Actinomicetos

Filo de bacterias

Actinomicetos
Micrografía electrónica de barrido de Actinomyces israelii .
Clasificación científica Editar esta clasificación
Dominio:Bacteria
Clado :Terrabacteria
Filo:Actinomycetota
Goodfellow 2021 [1]
Tipo género
Actinomices
Harz 1877 (Listas aprobadas 1980)
Clases [2]
Sinónimos
  • "Actinobacteraeota" Oren y col . 2015
  • "Actinobacterias" Goodfellow 2012 [3]
  • "Actinobacteria" Margulis 1974 ex Cavalier-Smith 2020
  • "Actinobacterias" Stackebrandt, Rainey y Ward-Rainey 1997
  • "Actinobacteriota" Whitman y otros . 2018
  • "Actinomicetos" Krasil'nikov 1949

Los Actinomycetota (o Actinobacteria ) son un filo diverso de bacterias Gram-positivas con alto contenido de GC . [4] Pueden ser terrestres o acuáticos . [5] Son de gran importancia para la flora terrestre debido a sus contribuciones a los sistemas del suelo . En el suelo ayudan a descomponer la materia orgánica de los organismos muertos para que las moléculas puedan ser absorbidas nuevamente por las plantas . Si bien esta función también la desempeñan los hongos , los Actinomycetota son mucho más pequeños y probablemente no ocupan el mismo nicho ecológico . En esta función, las colonias a menudo desarrollan micelios extensos , como lo hacen los hongos, y el nombre de un orden importante del filo, Actinomycetales (los actinomicetos), refleja que durante mucho tiempo se creyó que eran hongos. Algunos actinomicetos del suelo (como Frankia ) viven simbióticamente con las plantas cuyas raíces impregnan el suelo, fijando nitrógeno para las plantas a cambio del acceso a algunos de los sacáridos de la planta . Otras especies, como muchos miembros del género Mycobacterium , son patógenos importantes .

Más allá del gran interés que despiertan los actinomicetos por su papel en el suelo, todavía queda mucho por aprender sobre ellos. Aunque actualmente se los entiende principalmente como bacterias del suelo, podrían ser más abundantes en aguas dulces. [6] Los actinomicetos son uno de los filos bacterianos dominantes y contienen uno de los géneros bacterianos más grandes, Streptomyces . [7] Los Streptomyces y otros actinomicetos son importantes contribuyentes a la amortiguación biológica de los suelos. [8] También son la fuente de muchos antibióticos . [9] [10]

El género Actinomycetota Bifidobacterium es la bacteria más común en el microbioma de los bebés humanos. [11] Aunque los adultos tienen menos bifidobacterias, las bifidobacterias intestinales ayudan a mantener la barrera mucosa y reducen el lipopolisacárido en el intestino. [12]

Aunque algunas de las células bacterianas más grandes y complejas pertenecen a Actinomycetota, se ha descrito al grupo de Actinomarinales marinos como el que posee las células procariotas de vida libre más pequeñas . [13]

Se dice que algunos Actinomycetota siberianos o antárticos son los organismos vivos más antiguos de la Tierra, congelados en el permafrost hace alrededor de medio millón de años. [14] [15] Los síntomas de vida se detectaron por la liberación de CO2 de muestras de permafrost de 640 kya o menos. [16]

General

La mayoría de los Actinomycetota de importancia médica o económica pertenecen a la clase Actinomycetia y al orden Actinomycetales . Si bien muchos de ellos causan enfermedades en los seres humanos, Streptomyces es notable como fuente de antibióticos . [10]

De los Actinomycetota que no están incluidos en Actinomycetales, Gardnerella es uno de los más investigados. La clasificación de Gardnerella es controvertida y MeSH la cataloga como organismo tanto grampositivo como gramnegativo . [17]

Los actinomicetos, especialmente Streptomyces spp., son reconocidos como productores de muchos metabolitos bioactivos que son útiles para los humanos en medicina, como antibacterianos, [18] antifúngicos, [19] antivirales, antitrombóticos, inmunomodificadores, fármacos antitumorales e inhibidores de enzimas; y en la agricultura, incluidos insecticidas, herbicidas, fungicidas y sustancias promotoras del crecimiento de plantas y animales. [20] Los antibióticos derivados de actinomicetos que son importantes en medicina incluyen aminoglucósidos, antraciclinas, cloranfenicol, macrólidos, tetraciclinas, etc. [ cita requerida ]

Los Actinomycetota tienen un alto contenido de guanina y citosina en su ADN . [21] El contenido de G+C de los Actinomycetota puede ser tan alto como 70%, aunque algunos pueden tener un bajo contenido de G+C. [22]

Se ha sugerido el análisis de la secuencia de la glutamina sintetasa para el análisis filogenético de Actinomycetota. [23]

Filogenia

Filogenia basada en el genoma completo [24]LTP basado en ARNr 16S _12_2021 [25] [26] [27]GTDB 08-RS214 [28] [29] [30]

