Comité Internacional de Taxonomía de Virus
Organización internacional que regula la clasificación y nomenclatura de los virus.

Comité Internacional de Taxonomía de Virus
AbreviaturaTelevisión ICTV
Formación1966 ; hace 58 años ( 1966 )
ObjetivoRegulación de la taxonomía de los virus
CamposTaxonomía
Virología
Presidente (2020-2023)
Murilo Zerbini
Vicepresidente (2020-2023)
Stuart Siddell
Organización de padres
División de Virología de la Unión Internacional de Sociedades de Microbiología
Afiliaciones
Bienvenidos a la Sociedad de Microbiología
Sitio webictv.global

El Comité Internacional de Taxonomía de Virus ( ICTV ) autoriza y organiza la clasificación taxonómica y la nomenclatura de los virus . [1] [2] [3] El ICTV desarrolla un esquema taxonómico universal para los virus y, por lo tanto, tiene los medios para describir, nombrar y clasificar adecuadamente cada taxón de virus. Los miembros del Comité Internacional de Taxonomía de Virus se consideran virólogos expertos . [4] El ICTV se formó a partir de la División de Virología de la Unión Internacional de Sociedades de Microbiología y está gobernado por ella . [5] El trabajo detallado, como la identificación de nuevos taxones y la delimitación de los límites de especies, géneros, familias, etc., normalmente lo realizan grupos de estudio de expertos en las familias. [2]

Historia

El Comité Internacional de Nomenclatura de Virus (ICNV) se estableció en 1966, en el Congreso Internacional de Microbiología en Moscú, para estandarizar la denominación de los taxones de virus. [6] El ICVN publicó su primer informe en 1971. [6] Para los virus que infectan vertebrados , el primer informe incluyó 19 géneros, 2 familias y otros 24 grupos no clasificados. [ cita requerida ]

En 1974, el ICNV pasó a llamarse Comité Internacional de Taxonomía de Virus. [6]

Estructura organizativa

La organización está dividida en un comité ejecutivo, que incluye miembros y ejecutivos con funciones electas por un período determinado, así como jefes de siete subcomités designados directamente. Cada jefe de subcomité, a su vez, designa numerosos "grupos de estudio", cada uno de los cuales consta de un presidente y un número variable de miembros dedicados a la taxonomía de un taxón específico, como un orden o una familia. Esta estructura puede visualizarse de la siguiente manera: [7]

Comité ejecutivo
  • Presidente
  • Vicepresidente
  • Secretarias
    • Secretaria de Negocios
    • Secretaria de Propuestas
    • Secretaria de Datos
  • Presidentes – cargos: 7 (uno por cada subcomité)
  • Miembros electos – cargos: 11
Subcomités
  • Subcomité de Virus y Retrovirus de ADN Animal – grupos de estudio: 18
  • Subcomité de virus de ARNdc y ARNmc de origen animal – grupos de estudio: 24
  • Subcomité de virus ssRNA+ animales – grupos de estudio: 16
  • Subcomité de Virus Bacterianos – grupos de estudio: 20
  • Subcomité de virus arqueológicos – grupos de estudio: 11
  • Subcomité de Virus Fúngicos y Protistas – grupos de estudio: 12
  • Subcomité de Virus de Plantas – grupos de estudio: 22

Objetivos

Los objetivos del Comité Internacional de Taxonomía de Virus son: [8] : §3 

  1. Desarrollar una taxonomía acordada internacionalmente para los virus.
  2. Establecer nombres acordados internacionalmente para los taxones de virus.
  3. Comunicar a los virólogos las decisiones adoptadas en materia de clasificación y nomenclatura de los virus mediante la celebración de reuniones y la publicación de informes.
  4. Mantener un índice oficial de nombres acordados de taxones de virus.
  5. Estudiar los efectos de los virus en la sociedad moderna y su comportamiento.

