Proteína F-box

Proteína que contiene al menos un dominio F-box
Dominio enlazador de F-box
Estructura del dominio de enlace LRR de Skp2 en el complejo Skp1-Skp2. [1]
Identificadores
SímboloCaja F
PfamPF00646
Clan PfamCL0271
InterprofesionalIPR001810
ELEGANTESM00256
PROSITIOPS50181
SCOP21fs2 / ALCANCE / SUPFAM
Membranoma630
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura

Las proteínas F-box son proteínas que contienen al menos un dominio F-box. La primera proteína F-box identificada es uno de los tres componentes del complejo SCF , que media la ubiquitinación de proteínas destinadas a la degradación por el proteasoma 26S .

Componentes principales

El dominio F-box es un motivo estructural proteico de unos 50 aminoácidos que media las interacciones proteína-proteína . Tiene una secuencia de consenso y varía en pocas posiciones. Se identificó por primera vez en la ciclina F. [2] El motivo F-box de Skp2, que consta de tres hélices alfa, interactúa directamente con la proteína SCF Skp1 . [3] Los dominios F-box existen comúnmente en proteínas en el cáncer con otros motivos de interacción proteína-proteína como repeticiones ricas en leucina (ilustradas en la Figura) y repeticiones WD , que se cree que median las interacciones con los sustratos de SCF. [4]

Función

Las proteínas F-box también se han asociado con funciones celulares como la transducción de señales y la regulación del ciclo celular . [5] En las plantas, muchas proteínas F-box están representadas en redes genéticas ampliamente reguladas por el silenciamiento genético mediado por microARN a través de la interferencia del ARN . [6] Las proteínas F-box están involucradas en el crecimiento y desarrollo vegetativo y reproductivo de muchas plantas. Por ejemplo, la proteína F-box-FOA1 está involucrada en la señalización del ácido abscísico (ABA) para afectar la germinación de las semillas. [7] ACRE189/ACIF1 puede regular la muerte celular y la defensa cuando el patógeno es reconocido en la planta de tabaco y tomate. [8]

En las células humanas, en condiciones de alto contenido de hierro, dos átomos de hierro estabilizan la F-Box FBXL5 y luego el complejo media la ubiquitinación de IRP2 . [9]

Regulación

Los niveles de proteína F-box pueden regularse mediante diferentes mecanismos. La regulación puede ocurrir a través del proceso de degradación de proteínas y la asociación con el complejo SCF. Por ejemplo, en la levadura, la proteína F-box Met30 puede ser ubiquitinada de una manera dependiente de cullina. [10] [11]

Referencias

  1. ^ Schulman BA, Carrano AC, Jeffrey PD, et al. (noviembre de 2000). "Información sobre las ligasas de ubiquitina SCF a partir de la estructura del complejo Skp1-Skp2". Nature . 408 (6810): 381–6. Bibcode :2000Natur.408..381S. doi :10.1038/35042620. PMID  11099048. S2CID  4300503.
  2. ^ Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ. "SKP1 conecta los reguladores del ciclo celular a la maquinaria de proteólisis de la ubiquitina a través de un nuevo motivo, la F-box". Cell 86 263-74 1996 .
  3. ^ Bai C, Sen P, Hofmann K, Ma L, Goebl M, Harper JW, Elledge SJ (julio de 1996). "SKP1 conecta los reguladores del ciclo celular a la maquinaria de proteólisis de la ubiquitina a través de un motivo novedoso, la F-box". Cell . 86 (2): 263–74. doi :10.1016/S0092-8674(00)80098-7. PMID  8706131.
  4. ^ Kipreos ET, Pagano M (2000). "La familia de proteínas F-box". Genome Biol . 1 (5): REVIEWS3002. doi : 10.1186/gb-2000-1-5-reviews3002 . PMC 138887 . PMID  11178263. 
  5. ^ Craig KL, Tyers M (1999). "La F-box: un nuevo motivo para la proteólisis dependiente de ubiquitina en la regulación del ciclo celular y la transducción de señales". Prog. Biophys. Mol. Biol . 72 (3): 299–328. doi : 10.1016/S0079-6107(99)00010-3 . PMID  10581972.
  6. ^ Jones-Rhoades MW, Bartel DP, Bartel B (2006). "MicroRNAS y sus funciones reguladoras en plantas". Annu Rev Plant Biol . 57 : 19–53. doi :10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218. PMID  16669754.
  7. ^ Peng, Juan; Yu, Dashi; Wang, Liqun; Xie, Minmin; Yuan, Congying; Wang, Yu; Tang, Dongying; Zhao, Xiaoying; Liu, Xuanming (junio de 2012). "Gen FOA1 de Arabidopsis F-box implicado en la señalización de ABA". Ciencias Ciencias de la vida de China . 55 (6): 497–506. doi :10.1007/s11427-012-4332-9. ISSN 1869-1889. PMID 22744179.
  8. ^ Ja, Van Den Burg; Tsitsigiannis, DI; Rowland, O; Lo, J; Rallapalli, G; Maclean, D; Taken, Florida; Jones, JD (2008). "La proteína F-box ACRE189/ACIF1 regula la muerte celular y las respuestas de defensa activadas durante el reconocimiento de patógenos en tabaco y tomate". Célula vegetal . 20 (3): 697.
  9. ^ Moroishi, T; Nishiyama, M; Takeda, Y; Iwai, K; Nakayama, KI (2011). "El eje FBXL5-IRP2 es fundamental para el control del metabolismo del hierro in vivo". Metabolismo celular . 14 (3): 339.
  10. ^ Kaiser, Peter; Su, Ning-Yuan; Yen, James L.; Ouni, Ikram; Flick, Karin (8 de agosto de 2006). "La ligasa de ubiquitina de levadura SCFMet30: conectando las condiciones ambientales e intracelulares con la división celular". División celular . 1 : 16. doi :10.1186/1747-1028-1-16. ISSN  1747-1028.

Lectura adicional

  • Ho M, Tsai P, Chien C (2006). "Proteínas F-box: la clave para la degradación de proteínas". J Biomed Sci . 13 (2): 181–91. doi : 10.1007/s11373-005-9058-2 . PMID  16463014.
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