Miovirus

Familia de virus
Miovirus
Imagen TEM de un virión del fago S-PM2 de Synechococcus
Clasificación de virus Editar esta clasificación
(sin clasificar):Virus
Reino :Duplodnaviria
Reino:Virus de Heunggong
Filo:Uroviricóta
Clase:Caudoviricetes
Orden:Caudovirus
Familia:Miovirus
Subfamilias y géneros

ver texto

Myoviridae era una familia de bacteriófagos del orden Caudovirales . La familia Myoviridae y el orden Caudovirales han sido abolidos en la actualidad, y el término miovirus se utiliza ahora para referirse a la morfología de los virus de esta antigua familia. [1] Las bacterias y las arqueas sirven como huéspedes naturales. Había 625 especies en esta familia, asignadas a ocho subfamilias y 217 géneros. [2] [3]

Subdivisiones

La subfamilia Tevenvirinae (sinónimo: Tequatrovirinae ) recibe su nombre de su especie tipo, el fago Enterobacteria T4 . Los miembros de esta subfamilia son morfológicamente indistinguibles y tienen cabezas moderadamente alargadas de unos 110 nanómetros (nm) de longitud, colas de 114 nm de longitud con un collar, placas de base con púas cortas y seis fibras de cola largas y enroscadas. Los géneros dentro de esta subfamilia se dividen sobre la base de la morfología de la cabeza, con el género Tequatrovirus (nombre provisional: T4virus ) que tiene una longitud de cabeza de 137 nm y los del género Schizotequatrovirus tienen una longitud de 111 nm. Dentro de los géneros, sobre la base de la homología de proteínas, las especies se han dividido en varios grupos.

La subfamilia Peduovirinae tiene viriones con cabezas de 60 nm de diámetro y colas de 135 × 18 nm. Estos fagos se identifican fácilmente porque las vainas contraídas tienden a deslizarse fuera del núcleo de la cola. El fago P" es la especie tipo.

La subfamilia Spounavirinae son todos fagos virulentos, de amplio espectro de hospedadores que infectan a miembros de Bacillota . Poseen cabezas isométricas de 87-94 nm de diámetro y capsómeros conspicuos , colas estriadas de 140-219 nm de largo y una placa base doble. En la punta de la cola hay estructuras globulares que ahora se sabe que son las espigas de la placa base y fibras de cola cortas y enroscadas con simetría séxtuple. Los miembros de este grupo generalmente poseen genomas grandes (127-142 kb) no permutados con redundancias terminales de 3,1-20 kb. El nombre de esta subfamilia se deriva de SPO más una (del latín "uno").

Los halovirus HF1 y HF2 pertenecen al mismo género, pero como infectan arqueas en lugar de bacterias, es probable que se los coloque en un género separado una vez que se haya establecido su clasificación. [4]

Se ha propuesto un grupo enano sobre bases morfológicas y genómicas. Este grupo incluye los fagos Aeromonas salmonicida fago 56, Vibrio cholerae fagos 138 y CP-T1, Bdellovibrio fago φ1422 y Pectobacterium carotovorum fago ZF40. [5] Sus características compartidas incluyen una morfología de virión idéntica, caracterizada por colas contráctiles generalmente cortas y todos tienen tamaños de genoma de aproximadamente 45 kilobases. El orden de los genes en la unidad estructural del genoma es el siguiente: terminasa—portal—cabeza—cola—placa base—fibras de la cola.

Virología

Estructura típica de un miovirus

Los virus de la antigua familia Myoviridae no tienen envoltura, tienen geometrías de cabeza y cola (con cuello). Los genomas son ADN lineal de doble cadena, de alrededor de 33-244 kb de longitud. El genoma codifica entre 40 y 415 proteínas. [2] Tiene secuencias redundantes terminales. El contenido de GC es de ~35%. El genoma codifica entre 200 y 300 proteínas que se transcriben en operones. La 5-hidroximetilcitosina puede estar presente en el genoma (en lugar de timidina ).

La cola tubular tiene simetría helicoidal y un diámetro de 16-20 nm. Está formada por un tubo central, una vaina contráctil, un collar, una placa base, seis clavijas de cola y seis fibras largas. Es similar a Tectiviridae , pero se diferencia en que la cola de un miovirus es permanente.

Las contracciones de la cola requieren ATP . Al contraerse la vaina, las subunidades de la vaina se deslizan unas sobre otras y la cola se acorta hasta alcanzar una longitud de entre 10 y 15 nm.