Principios de nomenclatura

Los principios esenciales de nomenclatura de virus del ICTV son: [9] : §2.1 

  • Estabilidad
  • Evitar o rechazar el uso de nombres que puedan causar error o confusión.
  • Para evitar la creación innecesaria de nombres

El sistema de clasificación universal de virus del ICTV utiliza una versión ligeramente modificada del sistema de clasificación biológica estándar . Sólo reconoce el orden de taxones , la familia, la subfamilia, el género y la especie. Cuando no se sabe con certeza cómo clasificar una especie en un género pero su clasificación en una familia es clara, se la clasifica como especie no asignada de esa familia. Muchos taxones permanecen sin clasificar. También hay, a fecha de 2005, secuencias de GenBank asignadas a 3.142 "especies" que no se contabilizan en el informe del ICTV (sin embargo, debido a la forma en que funciona GenBank, el número real de especies adecuadas es probablemente significativamente menor). [2] Se espera que el número de secuencias de virus no identificadas aumente a medida que la tasa de secuenciación de virus aumente drásticamente. [2][actualizar]

El ICTV ha tenido un éxito sorprendente en lograr estabilidad desde su creación en 1962. Por ejemplo, todos los géneros y familias reconocidos en la década de 1980 seguían utilizándose en 2005. [2]

Nombramiento y cambio de taxones

Las propuestas de nombres nuevos, cambios de nombres y establecimiento y ubicación taxonómica de taxones son manejadas por el comité ejecutivo del ICTV en forma de propuestas. Todos los subcomités y grupos de estudio pertinentes del ICTV son consultados antes de tomar una decisión. [9] : §3.8,3.19 

El nombre de un taxón no tiene estatus oficial hasta que haya sido aprobado por el ICTV, y los nombres sólo serán aceptados si están vinculados a taxones jerárquicos aprobados. [9] : §2.4,3.7  Si no se propone un nombre adecuado para un taxón, el taxón puede ser aprobado y el nombre puede dejarse sin decidir hasta la adopción de un nombre internacional aceptable, cuando uno es propuesto y aceptado por el ICTV. [ cita requerida ] Los nombres no deben transmitir un significado para el taxón que parezca excluir virus que son legítimamente miembros de ese taxón, excluir miembros que algún día podrían pertenecer a ese taxón, o incluir virus que son miembros de diferentes taxones. [9] : §3.17 

No existe un principio de prioridad para la virología, de modo que un nombre en uso actual no puede invalidarse reivindicando prioridad. [9] : §3.10 

Reglas para taxones

Especies

Desde 2020, [10] el Código Viral exige el uso de nombres binomiales para las nuevas especies: un género seguido de un epíteto específico. [9] : §3.21  El nombre de una especie debe proporcionar una identificación apropiadamente inequívoca de la especie. [9] : §3.22 

Antes de esa fecha, estaba en vigor un sistema de denominación más liberal: el nombre de una especie debe constar de la menor cantidad de palabras posible, pero no debe constar únicamente de un nombre de hospedante y la palabra virus . Se pueden utilizar números, letras o combinaciones de los mismos como epítetos de especie cuando dichos números y letras ya se utilizan ampliamente. Sin embargo, los números de serie, letras o combinaciones de los mismos recientemente designados no son aceptables por sí solos como epítetos de especie. Si ya existe una serie de números o letras, se puede continuar. [ cita requerida ]

Géneros

Un género de virus es un grupo de especies relacionadas que comparten algunas propiedades significativas y a menudo difieren solo en el rango de hospedadores y la virulencia. El nombre de un género debe ser una sola palabra que termine en el sufijo - virus . La aprobación de un nuevo género debe ir acompañada de la aprobación de una especie tipo . [9] : §3.24 

Subfamilias

Una subfamilia es un grupo de géneros que comparten ciertos caracteres comunes. El taxón se utilizará únicamente cuando sea necesario para resolver un problema jerárquico complejo. El nombre de una subfamilia debe ser una sola palabra que termine con el sufijo - virinae . [9] : §3.24 

Familias

Una familia es un grupo de géneros, ya sea que estén organizados en subfamilias o no, que comparten ciertos caracteres comunes entre sí. Un apellido debe ser una sola palabra que termine en el sufijo -viridae . [ 9] : §3.24 

Pedidos

Un orden es un grupo de familias que comparten ciertos caracteres comunes. El nombre de un orden debe ser una sola palabra que termine con el sufijo -virales . [ 9] : §3.24 

Reglas para agentes subvirales

Las reglas relativas a la clasificación de los virus se aplicarán también a la clasificación de los viroides . Las terminaciones formales para los taxones de viroides son la palabra viroid para las especies, el sufijo -viroid para los géneros, el sufijo -viroinae para las subfamilias, en caso de que se necesite este taxón, y -viroidae para las familias. [9] : §3.26  Se utiliza un sistema similar para los satélites y los viriformes, sustituyendo -vir- en las terminaciones normales de los taxones por -satellit- y -viriform- . [9] : §3.26  [ ¿cuándo? ]

