Peroxisoma

Un peroxisoma ( IPA: [pɛɜˈɹɒksɪˌsoʊm] ) ^[1] es un orgánulo unido a la membrana , un tipo de microcuerpo , que se encuentra en el citoplasma de prácticamente todas las células eucariotas . ^{[2] [3]} Los peroxisomas son orgánulos oxidativos. Con frecuencia, el oxígeno molecular sirve como cosustrato, a partir del cual luego se forma peróxido de hidrógeno (H ₂ O ₂ ). Los peroxisomas deben su nombre a las actividades de generación y eliminación de peróxido de hidrógeno. Desempeñan funciones clave en el metabolismo de los lípidos y la reducción de especies reactivas de oxígeno . ^[4]

Los peroxisomas están involucrados en el catabolismo de ácidos grasos de cadena muy larga , ácidos grasos de cadena ramificada , intermediarios de ácidos biliares (en el hígado), D-aminoácidos y poliaminas . Los peroxisomas también juegan un papel en la biosíntesis de plasmalógenos : fosfolípidos de éter críticos para el funcionamiento normal de cerebros y pulmones de mamíferos. ^[5] Los peroxisomas contienen aproximadamente el 10% de la actividad total de dos enzimas ( glucosa-6-fosfato deshidrogenasa y 6-fosfogluconato deshidrogenasa ) en la vía de la pentosa fosfato , ^[6] que es importante para el metabolismo energético. ^[5] Se debate vigorosamente si los peroxisomas están involucrados en la síntesis de isoprenoides y colesterol en animales. ^[5] Otras funciones peroxisomales incluyen el ciclo del glioxilato en las semillas en germinación (" glioxisomas "), la fotorrespiración en las hojas, ^[7] la glucólisis en los tripanosomas (" glicosomas ") y la oxidación y asimilación de metanol y aminas en algunas levaduras .

Los peroxisomas (microcuerpos) fueron descritos por primera vez por un estudiante de doctorado sueco, J. Rhodin en 1954. ^[8] Fueron identificados como orgánulos por Christian de Duve y Pierre Baudhuin en 1966. ^[9] De Duve y sus colaboradores descubrieron que los peroxisomas contienen varias oxidasas involucradas en la producción de peróxido de hidrógeno (H ₂ O ₂ ), así como una catalasa involucrada en la descomposición de H ₂ O ₂ en oxígeno y agua. ^[10] Debido a su papel en el metabolismo del peróxido, De Duve los denominó "peroxisomas", reemplazando el término morfológico utilizado anteriormente "microcuerpos". Más tarde, se describió que la luciferasa de luciérnaga se dirige a los peroxisomas en células de mamíferos, lo que permitió el descubrimiento de la señal de destino de importación para los peroxisomas y desencadenó muchos avances en el campo de la biogénesis de los peroxisomas. ^{[11] [12]}

Los peroxisomas son compartimentos subcelulares pequeños (0,1–1 μm de diámetro) (orgánulos) con una matriz granular fina y rodeados por una única biomembrana que se encuentran en el citoplasma de una célula. ^{[13] [14]} La compartimentación crea un entorno optimizado para promover diversas reacciones metabólicas dentro de los peroxisomas necesarias para mantener las funciones celulares y la viabilidad del organismo.

El número, tamaño y composición proteica de los peroxisomas son variables y dependen del tipo celular y de las condiciones ambientales. Por ejemplo, en la levadura de panadería ( S. cerevisiae ), se ha observado que, con un buen aporte de glucosa, sólo están presentes unos pocos peroxisomas pequeños. Por el contrario, cuando las levaduras se suministran con ácidos grasos de cadena larga como única fuente de carbono, se pueden formar hasta 20 a 25 peroxisomas grandes. ^[15]

Una de las principales funciones del peroxisoma es la descomposición de los ácidos grasos de cadena muy larga mediante la betaoxidación . En las células animales, los ácidos grasos largos se convierten en ácidos grasos de cadena media , que posteriormente son transportados a las mitocondrias , donde finalmente se descomponen en dióxido de carbono y agua. En las células de levadura y de plantas, este proceso se lleva a cabo exclusivamente en los peroxisomas. ^{[16] [17]}

Las primeras reacciones en la formación de plasmalógeno en células animales también ocurren en los peroxisomas. El plasmalógeno es el fosfolípido más abundante en la mielina . La deficiencia de plasmalógenos causa profundas anomalías en la mielinización de las células nerviosas , que es una de las razones por las que muchos trastornos peroxisomales afectan al sistema nervioso. ^[16] Los peroxisomas también desempeñan un papel en la producción de ácidos biliares importantes para la absorción de grasas y vitaminas liposolubles, como las vitaminas A y K. Los trastornos de la piel son características de los trastornos genéticos que afectan la función de los peroxisomas como resultado. ^[17]

Las vías metabólicas específicas que ocurren exclusivamente en los peroxisomas de mamíferos son: ^[5]

• α-oxidación del ácido fitánico
• β-oxidación de ácidos grasos de cadena muy larga y poliinsaturados
• Biosíntesis de plasmalógenos
• Conjugación del ácido cólico como parte de la síntesis de ácidos biliares.

