Miovirus | |
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Imagen TEM de un virión del fago S-PM2 de Synechococcus | |
Clasificación de virus | |
(sin clasificar): | Virus |
Reino : | Duplodnaviria |
Reino: | Virus de Heunggong |
Filo: | Uroviricóta |
Clase: | Caudoviricetes |
Orden: | Caudovirus |
Familia: | Miovirus |
Subfamilias y géneros | |
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Myoviridae era una familia de bacteriófagos del orden Caudovirales . La familia Myoviridae y el orden Caudovirales han sido abolidos en la actualidad, y el término miovirus se utiliza ahora para referirse a la morfología de los virus de esta antigua familia. [1] Las bacterias y las arqueas sirven como huéspedes naturales. Había 625 especies en esta familia, asignadas a ocho subfamilias y 217 géneros. [2] [3]
La subfamilia Tevenvirinae (sinónimo: Tequatrovirinae ) recibe su nombre de su especie tipo, el fago Enterobacteria T4 . Los miembros de esta subfamilia son morfológicamente indistinguibles y tienen cabezas moderadamente alargadas de unos 110 nanómetros (nm) de longitud, colas de 114 nm de longitud con un collar, placas de base con púas cortas y seis fibras de cola largas y enroscadas. Los géneros dentro de esta subfamilia se dividen sobre la base de la morfología de la cabeza, con el género Tequatrovirus (nombre provisional: T4virus ) que tiene una longitud de cabeza de 137 nm y los del género Schizotequatrovirus tienen una longitud de 111 nm. Dentro de los géneros, sobre la base de la homología de proteínas, las especies se han dividido en varios grupos.
La subfamilia Peduovirinae tiene viriones con cabezas de 60 nm de diámetro y colas de 135 × 18 nm. Estos fagos se identifican fácilmente porque las vainas contraídas tienden a deslizarse fuera del núcleo de la cola. El fago P" es la especie tipo.
La subfamilia Spounavirinae son todos fagos virulentos, de amplio espectro de hospedadores que infectan a miembros de Bacillota . Poseen cabezas isométricas de 87-94 nm de diámetro y capsómeros conspicuos , colas estriadas de 140-219 nm de largo y una placa base doble. En la punta de la cola hay estructuras globulares que ahora se sabe que son las espigas de la placa base y fibras de cola cortas y enroscadas con simetría séxtuple. Los miembros de este grupo generalmente poseen genomas grandes (127-142 kb) no permutados con redundancias terminales de 3,1-20 kb. El nombre de esta subfamilia se deriva de SPO más una (del latín "uno").
Los halovirus HF1 y HF2 pertenecen al mismo género, pero como infectan arqueas en lugar de bacterias, es probable que se los coloque en un género separado una vez que se haya establecido su clasificación. [4]
Se ha propuesto un grupo enano sobre bases morfológicas y genómicas. Este grupo incluye los fagos Aeromonas salmonicida fago 56, Vibrio cholerae fagos 138 y CP-T1, Bdellovibrio fago φ1422 y Pectobacterium carotovorum fago ZF40. [5] Sus características compartidas incluyen una morfología de virión idéntica, caracterizada por colas contráctiles generalmente cortas y todos tienen tamaños de genoma de aproximadamente 45 kilobases. El orden de los genes en la unidad estructural del genoma es el siguiente: terminasa—portal—cabeza—cola—placa base—fibras de la cola.
Los virus de la antigua familia Myoviridae no tienen envoltura, tienen geometrías de cabeza y cola (con cuello). Los genomas son ADN lineal de doble cadena, de alrededor de 33-244 kb de longitud. El genoma codifica entre 40 y 415 proteínas. [2] Tiene secuencias redundantes terminales. El contenido de GC es de ~35%. El genoma codifica entre 200 y 300 proteínas que se transcriben en operones. La 5-hidroximetilcitosina puede estar presente en el genoma (en lugar de timidina ).
La cola tubular tiene simetría helicoidal y un diámetro de 16-20 nm. Está formada por un tubo central, una vaina contráctil, un collar, una placa base, seis clavijas de cola y seis fibras largas. Es similar a Tectiviridae , pero se diferencia en que la cola de un miovirus es permanente.
Las contracciones de la cola requieren ATP . Al contraerse la vaina, las subunidades de la vaina se deslizan unas sobre otras y la cola se acorta hasta alcanzar una longitud de entre 10 y 15 nm.
Al unirse a una célula huésped, el virus utiliza su vaina contráctil como una jeringa, perforando la pared celular con su tubo central e inyectando el material genético en el huésped. El ADN inyectado se hace cargo de los mecanismos de transcripción y traducción de la célula huésped y comienza a fabricar nuevos virus. La replicación sigue el modelo de transposición replicativa. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. La traducción se lleva a cabo por desplazamiento del marco ribosómico -1 . El virus sale de la célula huésped por lisis y las proteínas holina / endolisina / spanina. Las bacterias y las arqueas sirven como huésped natural. La ruta de transmisión es la difusión pasiva . [2]
Aunque los miovirus son en general líticos y carecen de los genes necesarios para volverse lisogénicos , se conocen varias especies templadas .
Debido a que la mayoría de los Myoviridae son fagos líticos, en lugar de templados, algunos investigadores han estudiado su uso como terapia para enfermedades bacterianas en humanos y otros animales. [7]
Se reconocen las siguientes ocho subfamilias: [3]
Además, los siguientes géneros no están asignados a una subfamilia: [3]