Nucleoporina 214
Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens
NUP214
Estructuras disponibles
APBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
AliasNUP214 , CAIN, CAN, D9S46E, N214, p250, nucleoporina 214kDa, nucleoporina 214, IIAE9
Identificaciones externasOMIM : 114350; MGI : 1095411; HomoloGene : 38008; Tarjetas genéticas : NUP214; OMA :NUP214 - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre

8021

227720

Conjunto

ENSG00000126883

ENSMUSG00000001855

Protección unificada

P35658

Q80U93

RefSeq (ARNm)

NM_005085
NM_001318324
NM_001318325

Número nuevo_172268

RefSeq (proteína)

NP_001305253
NP_001305254
NP_005076

NP_758472
NP_001395026

Ubicación (UCSC)Crónicas 9:131.13 – 131.23 MbCrónica 2: 31.86 – 31.94 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
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La nucleoporina 214 ( Nup2014 ) es una proteína que en los humanos está codificada por el gen NUP214 . [5] [6] [7]

Función

El complejo del poro nuclear es una estructura masiva que se extiende a través de la envoltura nuclear, formando una puerta de entrada que regula el flujo de macromoléculas entre el núcleo y el citoplasma . Las nucleoporinas son los componentes principales del complejo del poro nuclear en las células eucariotas . Este gen es un miembro de las nucleoporinas que contienen repeticiones FG. La proteína codificada por este gen se localiza en la cara citoplasmática del complejo del poro nuclear, donde es necesaria para la progresión adecuada del ciclo celular y el transporte nucleocitoplasmático. La porción 3' de este gen forma un gen de fusión con el gen DEK en el cromosoma 6 en la translocación at(6,9) asociada con la leucemia mieloide aguda y el síndrome mielodisplásico . [7]

Estructura

La estructura del dominio N-terminal de Nup214 revela un pliegue de hélice beta de siete palas seguido de un segmento peptídico extendido C-terminal de 30 residuos (CTE). El CTE se pliega hacia atrás sobre la hélice beta y se une a su cara inferior. [8] La estructura del NTD de Nup214 unido a la helicasa Ddx19 en su estado unido a ADP revela la base molecular de la interacción entre las dos proteínas. Se ha demostrado que un residuo conservado de Ddx19 es crucial para la formación de complejos in vitro e in vivo. Sorprendentemente, las superficies de interacción exhiben potenciales superficiales fuertemente opuestos, con la superficie de la helicasa cargada positivamente y la superficie de Nup214 cargada negativamente. Se ha demostrado que Ddx19 se une al ARN solo en su estado unido a ATP, y la unión del ARN y el NTD de Nup214 es mutuamente excluyente. [9]

Interacciones

Se ha demostrado que NUP214 interactúa con:

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000126883 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000001855 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ Kraemer D, Wozniak RW, Blobel G, Radu A (febrero de 1994). "La proteína CAN humana, un supuesto producto oncogén asociado con la leucemogénesis mieloide, es una proteína compleja de poro nuclear que se orienta hacia el citoplasma". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 91 (4): 1519–23. Bibcode :1994PNAS...91.1519K. doi : 10.1073/pnas.91.4.1519 . PMC 43191 . PMID  8108440. 
  6. ^ von Lindern M, Poustka A, Lerach H, Grosveld G (agosto de 1990). "La translocación del cromosoma (6;9), asociada con un subtipo específico de leucemia no linfocítica aguda, conduce a la transcripción aberrante de un gen diana en 9q34". Biología molecular y celular . 10 (8): 4016–26. doi :10.1128/mcb.10.8.4016. PMC 360912 . PMID  2370860. 
  7. ^ ab "Gen Entrez: NUP214 nucleoporina 214kDa".
  8. ^ Napetschnig J, Blobel G, Hoelz A (2007). "Estructura cristalina del dominio N-terminal del protooncogén humano Nup214/CAN". Proc. Natl. Sci. USA . 104 (6): 1783–8. Bibcode :2007PNAS..104.1783N. doi : 10.1073/pnas.0610828104 . PMC 1794303 . PMID  17264208. 
  9. ^ ab Napetschnig J, Kassube SA, Debler EW, Wong RW, Blobel G, Hoelz A (2009). "Análisis estructural y funcional de la interacción entre la nucleoporina Nup214 y la helicasa DEAD-box Ddx19". Proc. Natl. Sci. USA . 106 (9): 3089–94. Bibcode :2009PNAS..106.3089N. doi : 10.1073/pnas.0813267106 . PMC 2651337 . PMID  19208808. 
  10. ^ ab Herold A, Suyama M, Rodrigues JP, Braun IC, Kutay U, Carmo-Fonseca M, Bork P, Izaurralde E (diciembre de 2000). "TAP (NXF1) pertenece a una familia multigénica de supuestos factores de exportación de ARN con una arquitectura modular conservada". Biología molecular y celular . 20 (23): 8996–9008. doi :10.1128/mcb.20.23.8996-9008.2000. PMC 86553 . PMID  11073998. 
  11. ^ Schmitt I, Gerace L (noviembre de 2001). "Análisis in vitro del transporte nuclear mediado por el dominio lanzadera C-terminal de Tap". The Journal of Biological Chemistry . 276 (45): 42355–63. doi : 10.1074/jbc.M103916200 . PMID  11551912.
  12. ^ Carman JA, Nadler SG (marzo de 2004). "Asociación directa de la tristetraprolina con la nucleoporina CAN/Nup214". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 315 (2): 445–9. doi :10.1016/j.bbrc.2004.01.080. PMID  14766228.