Los peroxisomas contienen enzimas oxidativas , como la D-aminoácido oxidasa y la ácido úrico oxidasa . ^[18] Sin embargo, la última enzima está ausente en los humanos, lo que explica la enfermedad conocida como gota , causada por la acumulación de ácido úrico. Ciertas enzimas dentro del peroxisoma, al usar oxígeno molecular, eliminan átomos de hidrógeno de sustratos orgánicos específicos (etiquetados como R), en una reacción oxidativa, produciendo peróxido de hidrógeno (H ₂ O ₂ , tóxico en sí mismo):

${\displaystyle \mathrm {RH} _{\mathrm {2} }+\mathrm {O} _{\mathrm {2} }\rightarrow \mathrm {R} +\mathrm {H} _{2}\mathrm { O} _{2}}$

La catalasa, otra enzima peroxisomal, utiliza este H ₂ O ₂ para oxidar otros sustratos, incluidos fenoles , ácido fórmico , formaldehído y alcohol , mediante la reacción de peroxidación:

${\displaystyle \mathrm {H} _{2}\mathrm {O} _{2}+\mathrm {R'H} _{2}\rightarrow \mathrm {R'} +2\mathrm {H} _{ 2}\mathrm {O} }$, eliminando así el venenoso peróxido de hidrógeno en el proceso.

Esta reacción es importante en las células del hígado y los riñones, donde los peroxisomas desintoxican diversas sustancias tóxicas que entran en la sangre. Alrededor del 25% del etanol que los humanos consumen al beber bebidas alcohólicas se oxida a acetaldehído de esta manera. ^[16] Además, cuando el exceso de H ₂ O ₂ se acumula en la célula, la catalasa lo convierte en H ₂ O a través de esta reacción:

${\displaystyle 2\mathrm {H} _{2}\mathrm {O} _{2}\rightarrow 2\mathrm {H} _{2}\mathrm {O} +\mathrm {O} _{2}}$

En las plantas superiores, los peroxisomas contienen también una batería compleja de enzimas antioxidantes como la superóxido dismutasa , los componentes del ciclo del ascorbato-glutatión y las NADP-deshidrogenasas de la vía de las pentosas-fosfato. Se ha demostrado que los peroxisomas generan radicales superóxido (O ₂ ^•− ) y óxido nítrico ( ^• NO). ^{[19] [20]}

Actualmente existen evidencias de que esas especies reactivas de oxígeno, incluido el H ₂ O ₂ peroxisómico, también son moléculas de señalización importantes en plantas y animales y contribuyen al envejecimiento saludable y a los trastornos relacionados con la edad en los seres humanos. ^[21]

El peroxisoma de las células vegetales se polariza al luchar contra la penetración de hongos. La infección hace que se produzca una molécula de glucosinolato que desempeña una función antifúngica y se distribuya al exterior de la célula mediante la acción de las proteínas peroxisomales (PEN2 y PEN3). ^[22]

Los peroxisomas en mamíferos y humanos también contribuyen a la defensa antiviral. ^[23] y al combate de patógenos ^[24]

Los peroxisomas se derivan del retículo endoplasmático liso bajo ciertas condiciones experimentales y se replican por crecimiento de membrana y división de orgánulos preexistentes. ^{[25] [26] [27]} Las proteínas de la matriz de peroxisomas se traducen en el citoplasma antes de la importación. Las secuencias de aminoácidos específicas (PTS o señal de orientación peroxisomal ) en el extremo C (PTS1) o N-terminal (PTS2) de las proteínas de la matriz peroxisomal les indican que se importen al orgánulo mediante un factor de orientación. Actualmente hay 36 proteínas conocidas involucradas en la biogénesis y el mantenimiento de los peroxisomas, llamadas peroxinas , ^[28] que participan en el proceso de ensamblaje de peroxisomas en diferentes organismos. En las células de mamíferos hay 13 peroxinas caracterizadas. A diferencia de la importación de proteínas al retículo endoplasmático (RE) o las mitocondrias, las proteínas no necesitan desplegarse para ser importadas al lumen del peroxisoma. Los receptores de importación de proteínas de la matriz, las peroxinas PEX5 y PEX7 , acompañan a sus cargas (que contienen una secuencia de aminoácidos PTS1 o PTS2, respectivamente) hasta el peroxisoma, donde liberan la carga en la matriz peroxisomal y luego regresan al citosol , un paso llamado reciclaje . Una forma especial de orientación de proteínas peroxisomales se llama piggy backing. Las proteínas que se transportan por este método único no tienen un PTS canónico, sino que se unen a una proteína PTS para ser transportadas como un complejo. ^[29] Un modelo que describe el ciclo de importación se conoce como el mecanismo de lanzadera extendido . ^[30] Ahora hay evidencia de que la hidrólisis de ATP es necesaria para el reciclaje de receptores al citosol. Además, la ubiquitinación es crucial para la exportación de PEX5 desde el peroxisoma al citosol. La biogénesis de la membrana peroxisomal y la inserción de las proteínas de membrana peroxisómica (PMP) requieren las peroxinas PEX19, PEX3 y PEX16. PEX19 es un receptor y chaperona de PMP que se une a las PMP y las dirige a la membrana peroxisomal, donde interactúa con PEX3, una proteína integral de membrana peroxisomal. Las PMP se insertan luego en la membrana peroxisomal.

