Información mínima sobre un experimento de microarrays

La información mínima sobre un experimento de microarrays ( MIAME ) es un estándar creado por la Sociedad FGED para informar experimentos de microarrays . ^[1]

MIAME tiene como objetivo especificar toda la información necesaria para interpretar los resultados del experimento de forma inequívoca y reproducirlo potencialmente. Si bien la norma define el contenido requerido para los informes que cumplen con la norma, no especifica el formato en el que se deben presentar estos datos. MIAME describe la información mínima requerida para garantizar que los datos de microarrays se puedan interpretar fácilmente y que los resultados derivados de su análisis se puedan verificar de forma independiente. ^[2] Hay varios formatos de archivo que se utilizan para representar estos datos, así como repositorios públicos y basados en suscripción para dichos experimentos. ^[2] Además, existe software para ayudar a la preparación de informes que cumplen con la norma MIAME.

MIAME gira en torno a seis componentes clave: datos sin procesar , datos normalizados , anotaciones de muestra, diseño experimental , anotaciones de matriz y protocolos de datos.

Referencias

^ "Página de inicio de MIAME". Sitio web de la Sociedad FGED . Consultado el 13 de septiembre de 2012 .
^ ab Brazma, Alvis; Hingamp, Pascal; Quackenbush, John; Sherlock, Gavin; Spellman, Paul; Stoeckert, Chris; Aach, John; Ansorge, Wilhelm; Ball, Catherine A.; Causton, Helen C.; Gaasterland, Terry; Glenisson, Patrick; Holstege, Frank CP; Kim, Irene F.; Markowitz, Victor; Matese, John C.; Parkinson, Helen; Robinson, Alan; Sarkans, Ugis; Schulze-Kremer, Steffen; Stewart, Jason; Taylor, Ronald; Vilo, Jaak; Vingron, Martin (diciembre de 2001). "Información mínima sobre un experimento de microarrays (MIAME): hacia estándares para datos de microarrays". Nature Genetics . 29 (4): 365–371. doi : 10.1038/ng1201-365 . Revista de Biología Molecular y Genética .

[1] "Página de inicio de MIAME". Sitio web de la Sociedad FGED . Consultado el 13 de septiembre de 2012 .

[BrazmaHingamp2001-2] Brazma, Alvis; Hingamp, Pascal; Quackenbush, John; Sherlock, Gavin; Spellman, Paul; Stoeckert, Chris; Aach, John; Ansorge, Wilhelm; Ball, Catherine A.; Causton, Helen C.; Gaasterland, Terry; Glenisson, Patrick; Holstege, Frank CP; Kim, Irene F.; Markowitz, Victor; Matese, John C.; Parkinson, Helen; Robinson, Alan; Sarkans, Ugis; Schulze-Kremer, Steffen; Stewart, Jason; Taylor, Ronald; Vilo, Jaak; Vingron, Martin (diciembre de 2001). "Información mínima sobre un experimento de microarrays (MIAME): hacia estándares para datos de microarrays". Nature Genetics . 29 (4): 365–371. doi : 10.1038/ng1201-365 . Revista de Biología Molecular y Genética .