Ligadura de ligamentos

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Proteína de unión de extremos no homóloga multifuncional LigD
Proteína de unión de extremos no homóloga multifuncional LigD
Identificadores
Organismo	Mycolicibacterium smegmatis ATCC 700084
Símbolo	ligadura
Protección unificada	A0R3R7
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LigD es una ligasa / polimerasa / nucleasa multifuncional (3'-fosfoesterasa) que se encuentra en los sistemas de reparación de ADN de unión de extremos no homólogos (NHEJ) bacterianos. ^[1] Es mucho más propensa a errores que el sistema eucariota más complejo de NHEJ, que utiliza múltiples enzimas para cumplir su función. ^[2] La polimerasa utiliza preferentemente rNTP (nucleótidos de ARN), posiblemente ventajoso en células inactivas. ^[3]

La arquitectura actual de LigD es variable.

El homólogo LigD en Bacillus subtilis no tiene el dominio nucleasa.
La LigD con su dominio de ligasa eliminado artificialmente puede realizar su función (con pérdida de fidelidad) con una LigC separada que actúa como ligasa. ^[2]
El homólogo de LigD en la arqueona Methanocella paludicola se divide en tres proteínas de dominio único que comparten un operón. ^[4]

Referencias

^ Della M, Palmbos PL, Tseng HM, et al. (octubre de 2004). "Las proteínas Ku y ligasa micobacterianas constituyen una máquina de reparación NHEJ de dos componentes". Science . 306 (5696): 683–5. Bibcode :2004Sci...306..683D. doi :10.1126/science.1099824. PMID 15499016. S2CID 38823696.
^ ab Gong C, Bongiorno P, Martins A, et al. (abril de 2005). "Mecanismo de unión de extremos no homólogos en micobacterias: un sistema de reparación de baja fidelidad impulsado por Ku, ligasa D y ligasa C". Nat. Struct. Mol. Biol . 12 (4): 304–12. doi :10.1038/nsmb915. PMID 15778718. S2CID 6879518.
^ Pitcher RS, Green AJ, Brzostek A, Korycka-Machala M, Dziadek J, Doherty AJ (septiembre de 2007). "NHEJ protege a las micobacterias en fase estacionaria contra los efectos nocivos de la desecación" (PDF) . Reparación del ADN (Amst.) . 6 (9): 1271–6. doi :10.1016/j.dnarep.2007.02.009. PMID 17360246.
^ Bartlett, EJ; Brissett, NC; Doherty, AJ (28 de mayo de 2013). "Se requiere resección ribonucleolítica para la reparación de intermediarios de unión de extremos no homólogos desplazados de hebras". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (22): E1984-91. Bibcode :2013PNAS..110E1984B. doi : 10.1073/pnas.1302616110 . PMC 3670387 . PMID 23671117.

[pmid15499016-1] Della M, Palmbos PL, Tseng HM, et al. (octubre de 2004). "Las proteínas Ku y ligasa micobacterianas constituyen una máquina de reparación NHEJ de dos componentes". Science . 306 (5696): 683–5. Bibcode :2004Sci...306..683D. doi :10.1126/science.1099824. PMID 15499016. S2CID 38823696.

[pmid15778718-2] Gong C, Bongiorno P, Martins A, et al. (abril de 2005). "Mecanismo de unión de extremos no homólogos en micobacterias: un sistema de reparación de baja fidelidad impulsado por Ku, ligasa D y ligasa C". Nat. Struct. Mol. Biol . 12 (4): 304–12. doi :10.1038/nsmb915. PMID 15778718. S2CID 6879518.

[pmid17360246-3] Pitcher RS, Green AJ, Brzostek A, Korycka-Machala M, Dziadek J, Doherty AJ (septiembre de 2007). "NHEJ protege a las micobacterias en fase estacionaria contra los efectos nocivos de la desecación" (PDF) . Reparación del ADN (Amst.) . 6 (9): 1271–6. doi :10.1016/j.dnarep.2007.02.009. PMID 17360246.

[4] Bartlett, EJ; Brissett, NC; Doherty, AJ (28 de mayo de 2013). "Se requiere resección ribonucleolítica para la reparación de intermediarios de unión de extremos no homólogos desplazados de hebras". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 110 (22): E1984-91. Bibcode :2013PNAS..110E1984B. doi : 10.1073/pnas.1302616110 . PMC 3670387 . PMID 23671117.