La degradación de los peroxisomas se denomina pexofagia. ^[31]

Las diversas funciones de los peroxisomas requieren interacciones dinámicas y cooperación con muchos orgánulos involucrados en el metabolismo lipídico celular, como el retículo endoplásmico, las mitocondrias, las gotas lipídicas y los lisosomas. ^[32]

Los peroxisomas interactúan con las mitocondrias en varias vías metabólicas, incluida la β-oxidación de ácidos grasos y el metabolismo de especies reactivas de oxígeno. ^[5] Ambos orgánulos están en estrecho contacto con el retículo endoplasmático y comparten varias proteínas, incluidos los factores de fisión de orgánulos. ^[33] Los peroxisomas también interactúan con el retículo endoplasmático y cooperan en la síntesis de lípidos de éter (plasmalógenos), que son importantes para las células nerviosas (ver arriba). En los hongos filamentosos, los peroxisomas se mueven en los microtúbulos mediante "autostop", un proceso que implica el contacto con endosomas tempranos que se mueven rápidamente. ^[34] El contacto físico entre orgánulos a menudo está mediado por sitios de contacto de membrana, donde las membranas de dos orgánulos están físicamente atadas para permitir la transferencia rápida de moléculas pequeñas, permiten la comunicación de orgánulos y son cruciales para la coordinación de las funciones celulares y, por lo tanto, la salud humana. ^[35] Se han observado alteraciones de los contactos de membrana en varias enfermedades.

Los trastornos peroxisomales son una clase de afecciones médicas que afectan típicamente al sistema nervioso humano, así como a muchos otros sistemas orgánicos. Dos ejemplos comunes son la adrenoleucodistrofia ligada al cromosoma X y los trastornos de la biogénesis de los peroxisomas . ^{[36] [37]}

Los genes PEX codifican la maquinaria proteica (peroxinas) necesaria para el ensamblaje adecuado del peroxisoma. Las proteínas de membrana peroxisomal se importan a través de al menos dos rutas, una de las cuales depende de la interacción entre la peroxina 19 y la peroxina 3, mientras que la otra es necesaria para la importación de la peroxina 3, cualquiera de las cuales puede ocurrir sin la importación de enzimas de la matriz (lumen), que poseen la señal de orientación peroxisomal PTS1 o PTS2 como se discutió previamente. ^[38] La elongación de la membrana del peroxisoma y la fisión final del orgánulo están reguladas por Pex11p. ^[39]

Los genes que codifican las proteínas peroxinas incluyen: PEX1 , PEX2 (PXMP3), PEX3 , PEX5 , PEX6 , PEX7 , PEX9, ^{[40] [41]} PEX10 , PEX11A , PEX11B , PEX11G , PEX12 , PEX13 , PEX14 , PEX16 , PEX19, PEX26 , PEX28 , PEX30 y PEX31. Entre organismos, la numeración y la función de PEX pueden diferir.

El contenido proteico de los peroxisomas varía según la especie u organismo, pero la presencia de proteínas comunes a muchas especies se ha utilizado para sugerir un origen endosimbiótico ; es decir, los peroxisomas evolucionaron a partir de bacterias que invadieron células más grandes como parásitos y desarrollaron muy gradualmente una relación simbiótica. ^[42] Sin embargo, esta visión ha sido cuestionada por descubrimientos recientes. ^[43] Por ejemplo, los mutantes sin peroxisomas pueden restaurar los peroxisomas tras la introducción del gen de tipo salvaje.

Dos análisis evolutivos independientes del proteoma peroxisomal encontraron homologías entre la maquinaria de importación peroxisomal y la vía ERAD en el retículo endoplásmico , ^{[44] [45]} junto con una serie de enzimas metabólicas que probablemente fueron reclutadas de las mitocondrias . ^[45] El peroxisoma puede haber tenido un origen Actinomycetota ; ^[46] sin embargo, esto es controvertido. ^[47]

Otros orgánulos de la familia de microcuerpos relacionados con los peroxisomas incluyen los glioxisomas de plantas y hongos filamentosos , los glicosomas de los cinetoplastos , ^[48] y los cuerpos de Woronin de los hongos filamentosos.

• Receptor activado por el proliferador de peroxisomas

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El Departamento de Biología Celular

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• PeroxisomeDB: Base de datos de peroxisomas
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