568. Bibcode :2009PLoSO...4.6568R. doi : 10.1371/journal.pone.0006568 . PMC 2719055 . PMID 19668335.
- ^ FitzPatrick DR, Carr IM, McLaren L, Leek JP, Wightman P, Williamson K, et al. (octubre de 2003). "Identificación de SATB2 como el gen del paladar hendido en 2q32-q33". Genética molecular humana . 12 (19): 2491–2501. doi : 10.1093/hmg/ddg248 . PMID 12915443.
- ^ Magnusson K, de Wit M, Brennan DJ, Johnson LB, McGee SF, Lundberg E, et al. (julio de 2011). "SATB2 en combinación con citoqueratina 20 identifica más del 95 % de todos los carcinomas colorrectales". The American Journal of Surgical Pathology . 35 (7): 937–948. doi :10.1097/pas.0b013e31821c3dae. PMID 21677534. S2CID 33883685.
- ^ Dragomir A, de Wit M, Johansson C, Uhlen M, Pontén F (mayo de 2014). "El papel de SATB2 como marcador diagnóstico de tumores de origen colorrectal: resultados de un estudio clínico prospectivo basado en patología". American Journal of Clinical Pathology . 141 (5): 630–638. doi :10.1309/ajcpww2urz9jkqju. PMID 24713733. S2CID 4564790.
Lectura adicional
- Dobreva G, Dambacher J, Grosschedl R (diciembre de 2003). "La modificación SUMO de una nueva proteína de unión a MAR, SATB2, modula la expresión del gen mu de inmunoglobulina". Genes & Development . 17 (24): 3048–3061. doi :10.1101/gad.1153003. PMC 305257 . PMID 14701874.
- Dobreva G, Chahrour M, Dautzenberg M, Chirivella L, Kanzler B, Fariñas I, et al. (junio de 2006). "SATB2 es un determinante multifuncional de la formación de patrones craneofaciales y la diferenciación de osteoblastos". Cell . 125 (5): 971–986. doi : 10.1016/j.cell.2006.05.012 . PMID 16751105. S2CID 2882724.
- Alcamo EA, Chirivella L, Dautzenberg M, Dobreva G, Fariñas I, Grosschedl R, et al. (febrero de 2008). "Satb2 regula la identidad de las neuronas de proyección callosa en la corteza cerebral en desarrollo". Neurona . 57 (3): 364–377. doi : 10.1016/j.neuron.2007.12.012 . PMID 18255030. S2CID 6716396.
- Beaty TH, Hetmanski JB, Fallin MD, Park JW, Sull JW, McIntosh I, et al. (noviembre de 2006). "Análisis de genes candidatos en el cromosoma 2 en tríos de padres y casos de fisura oral de tres poblaciones". Human Genetics . 120 (4): 501–518. doi :10.1007/s00439-006-0235-9. PMID 16953426. S2CID 7836461.
- Machado RD, Pauciulo MW, Fretwell N, Veal C, Thomson JR, Vilariño Güell C, et al. (septiembre de 2000). "Un mapa físico y de transcripción basado en el refinamiento del intervalo crítico para PPH1, un gen para la hipertensión pulmonar primaria familiar. El Consorcio Internacional PPH". Genomics . 68 (2): 220–228. doi :10.1006/geno.2000.6291. PMID 10964520.
- Jugessur A, Shi M, Gjessing HK, Lie RT, Wilcox AJ, Weinberg CR, et al. (julio de 2010). "Genes maternos y hendiduras faciales en la descendencia: una búsqueda exhaustiva de asociaciones genéticas en dos estudios de hendiduras basados en la población de Escandinavia". PLOS ONE . 5 (7): e11493. Bibcode :2010PLoSO...511493J. doi : 10.1371/journal.pone.0011493 . PMC 2901336 . PMID 20634891.
- Carter TC, Molloy AM, Pangilinan F, Troendle JF, Kirke PN, Conley MR, et al. (febrero de 2010). "Prueba de asociaciones informadas de factores de riesgo genéticos para las hendiduras orales en una gran población de estudio irlandesa". Investigación sobre defectos de nacimiento. Parte A, Teratología clínica y molecular . 88 (2): 84–93. doi :10.1002/bdra.20639. PMC 3503531. PMID 19937600 .
- Rosenfeld JA, Ballif BC, Lucas A, Spence EJ, Powell C, Aylsworth AS, et al. (agosto de 2009). "Pequeñas deleciones de SATB2 causan algunas de las características clínicas del síndrome de microdeleción 2q33.1". PLOS ONE . 4 (8): e6568. Bibcode :2009PLoSO...4.6568R. doi : 10.1371/journal.pone.0006568 . PMC 2719055 . PMID 19668335.
- Vieira AR, Avila JR, Daack-Hirsch S, Dragan E, Félix TM, Rahimov F, et al. (diciembre de 2005). "Secuenciación médica de genes candidatos para labio leporino y paladar hendido no sindrómico". PLOS Genetics . 1 (6): e64. doi : 10.1371/journal.pgen.0010064 . PMC 1298935 . PMID 16327884.
Enlaces externos
- Ubicación del gen humano SATB2 en el navegador de genoma de la UCSC .
- Detalles del gen humano SATB2 en el navegador del genoma de la UCSC .
Registro de casos SATB2 http://satb2gene.com
Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que se encuentra en el dominio público .