Relación conformación-actividad
En bioquímica , la relación conformación-actividad es la relación entre la actividad biológica y la estructura química o los cambios conformacionales de una biomolécula . Esta terminología enfatiza la importancia de los cambios conformacionales dinámicos para la función biológica, en lugar de la importancia de la estructura tridimensional estática utilizada en el análisis de las relaciones estructura-actividad . [1]
Los cambios conformacionales suelen producirse durante la asociación intermolecular , como la interacción proteína-proteína o la unión proteína-ligando . Un miembro de la unión cambia la conformación de una biomolécula (por ejemplo, una proteína) para habilitar o deshabilitar su actividad bioquímica.
Los métodos para el análisis de la relación entre la conformación y la actividad varían desde in silico [2] o utilizando métodos experimentales como la cristalografía de rayos X y la RMN, donde la conformación antes y después de la actividad se puede comparar estáticamente, o utilizando métodos dinámicos como la resonancia plasmónica de superficie multiparamétrica , la interferometría de polarización dual o el dicroísmo circular , donde se puede cuantificar la cinética y el grado de cambio conformacional.
Técnicas experimentales
Estático
Las técnicas experimentales estáticas incluyen la cristalografía de rayos X y la RMN .
Dinámica
Las técnicas experimentales dinámicas incluyen resonancia plasmónica de superficie multiparamétrica , interferometría de polarización dual y dicroísmo circular .
Referencias
- ^ Taylor, RE; Chen, Y; Beatty, A; Myles, DC; Zhou, Y (2003). "Relaciones conformación-actividad en productos naturales de policétidos: una nueva perspectiva sobre el diseño racional de análogos de epotilona". Journal of the American Chemical Society . 125 (1): 26–7. doi :10.1021/ja028196l. PMID 12515494.
- ^ Carotenuto, Alfonso; D'ursi, Anna María; Mulinacci, Bárbara; Paolini, Ilaria; Lolli, Francesco; Papini, Anna María; Novellino, Ettore; Rovero, Paolo (2006). "Relación conformación-actividad de glicopéptidos diseñados como sondas sintéticas para la detección de autoanticuerpos, biomarcadores de esclerosis múltiple". Revista de Química Medicinal . 49 (17): 5072–9. doi :10.1021/jm060117j. PMID 16913697.
