Motivo de ARN MAEB
El motivo de ARN MAEB ( elemento asociado al metabolismo en el motivo de ARN de Burkholderia ) es una estructura de ARN de bucle de tallo conservada presente en muchas especies del género Burkholderia . [1] Los bucles de tallo MAEB suelen aparecer en bloques de repeticiones, normalmente con 2 a 6 instancias consecutivas de bucles de tallo MAEB separados por una secuencia de enlace corta y conservada. Se han observado hasta 12 bucles de tallo MAEB consecutivos en un solo bloque.
La mayoría de los bloques MAEB están posicionados en el presunto 5' UTR de los genes corriente abajo. De 141 bloques de bucles de tallo MAEB consecutivos, 132 están posicionados en un posible 5' UTR. Por lo tanto, es probable que los bucles de tallo MAEB correspondan a un elemento regulador cis . Se observó que los genes aparentemente regulados por MAEB generalmente tienen un papel en el metabolismo primario , es decir, la síntesis, catabolismo o transporte de moléculas pequeñas; pocos genes asociados a MAEB están involucrados en otras funciones, como la transducción de señales , la motilidad o la replicación . Por lo tanto, el motivo está asociado con un papel metabólico y, de hecho, se observó una asociación débil con el sistema de escisión de glicina .
Se consideraron tres hipótesis para el papel biológico de MAEB. Una es que el tallo-bucle de MAEB es realmente un dominio de unión al ADN de una proteína dimérica , y que las dos subunidades de esta proteína se unen a cadenas opuestas del ADN dúplex. Sin embargo, dos nucleótidos en posiciones complementarias en el lado 5' y 3' del tallo son casi siempre purinas . Si el motivo MAEB es realmente un dominio corto de unión al ADN y su complemento inverso, entonces la parte 3' del tallo aparente del ARN en esta posición debería contener la pirimidina complementaria , y no ser también una purina. Por lo tanto, es poco probable que esta hipótesis sea cierta.
La segunda hipótesis considerada es que MAEB es una secuencia repetitiva de ADN . Aunque la naturaleza repetitiva de los bucles madre de MAEB respalda este tipo de función, la asociación de MAEB con genes metabólicos es incompatible con los elementos repetitivos conocidos, que suelen ser el resultado de la replicación egoísta o de errores en la replicación. Más bien, la naturaleza repetitiva de los bucles madre de MAEB probablemente tenga una función funcional para la célula .
La tercera hipótesis planteada es que los bucles de tallo MAEB se unen a una proteína, y la aparición múltiple de bucles de tallo MAEB dentro de una sola molécula de ARN permitiría la unión de más proteínas por molécula de ARN. Esta disposición es similar a la del ARN CsrB , que contiene aproximadamente 18 horquillas, cada una de las cuales se une a una subunidad de proteína CsrA . La verdadera función de los bucles de tallo MAEB sigue siendo desconocida.
Referencias
