Lior Pachter
Lior Pachter | |
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 Lior Pachter en 2013 | |
| Nacido | Lior Samuel Pachter ( 03-05-1973 )3 de mayo de 1973 |
| Alma máter | Instituto Tecnológico de California (BS) Instituto Tecnológico de Massachusetts (PhD) |
| Premios | Becario de la ISCB (2017) |
| Carrera científica | |
| Campos | Biología computacional Bioinformática Genómica Ciencias de la computación Matemáticas [1] |
| Instituciones | Universidad de California, Berkeley |
| Tesis | Teselación dominó, reconocimiento de genes y ratones (1999) |
| Asesor de doctorado | Bonnie Berger [2] |
| Estudiantes de doctorado | Cole Trapnell [2] [3] |
| Sitio web | liorpachter.wordpress.com |
Lior Samuel Pachter es un biólogo computacional . Trabaja en el Instituto Tecnológico de California , donde es profesor de Biología Computacional de la cátedra Bren. Sus intereses de investigación son muy variados, entre ellos la genómica , la combinatoria , la geometría computacional , el aprendizaje automático , la computación científica y la estadística . [1] [4] [5]
Vida temprana y educación
Pachter nació en Israel y creció en Sudáfrica . [6] Obtuvo una licenciatura en matemáticas del Instituto Tecnológico de California en 1994. [4] Completó su doctorado en matemáticas del Instituto Tecnológico de Massachusetts en 1999, supervisado por Bonnie Berger , [2] con Eric Lander y Daniel Kleitman como coasesores. [4]
Carrera e investigación
Pachter trabajó en la facultad de la Universidad de California, Berkeley, desde 1999 hasta 2018 [7] y recibió la Cátedra Sackler en 2012. [4]
Además de sus contribuciones técnicas, Pachter es conocido por usar los nuevos medios para promover la ciencia abierta [8] y por un experimento mental que publicó en su blog según el cual "el vecino más cercano al "humano perfecto"" es de Puerto Rico . [9] Esto recibió considerable atención de los medios, [10] y se publicó una respuesta en Scientific American . [11] También es conocido por las críticas al uso de UMAP por parte del proyecto All-of-us para visualizar e interpretar datos de genética de poblaciones. [12]
Premios y honores
En 2017, Pachter fue elegido miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB). [13]
Véase también
Referencias
- ^ Publicaciones de Lior Pachter indexadas por Google Scholar
- ^ abc Lior Pachter en el Proyecto de Genealogía Matemática
- ^ Trapnell, Cole; Pachter, Lior; Salzberg, Steven L. (2009). "TopHat: descubrimiento de uniones de empalme con RNA-Seq". Bioinformática . 25 (9): 1105–1111. doi :10.1093/bioinformatics/btp120. ISSN 1460-2059. PMC 2672628 . PMID 19289445.
- ^ abcd Curriculum vitae: Lior Pachter (PDF) , 2017 , consultado el 16 de mayo de 2017.
- ^ Trapnell, Cole; Williams, Brian A; Pertea, Geo; Mortazavi, Ali; Kwan, Gordon; van Baren, Marijke J; Salzberg, Steven L; Wold, Barbara J; Pachter, Lior (2010). "El ensamblaje y cuantificación de transcripciones mediante RNA-Seq revela transcripciones no anotadas y cambio de isoformas durante la diferenciación celular". Nature Biotechnology . 28 (5): 511–515. doi :10.1038/nbt.1621. ISSN 1087-0156. PMC 3146043 . PMID 20436464.
- ^ Eskenazi, Joe (14 de junio de 2002), "La petición de desinversión de la UC preocupa a los activistas pro-Israel", Jweekly.
- ^ "UC Berkeley, Facultad del Departamento de Matemáticas, Lior Pachter" . Consultado el 8 de junio de 2019 .
- ^ Lesen, Amy E. (2015), "¿Un nuevo paradigma para la comunicación científica? Redes sociales, Twitter, ciencia y participación pública: una revisión de la literatura", en Lesen, Amy E. (ed.), Científicos, expertos y participación cívica: caminando por una delgada línea , Ashgate Studies in Environmental Policy and Practice, Ashgate Publishing, Ltd., págs. 111–136, ISBN 9781472415240. Véanse en particular las páginas 119-120.
- ^ Pachter, Lior (2 de diciembre de 2014). "El humano perfecto es puertorriqueño". Bits of DNA – Reseñas y comentarios sobre biología computacional por Lior Pachter . Consultado el 11 de diciembre de 2016 .
- ^ Valdez, Maria G. (4 de diciembre de 2014), "¡Un nuevo estudio revela que el ser humano perfecto, genéticamente hablando, proviene de esta isla del Caribe!", Latin Times
- ^ Oleksyk, Taras K.; Martinez-Cruzado, Juan Carlos (5 de febrero de 2015). "Por qué no existe un ser humano perfecto en Puerto Rico ni en ningún otro lugar". Scientific American ..
- ^ pachter, lior (26 de febrero de 2024). "todos fallamos". wordpress . Consultado el 8 de marzo de 2024 .
todos fallamos
- ^ "13 de febrero de 2017: La Sociedad Internacional de Biología Computacional nombra a siete miembros como la Clase de Becarios ISCB de 2017". www.iscb.org . Consultado el 13 de febrero de 2017 .
Enlaces externos