Los retrotransposones se consideran virus en cuanto a clasificación y nomenclatura. Los priones no se clasifican como virus, sino que se les asigna una clasificación arbitraria que parece útil para los investigadores de los campos específicos. [ cita requerida ]

Reglas de ortografía

  1. En el uso taxonómico formal, los nombres aceptados de órdenes, familias, subfamilias y géneros de virus se imprimen en cursiva y las primeras letras de los nombres se escriben en mayúscula. [11]
  2. Los nombres de las especies se escriben en cursiva y la primera letra de la primera palabra se escribe con mayúscula. Las demás palabras no se escriben con mayúscula a menos que sean nombres propios o partes de nombres propios.
  3. En el uso formal, el nombre del taxón debe preceder al término de la unidad taxonómica.

Clasificación de los virus descubiertos mediante metagenómica

Reconociendo la importancia de la metagenómica viral, el ICTV reconoce que los genomas ensamblados a partir de datos metagenómicos representan virus reales y fomenta su clasificación oficial siguiendo los mismos procedimientos que los utilizados para los virus aislados y caracterizados utilizando enfoques de virología clásica. [12] [13]

Informes de ICTV

El ICTV ha publicado informes sobre la taxonomía de los virus aproximadamente dos veces por década desde 1971 (enumerados a continuación: "Informes"). El noveno informe del ICTV se publicó en diciembre de 2011; [14] el contenido ahora está disponible de forma gratuita a través del sitio web del ICTV. [15] A partir de 2017, el décimo informe del ICTV se publicará en línea en el sitio web del ICTV [16] [17] y será de acceso gratuito con capítulos individuales actualizados de forma continua. La taxonomía de 2018 está disponible en línea, [18] incluida una hoja de cálculo de Excel descargable de todas las especies reconocidas.

Base de datos ICTVdb

ICTVdb es una base de datos de especies y aislados que se ha diseñado para servir como complemento de la base de datos de taxonomía ICTV. El desarrollo de ICTVdB ha sido apoyado por ICTV desde 1991 y su objetivo inicial era ayudar a la investigación taxonómica. La base de datos clasifica los virus basándose principalmente en sus características químicas, tipo genómico , replicación de ácidos nucleicos , enfermedades, vectores y distribución geográfica, entre otras características. [ cita requerida ]

La base de datos fue desarrollada en la Universidad Nacional de Australia con el apoyo de la Fundación Nacional de Ciencias de los Estados Unidos y patrocinada por la Colección Americana de Cultivos Tipo . Utiliza el sistema de Lenguaje de Descripción para Taxonomía ( DELTA ), un estándar mundial para el intercambio de datos taxonómicos, desarrollado en la Organización de Investigación Científica e Industrial de la Commonwealth (CSIRO) de Australia. DELTA puede almacenar una amplia diversidad de datos y traducirlos a un lenguaje adecuado para informes tradicionales y publicaciones web. Por ejemplo, ICTVdB no contiene en sí información de secuencia genómica, pero puede convertir datos de DELTA al formato NEXUS. [19] También puede manejar grandes entradas de datos y es adecuado para compilar largas listas de propiedades de virus, comentarios de texto e imágenes.

ICTVdB ha crecido en concepto y capacidad hasta convertirse en un importante recurso de referencia y herramienta de investigación; en 1999 recibía más de 30.000 visitas en línea combinadas por día desde su sitio principal en la Universidad Nacional de Australia y dos sitios espejo con sede en el Reino Unido y Estados Unidos. [20]

En 2011, el ICTV decidió suspender el proyecto y el sitio web ICTVdb. Esta decisión se tomó después de que se hizo evidente que la taxonomía proporcionada en el sitio estaba desactualizada hace muchos años y que parte de la información del sitio era inexacta debido a problemas con la forma en que se consultaba y procesaba la base de datos para respaldar la salida en lenguaje natural del sitio web ICTVdb. El ICTV comenzó a debatir sobre la mejor manera de solucionar estos problemas, pero decidió que el plazo para las actualizaciones y la corrección de errores era lo suficientemente largo como para que fuera mejor cerrar el sitio en lugar de perpetuar la publicación de información inexacta. [ cita requerida ] A partir de agosto de 2013, la base de datos permanece suspendida. [3] Según algunas opiniones, "ICTV también debería promover el uso de una base de datos pública para reemplazar la base de datos ICTV como un almacén de los metadatos primarios de virus individuales, y debería publicar resúmenes de los Informes ICTV en esa base de datos, para que sean de 'Acceso abierto'". [3] La base de datos se restableció en 2017. [17]