Taxonomía

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con relevancia en la nomenclatura (LPSN) [2] y el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI). [31]

Véase también

Referencias

  1. ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Publicación válida de los nombres de cuarenta y dos filos de procariotas". Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID  34694987. S2CID  239887308.
  2. ^ de Euzéby JP, Parte AC. "Actinobacteria". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN). Archivado desde el original el 6 de mayo de 2021. Consultado el 7 de junio de 2021 .
  3. ^ Goodfellow M (2012). "Filo XXVI. Actinobacteria phyl. nov." En Goodfellow M, Kämpfer P, Trujillo ME, Suzuki K, Ludwig W, Whitman WB (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology . Vol. 5 (2.ª ed.). Nueva York, NY: Springer. págs. 33–34.
  4. ^ Gao B, Gupta RS (marzo de 2012). "Marco filogenético y firmas moleculares para los principales clados del filo Actinobacteria". Microbiology and Molecular Biology Reviews . 76 (1): 66–112. doi :10.1128/MMBR.05011-11. PMC 3294427 . PMID  22390973. 
  5. ^ Servin JA, Herbold CW, Skophammer RG, Lake JA (enero de 2008). "Evidencia que excluye la raíz del árbol de la vida de las actinobacterias". Mol. Biol. Evol . 25 (1): 1–4. doi : 10.1093/molbev/msm249 . PMID  18003601.
  6. ^ Ghai R, Rodriguez-Valera F, McMahon KD, Toyama D, Rinke R, Cristina Souza de Oliveira T, et al. (2011). Lopez-Garcia P (ed.). "Metagenómica de la columna de agua en el curso superior prístino del río Amazonas". PLOS ONE . ​​6 (8): e23785. Bibcode :2011PLoSO...623785G. doi : 10.1371/journal.pone.0023785 . PMC 3158796 . PMID  21915244. 
  7. ^ Hogan CM (2010). "Bacterias". En Draggan S, Cleveland CJ (eds.). Enciclopedia de la Tierra . Washington DC: Consejo Nacional para la Ciencia y el Medio Ambiente. Archivado desde el original el 11 de mayo de 2011.
  8. ^ Ningthoujam DS, Sanasam S, Tamreihao K, Nimaichand S (noviembre de 2009). "Actividades antagónicas de aislamientos de actinomicetos locales contra patógenos fúngicos del arroz". Revista Africana de Investigación en Microbiología . 3 (11): 737–742.
  9. ^ Donald, Lavinia; Pipite, Atanas; Subramani, Ramesh; Owen, Jeremy; Keyzers, Robert A.; Taufa, Taitusi (2022). "Streptomyces: sigue siendo el mayor productor de nuevos metabolitos secundarios naturales, una perspectiva actual". Investigación en microbiología . 13 (3): 418–465. doi : 10.3390/microbiolres13030031 . ISSN  2036-7481.
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  13. ^ Ghai R, Mizuno CM, Picazo A, Camacho A, Rodriguez-Valera F (2013). "La metagenómica descubre un nuevo grupo de actinobacterias marinas ultrapequeñas y de bajo GC". Scientific Reports . 3 : 2471. Bibcode :2013NatSR...3E2471G. doi :10.1038/srep02471. PMC 3747508 . PMID  23959135. 
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  27. ^ "Notas de la versión LTP_12_2021" (PDF) . Archivado (PDF) del original el 28 de febrero de 2022 . Consultado el 23 de febrero de 2021 .
  28. ^ "GTDB release 08-RS214". Base de datos de taxonomía del genoma . Archivado desde el original el 26 de octubre de 2022. Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  29. ^ "bac120_r214.sp_label". Base de datos de taxonomía del genoma . Archivado desde el original el 16 de mayo de 2023. Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  30. ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Archivado desde el original el 1 de noviembre de 2021. Consultado el 10 de mayo de 2023 .
  31. ^ Schoch CL, Ciufo S, Domrachev M, Hotton CL, Kannan S, Khovanskaya R, et al. "Actinobacteria". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Archivado desde el original el 17 de abril de 2021. Consultado el 20 de marzo de 2021 .

Lectura adicional

  • Baltz RH (2005). "Descubrimiento de antibióticos a partir de actinomicetos: ¿se producirá un renacimiento tras el declive y la caída?". SIM News . 55 : 186–196.
  • Baltz RH (2007). "Antimicrobianos de actinomicetos: regreso al futuro". Microbe . 2 (3): 125–131. Archivado desde el original el 31 de diciembre de 2013.
  • Pandey B, Ghimire P, Agrawal VP (12-15 de enero de 2004). Estudios sobre la actividad antibacteriana de los actinomicetos aislados de la región de Khumbu en Nepal (PDF) . Conferencia internacional sobre el Gran Himalaya: clima, salud, ecología, gestión y conservación. Katmandú. Archivado desde el original (PDF) el 10 de agosto de 2013.
  • Base de datos del genoma de actinomicetos
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