Ciclo vital

Ciclo de reproducción del bacteriófago Pseudomonas PAK_P3, género Nankokuvirus
Micrografía de una sección delgada de plástico de una célula de Salmonella con cápsides del fago SPN3US alineadas en la membrana celular. Barra de escala: 2000 Å. Crédito: J. Bernard Heymann et al. (2020) [6]

Al unirse a una célula huésped, el virus utiliza su vaina contráctil como una jeringa, perforando la pared celular con su tubo central e inyectando el material genético en el huésped. El ADN inyectado se hace cargo de los mecanismos de transcripción y traducción de la célula huésped y comienza a fabricar nuevos virus. La replicación sigue el modelo de transposición replicativa. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. La traducción se lleva a cabo por desplazamiento del marco ribosómico -1 . El virus sale de la célula huésped por lisis y las proteínas holina / endolisina / spanina. Las bacterias y las arqueas sirven como huésped natural. La ruta de transmisión es la difusión pasiva . [2]

Aunque los miovirus son en general líticos y carecen de los genes necesarios para volverse lisogénicos , se conocen varias especies templadas .

Aplicaciones

Debido a que la mayoría de los Myoviridae son fagos líticos, en lugar de templados, algunos investigadores han estudiado su uso como terapia para enfermedades bacterianas en humanos y otros animales. [7]

Taxonomía

Se reconocen las siguientes ocho subfamilias: [3]

Además, los siguientes géneros no están asignados a una subfamilia: [3]

  • Abuovirus
  • Acionnavirus
  • Virus agrícola
  • Ativirus
  • Virus alcioneo
  • Virus de alexandria
  • Virus Anamdong
  • Anaposvirus
  • Virus Aokuang
  • Virus asterius
  • Atlavirus
  • Virus Aurun
  • Virus Ayohtre
  • Virus del Baikal
  • Virus bakoly
  • Barbavirus
  • Virus Bcepfuna
  • Virus Bcepmu
  • Virus de la sepsis de Beceds
  • virus bellamy
  • Bendigovirus
  • Biquartavirus
  • Bixzunavirus
  • Virus borock
  • virus brigitte
  • Brizovirus
  • Brunovirus
  • Virus de Busan
  • Carpasinavirus
  • Virus del chakrabarty
  • Caribdisvirus
  • Virus Chiangmai
  • Virus del colney
  • Virus de la cimopoleia
  • Virus derbicus
  • Dibbivirus
  • Virus Donelli
  • Virus del elmento
  • El virus
  • Emdodecavirus
  • Virus del eneladus
  • Eponavirus
  • Virus Erskine
  • Virus eurybia
  • Virus ficleduo
  • Virus de la flaumdra
  • Virus de fukui
  • Gofduovirus
  • Virus del goslar
  • Virus haloferacales
  • Hapunavirus
  • Virus de Heilongjiang
  • Virus del japeto
  • Yodovirus
  • Ionavirus
  • virus jeduna
  • Virus Jilin
  • Virus Jimmer
  • Virus de Kanagawa
  • virus del canal
  • Virus de la Clausura
  • Virus Kleczkowska
  • Virus Kungbxna
  • Virus Kyle
  • Virus Lagaffe
  • Leucotheavirus
  • virus del Líbano
  • Lietduovirus
  • Virus de la lira
  • Virus de Loughborough
  • Virus de Lubbock
  • Virus de máquina
  • virus marfa
  • Virus Martha
  • Mazuvirus
  • Virus mendera
  • Virus metriótico
  • Virus de la granja de Miesea
  • Mimasvirus
  • Virus moabita
  • Virus motorizado
  • Virus Muldoon
  • Virus mushu
  • Virus mucolítico
  • Mioalterovirus
  • Miohalovirus
  • Miosmarvirus
  • Virus de la naes
  • Virus Namaka
  • Virus nankoku
  • Virus Neptuno
  • Virus Nereo
  • Virus Nerrivik
  • Virus nodular
  • Virus noxiferógeno
  • Virus Nylescharon
  • Virus de Obolensk
  • Otagovirus
  • Virus del pakpuna
  • Virus del paleontologo
  • Virus de la Peste Negra
  • Virus de la turba
  • Virus del papiloma humano
  • Virus de la petsu
  • Phabquatrovirus (virus del papiloma humano)
  • Fapecoctavirus
  • Virus Phikz
  • Virus pippi
  • Virus de Plaisance
  • Virus del lago de la meseta
  • Virus poliboto
  • Virus del ponto
  • Virus popoff
  • Punavirus
  • Virus Qingdao
  • Virus Raharianne
  • Virus radnor
  • Ripduovirus
  • Virus del sol naciente
  • Virus de Rondor
  • Virus de Rosemount
  • Virus saclay
  • virus de san giron
  • Virus de la salacisa
  • Virus del salmón
  • Virus saruman
  • Virus del sasquatch
  • Virus Schmittlotz
  • Virus de Seúl
  • Virus de Shandong
  • Virus de Sherbrooke
  • Virus Shirahama
  • virus shala
  • Virus de la viruela
  • Virus del tabernario
  • Virus Takahashi
  • Virus Tamkung
  • Virus Taranis
  • Virus del tefnut
  • virus teguna
  • Taumasvirus
  • Virus tetis
  • Virus de Thorne
  • Virus de la tiña
  • Virus Toutatis
  • Virus de Tulane
  • Vellamovirus
  • Virus vhml
  • Virus vibaki
  • Virus de Wellington
  • Virus de la esposa
  • Virus Winkler
  • Virus de Yokohama
  • Virus Yoloswag
  • Virus Yongloolin

