ARNasa H1

ARNasa H1
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	2QK9, 2QKB, 2QKK, 3BSU
Identificadores
Alias	RNASEH1 , ARN H1, RNH1, PEOB2, ribonucleasa H1
Identificaciones externas	OMIM : 604123; MGI : 1335073; HomoloGene : 2202; Tarjetas genéticas : RNASEH1; OMA :RNASEH1 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 2 (humano)
Fin	3.558.333 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 12 (ratón)
Fin	28.709.588 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	ovocito secundario; ; célula endotelial; ; giro temporal medio; ; pezón; ; pleura visceral; ; pleura parietal; ; Tejido muscular esquelético del bíceps braquial; ; tibia; ; Área de Brodmann 23; ; gónada;
	Top expresado en
	Célula de Paneth; ; ovocito primario; ; sáculo; ; placoda ótica; ; vesícula ótica; ; ovocito secundario; ; capa neural de la retina; ; veta primitiva; ; cigoto; ; mórula;
	Más datos de expresión de referencia
	n / A
Ontología genética
Función molecular	actividad nucleasa; actividad endonucleasa; Actividad de ribonucleasa híbrida ARN-ADN; actividad de ribonucleasa; actividad hidrolasa; unión de iones de magnesio; unión de iones metálicos; Unión de ARN; unión de ácidos nucleicos;
Componente celular	citoplasma; núcleo;
Proceso biológico	hidrólisis del enlace fosfodiéster del ácido nucleico; Proceso catabólico del ARN; Replicación del ADN, eliminación del cebador del ARN; Hidrólisis del enlace fosfodiéster del ARN; Hidrólisis del enlace fosfodiéster del ARN, endonucleolítica;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	246243
	19819
	ENSG00000171865
	ENSMUSG00000020630
	O60930
	E9QLN8
NM_001286834 ; NM_001286837 ; NM_002936 ; NM_001378271 ; NM_001378272;
	Número de modelo_001378273
	Número de serie 001286865 Número de ; serie 011275
NP_001273763 ; NP_001273766 ; NP_002927 ; NP_001365200 ; NP_001365201;
	Número de serie 001365202
	NP_001273794 ; NP_035405
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La ribonucleasa H1, también conocida como ARNasa H1 , es una enzima que en los humanos está codificada por el gen RNASEH1 . ^[5]^[6]^{[7] La ARNasa H1 es una}endonucleasa no específica y cataliza la escisión del ARN a través de un mecanismo hidrolítico.

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000171865 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020630 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
^ "Gen Entrez: ribonucleasa H1".
^ ten Asbroek AL, van Groenigen M, Jakobs ME, Koevoets C, Janssen B, Baas F (junio de 2002). "La ribonucleasa H1 se localiza en el cromosoma 2 y tiene al menos tres loci pseudogénicos en el genoma humano". Genomics . 79 (6): 818–23. doi :10.1006/geno.2002.6776. PMID 12036296.
^ Nowotny M, Gaidamakov SA, Ghirlando R, Cerritelli SM, Crouch RJ, Yang W (octubre de 2007). "Estructura de la ARNasa H1 humana complejada con un híbrido ARN/ADN: conocimiento de la transcripción inversa del VIH". Mol. Cell . 28 (2): 264–76. doi : 10.1016/j.molcel.2007.08.015 . PMID 17964265.

