Ligasa
En bioquímica , una ligasa es una enzima que puede catalizar la unión ( ligación ) de dos moléculas mediante la formación de un nuevo enlace químico . Esto se produce normalmente mediante la hidrólisis de un pequeño grupo químico colgante en una de las moléculas, lo que suele dar lugar a la formación de nuevos enlaces CO, CS o CN. Por ejemplo, la ADN ligasa puede unir dos fragmentos complementarios de ácido nucleico mediante la formación de enlaces fosfodiéster y reparar roturas monocatenarias que surgen en el ADN bicatenario durante la replicación.
En general, una ligasa cataliza la siguiente reacción de deshidratación, uniendo así las moléculas A y B:
A-OH + BH → A–B + H2O
Nomenclatura
La denominación de las ligasas es inconsistente y, por lo tanto, estas enzimas se conocen comúnmente con varios nombres diferentes. Generalmente, los nombres comunes de las ligasas incluyen la palabra "ligasa", como en ADN ligasa , una enzima comúnmente utilizada en los laboratorios de biología molecular para unir fragmentos de ADN . Sin embargo, muchos nombres comunes utilizan el término "sintetasa" o "sintasa" en su lugar, porque se utilizan para sintetizar nuevas moléculas. [1] También hay algunas ligasas que utilizan el nombre "carboxilasa" para indicar que la enzima cataliza específicamente una reacción de carboxilación .
Nota: la nomenclatura bioquímica a veces ha distinguido sintetasas de sintasas y a veces ha tratado las palabras como sinónimos . [2] Comúnmente, los dos términos se usan indistintamente y ambos se utilizan para describir ligasas.
Clasificación
Las ligasas se clasifican como EC 6 en la clasificación de enzimas por número EC . Las ligasas se pueden clasificar además en seis subclases:
- EC 6.1 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-oxígeno.
- EC 6.2 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-azufre.
- EC 6.3 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-nitrógeno (incluida la argininosuccinato sintetasa ).
- EC 6.4 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces carbono-carbono, como la acetil-CoA carboxilasa.
- EC 6.5 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces de éster fosfórico , como la ligasa de ADN.
- EC 6.6 incluye ligasas utilizadas para formar enlaces nitrógeno-metal, como en las quelatasas.
Ligasas asociadas a membrana
Algunas ligasas se asocian con membranas biológicas como proteínas de membrana periféricas o ancladas a través de una única hélice transmembrana , [3] por ejemplo ciertas proteínas relacionadas con la ligasa de ubiquitina .
Etimología y pronunciación
La palabra ligasa utiliza formas combinadas de lig- (del verbo latino ligāre , "unir" o "atar") + -asa (que denota una enzima), dando como resultado "enzima de unión".
Véase también
Referencias
- ^ "IntEnz - EC 6". www.ebi.ac.uk . Consultado el 2 de mayo de 2023 .
- ^ "Sintetasas - Ligasas - Enzimas - Productos". www.axonmedchem.com . Consultado el 2 de mayo de 2023 .
- ^ Superfamilias de ligasas transmembrana de un solo paso en la base de datos Membranome
- Introducción a EC 6 del Departamento de Química de Queen Mary, Universidad de Londres