Referencias

  1. ^ Turner D, Shkoporov AN, Lood C, Millard AD, Dutilh BE, Alfenas-Zerbini P, van Zyl LJ, Aziz RK, Oksanen HM, Poranen MM, Kropinski AM, Barylski J, Brister JR, Chanisvili N, Edwards RA, Enault F, Gillis A, Knezevic P, Krupovic M, Kurtböke I, Kushkina A, Lavigne R, Lehman S, Lobocka M, Moraru C, Moreno Switt A, Morozova V, Nakavuma J, Reyes Muñoz A, Rūmnieks J, Sarkar BL, Sullivan MB, Uchiyama J, Wittmann J, Yigang T, Adriaenssens EM (enero de 2023). "Abolición de taxones basados ​​en la morfología y cambio a nombres binomiales de especies: actualización de la taxonomía de 2022 del subcomité de virus bacterianos del ICTV". Archivos de Virología . 168 (2): 74. doi :10.1007/s00705-022-05694-2. PMC  9868039 . Número PMID  36683075.
  2. ^ abc "Viral Zone". ExPASy . Consultado el 1 de julio de 2015 .
  3. ^ abc «Taxonomía de virus: publicación de 2020». Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV). Marzo de 2021. Consultado el 11 de mayo de 2021 .
  4. ^ Tang, SL; Nuttall, S; Dyall-Smith, M (2004). "Halovirus HF1 y HF2: evidencia de un evento de recombinación reciente y de gran magnitud". J Bacteriol . 186 (9): 2810–7. doi :10.1128/JB.186.9.2810-2817.2004. PMC 387818 . PMID  15090523. 
  5. ^ Comeau, AM; Tremblay, D; Moineau, S; Rattei, T; Kushkina, AI; Tovkach, FI; Krisch, HM; Ackermann, HW (2012). "La morfología de los fagos recapitula la filogenia: la genómica comparativa de un nuevo grupo de miovirus". PLOS ONE . ​​7 (7): e40102. Bibcode :2012PLoSO...740102C. doi : 10.1371/journal.pone.0040102 . PMC 3391216 . PMID  22792219. 
  6. ^ J. Bernard Heymann, Bing Wang, William W. Newcomb, Weimin Wu, Dennis C. Winkler, Naiqian Cheng, Erin R. Reilly, Ru-Ching Hsia, Julie A. Thomas, Alasdair C. Steven: La cápside moteada del fago gigante SPN3US de Salmonella , un probable intermediario de la maduración con una nueva envoltura interna. En: Viruses 2020, 12(9). Número especial Fagos gigantes o jumbo , 910. doi:10.3390/v12090910.
  7. ^ Capparelli, Rosanna; et al. (agosto de 2007). "Terapia experimental con fagos contra Staphylococcus aureus en ratones". Agentes antimicrobianos y quimioterapia . 51 (8): 2765–73. doi :10.1128/AAC.01513-06. PMC 1932491. PMID 17517843  . 
  • Zona viral: Myoviridae
  • Televisión ICTV
  • Genomas completos de Myoviridae

Obtenido de "https://es.wikipedia.org/w/index.php?title=Myoviridae&oldid=1228889500"