Lectura adicional

Nowotny M, Cerritelli SM, Ghirlando R, et al. (2008). "Reconocimiento específico de híbridos ARN/ADN y mejora de la actividad de la ARNasa H1 humana mediante HBD". EMBO J . 27 (7): 1172–81. doi :10.1038/emboj.2008.44. PMC 2323259 . PMID 18337749.
Lima WF, Wu H, Nichols JG, et al. (2003). "La ARNasa humana H1 utiliza un triptófano y dos lisinas para posicionar la enzima en el extremo 3'-ADN/5'-ARN del sustrato heterodúplex". J. Biol. Chem . 278 (50): 49860–7. doi : 10.1074/jbc.M306543200 . PMID 14506260.
Lima WF, Rose JB, Nichols JG, et al. (2007). "La influencia posicional de la geometría helicoidal del sustrato heterodúplex en la catálisis de la ARNasa H1 humana". Mol. Pharmacol . 71 (1): 73–82. doi :10.1124/mol.106.025429. PMID 17028157. S2CID 27765676.
Lima WF, Nichols JG, Wu H, et al. (2004). "Requerimientos estructurales en el sitio catalítico del sustrato heterodúplex para la catálisis de la ARNasa H1 humana". J. Biol. Chem . 279 (35): 36317–26. doi : 10.1074/jbc.M405035200 . PMID 15205459.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, et al. (2005). "Secuencia de señal y trampa de palabras clave in silico para la selección de ADNc humanos de longitud completa que codifican proteínas de secreción o de membrana a partir de bibliotecas de ADNc con oligo-captura". DNA Res . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743.
Wu H, Lima WF, Crooke ST (1999). "Propiedades de la ARNasa humana H1 clonada y expresada". J. Biol. Chem . 274 (40): 28270–8. doi : 10.1074/jbc.274.40.28270 . PMID 10497183.
Frank P, Braunshofer-Reiter C, Pöltl A, Holzmann K (1998). "Clonación, localización subcelular y expresión funcional de la ARNasa HII humana". Biol. Chem . 379 (12): 1407–12. doi :10.1515/bchm.1998.379.12.1407. PMID 9894807. S2CID 19692186.
Wu H, Lima WF, Zhang H, et al. (2004). "Determinación del papel de la ARNasa H1 humana en la farmacología de fármacos antisentido similares al ADN". J. Biol. Chem . 279 (17): 17181–9. doi : 10.1074/jbc.M311683200 . PMID 14960586.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS, et al. (2005). "Generación y anotación de las secuencias de ADN de los cromosomas humanos 2 y 4". Nature . 434 (7034): 724–31. Bibcode :2005Natur.434..724H. doi : 10.1038/nature03466 . PMID 15815621.
Lima WF, Wu H, Nichols JG, et al. (2003). "La actividad de la ARNasa H1 humana está regulada por un interruptor redox único formado entre cisteínas adyacentes". J. Biol. Chem . 278 (17): 14906–12. doi : 10.1074/jbc.M211279200 . PMID 12473655.
ten Asbroek AL, van Groenigen M, Nooij M, Baas F (2002). "La participación de las ribonucleasas humanas H1 y H2 en la variación de la respuesta de las células a los oligonucleótidos de fosforotioato antisentido". Eur. J. Biochem . 269 (2): 583–92. doi : 10.1046/j.0014-2956.2001.02686.x . PMID 11856317.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928 . PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID: 14702039.
Cerritelli SM, Crouch RJ (1998). "Clonación, expresión y mapeo de ribonucleasas H de humanos y ratones relacionadas con la ARNasa HI bacteriana". Genomics . 53 (3): 300–7. doi :10.1006/geno.1998.5497. PMID 9799596.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
Cerritelli SM, Frolova EG, Feng C, et al. (2003). "La incapacidad de producir ADN mitocondrial da como resultado letalidad embrionaria en ratones sin Rnaseh1". Mol. Cell . 11 (3): 807–15. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00088-1 . PMID 12667461.
Lima WF, Rose JB, Nichols JG, et al. (2007). "La ARNasa humana H1 discrimina entre variaciones sutiles en la estructura del sustrato heterodúplex". Mol. Pharmacol . 71 (1): 83–91. doi :10.1124/mol.106.025015. PMID 17028158. S2CID 24995048.

Enlaces externos

Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : O60930 (Ribonucleasa humana H1 (RNASEH1)) en el PDBe-KB .

Este artículo sobre un gen del cromosoma humano 2 es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000171865 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020630 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .

[entrez-5] "Gen Entrez: ribonucleasa H1".

[pmid12036296-6] ten Asbroek AL, van Groenigen M, Jakobs ME, Koevoets C, Janssen B, Baas F (junio de 2002). "La ribonucleasa H1 se localiza en el cromosoma 2 y tiene al menos tres loci pseudogénicos en el genoma humano". Genomics . 79 (6): 818–23. doi :10.1006/geno.2002.6776. PMID 12036296.

[pmid17964265-7] Nowotny M, Gaidamakov SA, Ghirlando R, Cerritelli SM, Crouch RJ, Yang W (octubre de 2007). "Estructura de la ARNasa H1 humana complejada con un híbrido ARN/ADN: conocimiento de la transcripción inversa del VIH". Mol. Cell . 28 (2): 264–76. doi : 10.1016/j.molcel.2007.08.015 . PMID 17964265.