Informes

  • Virus, Comité Internacional de Nomenclatura de; Wildy, Peter (1971). Clasificación y nomenclatura de virus. 1er informe. Agotado
  • Virus, Comité Internacional de Taxonomía de; Fenner, Frank (1976). Clasificación y nomenclatura de los virus. Segundo informe. ISBN 978-3805524186.
  • Virus, Comité Internacional de Taxonomía de; Matthews, Richard Ellis Ford; Sección de Virología, Asociación Internacional de Sociedades Microbiológicas (1979). Clasificación y nomenclatura de los virus. Tercer informe. ISBN 978-3805505239.
  • Ellis, Richard; Matthews, Ford, eds. (1982). Clasificación y nomenclatura de los virus. 4.º informe. Karger. pág. 199. ISBN 9783805535571.
  • Virus, Comité Internacional de Taxonomía de; Francki, RI B (1991). Clasificación y nomenclatura de virus. Quinto informe. ISBN 978-3211822869.
  • Murphy, Frederik A (1995). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus. Sexto informe. ISBN 978-3211825945.
  • Virus, Comité Internacional de Taxonomía de; Van Regenmortel, MH V; Fauquet, C. M; Bishop, DH L (2000). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus. Séptimo informe. ISBN 978-0123702005.
  • Fauquet, CM, ed. (2005). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus. 8.º informe. Elsevier/Academic Press. ISBN 978-0080575483.
  • King, Andrew MQ; Lefkowitz, Elliot; Adams, Michael J.; et al., eds. (2011). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus. Noveno informe. Elsevier/Academic Press. pág. 1338. ISBN 9780123846846.También disponible en línea. [15]
  • Décimo Informe ICTV (en línea) [16]