Lectura adicional

  • Stoffler D, Fahrenkrog B, Aebi U (junio de 1999). "El complejo de poros nucleares: de la arquitectura molecular a la dinámica funcional". Current Opinion in Cell Biology . 11 (3): 391–401. doi :10.1016/S0955-0674(99)80055-6. PMID  10395558.
  • von Lindern M, Fornerod M, van Baal S, Jaegle M, de Wit T, Buijs A, Grosveld G (abril de 1992). "La translocación (6;9), asociada con un subtipo específico de leucemia mieloide aguda, da como resultado la fusión de dos genes, dek y can, y la expresión de un ARNm quimérico dek-can específico de la leucemia". Biología molecular y celular . 12 (4): 1687–97. doi :10.1128/mcb.12.4.1687. PMC  369612 . PMID  1549122.
  • Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tabata S (1995). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. I. Las secuencias codificantes de 40 genes nuevos (KIAA0001-KIAA0040) deducidas mediante el análisis de clones de ADNc muestreados aleatoriamente de la línea celular mieloide humana inmadura KG-1". DNA Research . 1 (1): 27–35. doi : 10.1093/dnares/1.1.27 . PMID  7584026.
  • Nomura N, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Kawarabayasi Y, Sato S, Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tabata S (1995). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. I. Las secuencias codificantes de 40 genes nuevos (KIAA0001-KIAA0040) deducidas mediante el análisis de clones de ADNc muestreados aleatoriamente de la línea celular mieloide humana inmadura KG-1 (suplemento)". DNA Research . 1 (1): 47–56. doi : 10.1093/dnares/1.1.47 . PMID  7584028.
  • Pilz A, Woodward K, Povey S, Abbott C (enero de 1995). "Mapeo comparativo de 50 loci del cromosoma 9 humano en el ratón de laboratorio". Genomics . 25 (1): 139–49. doi :10.1016/0888-7543(95)80119-7. PMID  7774911.
  • Stutz F, Izaurralde E, Mattaj IW, Rosbash M (diciembre de 1996). "Un papel para los dominios de repetición de nucleoporina FG en la exportación de la proteína Rev del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 y el ARN desde el núcleo". Biología molecular y celular . 16 (12): 7144–50. doi :10.1128/mcb.16.12.7144. PMC  231718 . PMID  8943370.
  • Fornerod M, van Deursen J, van Baal S, Reynolds A, Davis D, Murti KG, Fransen J, Grosveld G (febrero de 1997). "El homólogo humano de la levadura CRM1 está en un subcomplejo dinámico con CAN/Nup214 y un nuevo componente de poro nuclear Nup88". La Revista EMBO . 16 (4): 807–16. doi :10.1093/emboj/16.4.807. PMC  1169681 . PMID  9049309.
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  • Zolotukhin AS, Felber BK (enero de 1999). "Las nucleoporinas nup98 y nup214 participan en la exportación nuclear del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 Rev". Revista de Virología . 73 (1): 120–7. doi :10.1128/JVI.73.1.120-127.1999. PMC  103815 . PMID  9847314.
  • Schmitt C, von Kobbe C, Bachi A, Panté N, Rodrigues JP, Boscheron C, Rigaut G, Wilm M, Séraphin B, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (agosto de 1999). "Dbp5, una proteína DEAD-box necesaria para la exportación de ARNm, es reclutada a las fibrillas citoplasmáticas del complejo de poro nuclear a través de una interacción conservada con CAN/Nup159p". The EMBO Journal . 18 (15): 4332–47. doi :10.1093/emboj/18.15.4332. PMC  1171509 . PMID  10428971.
  • Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP, Panté N, Ribbeck K, von Kobbe C, Kutay U, Wilm M, Görlich D, Carmo-Fonseca M, Izaurralde E (enero de 2000). "El dominio C-terminal de TAP interactúa con el complejo de poro nuclear y promueve la exportación de sustratos de ARN portadores de CTE específicos". ARN . 6 (1): 136–58. doi :10.1017/S1355838200991994. PMC  1369901 . PMID  10668806.
  • Herold A, Suyama M, Rodrigues JP, Braun IC, Kutay U, Carmo-Fonseca M, Bork P, Izaurralde E (diciembre de 2000). "TAP (NXF1) pertenece a una familia multigénica de supuestos factores de exportación de ARN con una arquitectura modular conservada". Biología molecular y celular . 20 (23): 8996–9008. doi :10.1128/MCB.20.23.8996-9008.2000. PMC  86553 . PMID  11073998.
  • Hofmann W, Reichart B, Ewald A, Müller E, Schmitt I, Stauber RH, Lottspeich F, Jockusch BM, Scheer U, Hauber J, Dabauvalle MC (marzo de 2001). "Requerimientos de cofactores para la exportación nuclear de ARN retrovirales que contienen elementos de respuesta a Rev (RRE) y elementos de transporte constitutivos (CTE). Un papel inesperado para la actina". The Journal of Cell Biology . 152 (5): 895–910. doi :10.1083/jcb.152.5.895. PMC  2198816 . PMID  11238447.
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