Caja Pribnow

Secuencia de ADN necesaria en los promotores bacterianos para la transcripción

La caja de Pribnow (también conocida como caja de Pribnow-Schaller ) es una secuencia de TATAAT de seis nucleótidos ( timina , adenina , timina , etc.) que es una parte esencial de un sitio promotor en el ADN para que se produzca la transcripción en bacterias . ^[1]^[2] Es una secuencia idealizada o de consenso —es decir, muestra la base que aparece con mayor frecuencia en cada posición en muchos promotores analizados; los promotores individuales a menudo varían del consenso en una o más posiciones. También se le llama comúnmente secuencia o elemento -10 , porque está centrada aproximadamente diez pares de bases aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción.

La caja Pribnow tiene una función similar a la caja TATA que se produce en los promotores de eucariotas y arqueas : es reconocida y unida por una subunidad de la ARN polimerasa durante el inicio de la transcripción. ^[3] Esta región del ADN es también el primer lugar donde los pares de bases se separan durante la transcripción procariota para permitir el acceso a la cadena molde. La riqueza de AT es importante para permitir esta separación, ya que la adenina y la timina son más fáciles de separar (no solo debido a menos enlaces de hidrógeno , sino también debido a efectos de apilamiento de bases más débiles ). ^[4]

Recibe su nombre en honor a David Pribnow y Heinz Schaller. ^{[ cita requerida ]}^[1]^[2]

Probabilidad de ocurrencia de cada nucleótido enE. coli

De Harley et al.: ^[5]
yo	A	yo	A	A	yo
82%	89%	52%	59%	49%	89%

En la ficción

El término "caja Pribnow" se utiliza en el episodio 13 de Neon Genesis Evangelion , en referencia a la cámara que contiene Evangelions de simulación para fines de prueba.

Véase también

Caja TATA

Referencias

^ ab Pribnow, David (marzo de 1975). "Secuencia de nucleótidos de un sitio de unión de la ARN polimerasa en un promotor T7 temprano". PNAS . 72 (3): 784–788. Bibcode :1975PNAS...72..784P. doi : 10.1073/pnas.72.3.784 . ISSN 1091-6490. PMC 432404 . PMID 1093168.
^ ab Schaller, Heinz; Gray, Christopher; Herrman, Karin (febrero de 1975). "Secuencia de nucleótidos de un sitio de unión de la ARN polimerasa del ADN del bacteriófago fd". PNAS . 72 (2): 737–741. Bibcode :1975PNAS...72..737S. doi : 10.1073/pnas.72.2.737 . ISSN 1091-6490. PMC 432391 . PMID 1054851.
^ Feklistov, Andrey; Darst, Seth (2011). "Base estructural para el reconocimiento del elemento promotor −10 por la subunidad σ de la ARN polimerasa bacteriana". Cell . 147 (6): 1257–69. doi :10.1016/j.cell.2011.10.041. PMC 3245737 . PMID 22136875.
^ Yakovchuk, Peter; Protozanova, Ekaterina; Frank-Kamenetskii, Maxim D. (enero de 2006). "Contribuciones del apilamiento y emparejamiento de bases a la estabilidad térmica de la doble hélice del ADN". Nucleic Acids Research . 34 (2): 564–574. doi :10.1093/nar/gkj454. ISSN 0305-1048. PMC 1360284 . PMID 16449200.
^ Harley, Calvin B.; Reynolds, Robert P. (marzo de 1987). "Análisis de secuencias promotoras de E. coli" (PDF, 0,9 MB) . Nucleic Acids Research . 15 (5): 2343–2361. doi :10.1093/nar/15.5.2343. ISSN 0305-1048. PMC 340638. PMID 3550697 .

Este artículo sobre genética es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia ampliándolo.

[Pribnow1975-1] Pribnow, David (marzo de 1975). "Secuencia de nucleótidos de un sitio de unión de la ARN polimerasa en un promotor T7 temprano". PNAS . 72 (3): 784–788. Bibcode :1975PNAS...72..784P. doi : 10.1073/pnas.72.3.784 . ISSN 1091-6490. PMC 432404 . PMID 1093168.

[Schaller1975-2] Schaller, Heinz; Gray, Christopher; Herrman, Karin (febrero de 1975). "Secuencia de nucleótidos de un sitio de unión de la ARN polimerasa del ADN del bacteriófago fd". PNAS . 72 (2): 737–741. Bibcode :1975PNAS...72..737S. doi : 10.1073/pnas.72.2.737 . ISSN 1091-6490. PMC 432391 . PMID 1054851.

[3] Feklistov, Andrey; Darst, Seth (2011). "Base estructural para el reconocimiento del elemento promotor −10 por la subunidad σ de la ARN polimerasa bacteriana". Cell . 147 (6): 1257–69. doi :10.1016/j.cell.2011.10.041. PMC 3245737 . PMID 22136875.

[Yakovchuk2006-4] Yakovchuk, Peter; Protozanova, Ekaterina; Frank-Kamenetskii, Maxim D. (enero de 2006). "Contribuciones del apilamiento y emparejamiento de bases a la estabilidad térmica de la doble hélice del ADN". Nucleic Acids Research . 34 (2): 564–574. doi :10.1093/nar/gkj454. ISSN 0305-1048. PMC 1360284 . PMID 16449200.

[5] Harley, Calvin B.; Reynolds, Robert P. (marzo de 1987). "Análisis de secuencias promotoras de E. coli" (PDF, 0,9 MB) . Nucleic Acids Research . 15 (5): 2343–2361. doi :10.1093/nar/15.5.2343. ISSN 0305-1048. PMC 340638. PMID 3550697 .