Véase también

Referencias

  1. ^ King, Andrew MQ; Lefkowitz, E.; Adams, MJ; Carstens, EB (2012). Clasificación y nomenclatura de virus según la taxonomía de virus: noveno informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus. Elsevier. ISBN 978-0-12-384684-6Archivado desde el original el 10 de diciembre de 2017 . Consultado el 13 de abril de 2017 .
  2. ^ abcde Fauquet, CM; Fargette, D. (2005). "Comité Internacional de Taxonomía de Virus y las 3.142 especies no asignadas". Virology Journal . 2 : 64. doi : 10.1186/1743-422X-2-64 . PMC 1208960 . PMID  16105179. 
  3. ^ abc Gibbs, AJ (2013). "La taxonomía viral necesita una limpieza de primavera; su era de exploración ha terminado". Virology Journal . 10 : 254. doi : 10.1186/1743-422X-10-254 . PMC 3751428 . PMID  23938184. 
  4. ^ "Datos bancarios diversos: los orígenes de ICTVdB". 13 de noviembre de 2005. Archivado desde el original el 13 de noviembre de 2005. Consultado el 6 de abril de 2018 .
  5. ^ "Unión Internacional de Sociedades de Microbiología (IUMS)". Archivado desde el original el 30 de septiembre de 2007. Consultado el 22 de junio de 2006 .
  6. ^ abc Kuhn, Jens H. (2021). "Taxonomía de virus". Enciclopedia de Virología . 1 : 28–37. doi :10.1016/B978-0-12-809633-8.21231-4. ISBN 9780128145166. Número de pieza  7157452 .
  7. ^ "Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV)". ictv.global . Consultado el 13 de septiembre de 2023 .
  8. ^ "Estatutos del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV)". ICTV . Marzo de 2023.
  9. ^ abcdefghijklm "Código internacional de clasificación y nomenclatura de virus (ICVCN)". ICTV . Marzo de 2021.
  10. ^ Chappell, Bill (1 de agosto de 2022). "Los críticos dicen que 'viruela del mono' es un nombre racista. Pero no va a desaparecer pronto". NPR . Consultado el 18 de diciembre de 2023 . Y aunque el ICTV dice que un cambio en el nombre formal del virus de la viruela del mono podría producirse en el próximo año o dos, la revisión no sería una respuesta al brote actual. En cambio, es parte de una amplia revisión de las convenciones de nomenclatura para todas las especies de virus, incluida la viruela del mono, después de que el ICTV adoptara cambios en 2020 para estandarizar su formato de nomenclatura.
  11. ^ Ali, Muhammad (2016). "Hacia una nomenclatura coherente de los virus de plantas". Virologica Sinica . 31 (3): 197–198. doi :10.1007/s12250-016-3741-5. PMC 8193424 . PMID  27052507. S2CID  10162214. 
  12. ^ Simmonds P, Adams MJ, Benkő M, Breitbart M , Brister JR, Carstens EB, Davison AJ, Delwart E, Gorbalenya AE, Harrach B, Hull R, King AMQ, Koonin EV, Krupovic M, Kuhn JH, Lefkowitz EJ, Nibert ML, Orton R, Roossinck MJ, Sabanadzovic S, Sullivan MB, Suttle CA, Tesh RB, van der Vlugt RA, Varsani A, Zerbini FM (2017). "Declaración de consenso: taxonomía de virus en la era de la metagenómica" (PDF) . Revisiones de la naturaleza Microbiología . 15 (3): 161–168. doi : 10.1038/nrmicro.2016.177 . PMID  28134265. Archivado (PDF) del original el 23 de julio de 2018. Consultado el 18 de octubre de 2019 .
  13. ^ Adams MJ, Lefkowitz EJ, King AM, Harrach B, Harrison RL, Knowles NJ, Kropinski AM, Krupovic M, Kuhn JH, Mushegian AR, Nibert ML, Sabanadzovic S, Sanfaçon H, Siddell SG, Simmonds P, Varsani A, Zerbini FM, Orton RJ, Smith DB, Gorbalenya AE, Davison AJ (2017). "50 años del Comité Internacional de Taxonomía de Virus: progreso y perspectivas" (PDF) . Archivos de Virología . 162 (5): 1441–1446. doi : 10.1007/s00705-016-3215-y . PMID  28078475. Archivado (PDF) desde el original el 23 de julio de 2018 . Recuperado el 17 de septiembre de 2019 .
  14. ^ King, Andrew MQ; et al., eds. (2012). Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus: noveno informe del Comité Internacional de Taxonomía de Virus. Londres: Academic Press. ISBN 978-0123846846Archivado desde el original el 11 de septiembre de 2014 . Consultado el 9 de diciembre de 2014 .
  15. ^ ab «Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus; noveno informe del ICTV (2011)». Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Archivado desde el original el 2 de abril de 2019. Consultado el 18 de octubre de 2019 .– no incluye el contenido de la parte III (contiene el estatuto y el Código de ICTV)
  16. ^ ab «Taxonomía de virus: clasificación y nomenclatura de virus; décimo informe del ICTV». Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Archivado desde el original el 1 de julio de 2019. Consultado el 18 de octubre de 2019 .
  17. ^ ab Lefkowitz, EJ; Dempsey, DM; Hendrickson, RC; Orton, RJ; Siddell, SG; Smith, DB (4 de enero de 2018). "Taxonomía de virus: la base de datos del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV)". Nucleic Acids Research . 46 (D1): D708–D717. doi :10.1093/nar/gkx932. PMC 5753373 . PMID  29040670. 
  18. ^ "Actual publicación de la taxonomía ICTV". Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) . Archivado desde el original el 4 de marzo de 2018. Consultado el 18 de octubre de 2019 .
  19. ^ Maddison DR, Swofford DL, Maddison WP (diciembre de 1997). "NEXUS: un formato de archivo extensible para información sistemática". Syst. Biol . 46 (4): 590–621. doi : 10.1093/sysbio/46.4.590 . PMID:  11975335. S2CID  : 30267491.
  20. ^ "Datos bancarios diversos: los orígenes de ICTVdB". 13 de noviembre de 2005. Archivado desde el original el 13 de noviembre de 2005. Consultado el 18 de octubre de 2019 .
Wikidata tiene la propiedad:
  • SIN ETIQUETA (P1076) (ver usos )
  • Sitio web oficial
  • "Historia de la ICTVdB" (PDF) . Archivado desde el original (PDF) el 7 de septiembre de 2006 . Consultado el 22 de junio de 2006 .
  • Centro de recursos de bioinformática viral
  • Gibbs, Adrian J (9 de agosto de 2013). "La taxonomía viral necesita una limpieza de primavera; su era de exploración ha terminado". Virology Journal . 10 : 254. doi : 10.1186/1743-422X-10-254 . PMC  3751428 . PMID  23938184. Resumen: El Comité Internacional de Taxonomía de Virus ha cambiado recientemente su definición aprobada de especie viral y también ha interrumpido el trabajo en su base de datos de descripción de virus.
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