Proteína de matriz retroviral
Las proteínas de la matriz retroviral son componentes de las cápsides asociadas a la envoltura de los retrovirus . Estas proteínas recubren la superficie interna de las envolturas virales y están asociadas a las membranas virales. [1]
Las proteínas de la matriz se producen como dominios N-terminales de poliproteínas precursoras de Gag . La poliproteína Gag dirige el ensamblaje y la liberación de partículas virales de las células infectadas. La poliproteína Gag tiene tres dominios necesarios para la actividad: un dominio N-terminal de unión a la membrana (M) (que corresponde a la proteína de la matriz) que dirige Gag a la membrana plasmática , un dominio de interacción (I) involucrado en la agregación de Gag y un dominio de ensamblaje tardío (L) que media el proceso de gemación . [2] Durante la maduración viral, la poliproteína Gag es escindida por la proteasa retroviral en varias proteínas estructurales correspondientes, produciendo las proteínas de la matriz (MA), la cápside (CA) y la nucleocápside (NC), y algunos péptidos más pequeños . Las proteínas derivadas de Gag gobiernan todo el ensamblaje y la liberación de las partículas virales, y las proteínas de la matriz desempeñan papeles clave en la estabilidad de Gag, el ensamblaje de la cápside, el transporte y la gemación.
Familias de proteínas de la matriz retroviral
| Mordaza_MA | |||||||||
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 Estructura de la proteína de matriz del virus de la leucemia murina de Moloney | |||||||||
| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | Mordaza_MA | ||||||||
| Pfam | PF01140 | ||||||||
| Clan Pfam | CL0074 | ||||||||
| Interprofesional | IPR000840 | ||||||||
| SCOP2 | 1mn8 / ALCANCE / SUPFAM | ||||||||
| Superfamilia OPM | 42 | ||||||||
| Proteína OPM | 1 minuto y 8 segundos | ||||||||
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Aunque las proteínas de matriz de diferentes virus parecen realizar funciones similares y pueden tener pliegues estructurales similares, sus secuencias primarias pueden ser muy diferentes. Las proteínas de matriz típicas de los retrovirus forman una estructura de haz helicoidal alfa . [3]
Una familia de estas proteínas representa las proteínas de matriz de los gammaretrovirus , como el virus de la leucemia murina de Moloney (MoMLV), el virus de la leucemia felina (FLV) y el virus del sarcoma felino (FESV). [4] [5] Esta familia también incluye proteínas de matriz de varios retrovirus endógenos eucariotas , que surgen cuando una o más copias del genoma retroviral se integran en el genoma del huésped. [6]
| Retro_M | |||||||||
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 Dominio m de la poliproteína gag del virus del sarcoma de Rous, RMN, 20 estructuras | |||||||||
| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | Retro_M | ||||||||
| Pfam | PF02813 | ||||||||
| Clan Pfam | CL0074 | ||||||||
| Interprofesional | IPR004028 | ||||||||
| SCOP2 | 1a6s / ALCANCE / SUPFAM | ||||||||
| Superfamilia OPM | 42 | ||||||||
| Proteína OPM | 1a6s | ||||||||
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Otra familia representa el dominio M de la poliproteína Gag presente en los retrovirus aviares. Incluye poliproteínas Gag de varios retrovirus aviares endógenos. [7]
| Mordaza_p10 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Estructura de la solución de la proteína de matriz de tipo salvaje m-pmv (p10) | |||||||||
| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | Mordaza_p10 | ||||||||
| Pfam | PF02337 | ||||||||
| Clan Pfam | CL0074 | ||||||||
| Interprofesional | IPR003322 | ||||||||
| Superfamilia OPM | 44 | ||||||||
| Proteína OPM | 2 l/a | ||||||||
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Las proteínas de la matriz también son componentes de los beta-retrovirus como el virus del mono Mason-Pfizer (MPMV) y el virus del tumor mamario del ratón (MMTV). [8] [9] Esta entrada también identifica proteínas de la matriz de varios retrovirus endógenos eucariotas. [6]
| Mordaza_p15 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Estructura cristalina del antígeno de matriz del virus de la anemia infecciosa equina (EIAV MA) | |||||||||
| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | Mordaza_p15 | ||||||||
| Pfam | PF08723 | ||||||||
| Interprofesional | IPR014834 | ||||||||
| SCOP2 | 1hek / ALCANCE / SUPFAM | ||||||||
| Superfamilia OPM | 44 | ||||||||
| Proteína OPM | 1 hek | ||||||||
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Referencias
- ^ Conte MR, Matthews S (julio de 1998). "Proteínas de la matriz retroviral: una perspectiva estructural". Virology . 246 (2): 191–8. doi : 10.1006/viro.1998.9206 . PMID 9657938.
- ^ Parent LJ, Cairns TM, Albert JA, Wilson CB, Wills JW, Craven RC (enero de 2000). "Defecto de dimerización del ARN en un mutante de la matriz del virus del sarcoma de Rous". J. Virol . 74 (1): 164–72. doi :10.1128/jvi.74.1.164-172.2000. PMC 111525 . PMID 10590103.
- ^ McDonnell JM, Fushman D, Cahill SM, Zhou W, Wolven A, Wilson CB, Nelle TD, Resh MD, Wills J, Cowburn D (junio de 1998). "Estructura de la solución y dinámica del dominio M retroviral bioactivo del virus del sarcoma de Rous". J. Mol. Biol . 279 (4): 921–8. doi :10.1006/jmbi.1998.1788. PMID 9642071.
- ^ Riffel N, Harlos K, Iourin O, Rao Z, Kingsman A, Stuart D, Fry E (diciembre de 2002). "Estructura de resolución atómica de la proteína de matriz del virus de la leucemia murina de Moloney y su relación con otras proteínas de matriz retrovirales". Estructura . 10 (12): 1627–36. doi : 10.1016/S0969-2126(02)00896-1 . PMID 12467570.
- ^ Baker SJ, Cosenza SC, Reddy EP (septiembre de 1998). "El papel de la miristoilación de v-Fgr y el dominio Gag en la unión a la membrana y la transformación celular". Virology . 249 (1): 1–11. doi : 10.1006/viro.1998.9323 . PMID 9740771.
- ^ ab Gifford R, Tristem M (mayo de 2003). "La evolución, distribución y diversidad de los retrovirus endógenos". Virus Genes . 26 (3): 291–315. doi :10.1023/A:1024455415443. PMID 12876457. S2CID 34639116.
- ^ Borisenko L (2003). "Retrovirus endógenos aviares". Folia Biol. (Praga) . 49 (5): 177–82. PMID 14680291.
- ^ Stansell E, Tytler E, Walter MR, Hunter E (mayo de 2004). "Una etapa temprana de la gemación del virus del mono Mason-Pfizer está regulada por la hidrofobicidad del núcleo del dominio de la matriz Gag". J. Virol . 78 (10): 5023–31. doi :10.1128/jvi.78.10.5023-5031.2004. PMC 400380 . PMID 15113883.
- ^ Poon DT, Li G, Aldovini A (marzo de 1998). "Contribuciones de la nucleocápside y de la proteína de la matriz al empaquetamiento selectivo del ARN genómico del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1". J. Virol . 72 (3): 1983–93. doi :10.1128/JVI.72.3.1983-1993.1998. PMC 109491 . PMID 9499052.
