Timina-ADN glicosilasa

TDG
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de UniProt Humano: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	1WYW, 2D07, 2RBA, 3UFJ, 3UO7, 3UOB, 4FNC, 4JGC, 4XEG, 4Z3A, 4Z47, 4Z7B, 4Z7Z, 5CYS
Identificadores
Alias	TDG , hTimina-ADN glicosilasa, timina ADN glicosilasa
Identificaciones externas	OMIM : 601423; MGI : 3645587; HomoloGene : 2415; Tarjetas genéticas : TDG; OMA :TDG - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 12 (humano)
Fin	103.988.874 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	célula de la mucosa bucal; ; pleura visceral; ; tibia; ; célula endotelial; ; epitelio de la nasofaringe; ; epitelio gingival; ; pleura parietal; ; líquido amniótico; ; epitelio germinal; ; folículo piloso;
	n / A
	Más datos de expresión de referencia
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	Actividad de homodimerización de proteínas.; Actividad correguladora de la transcripción; unión del ADN dañada; unión de proteínas; unión del ADN bicatenario; actividad hidrolasa; unión de la proteína quinasa C; unión del factor de transcripción; Actividad de la ADN N-glicosilasa; unión de ADN no coincidente; unión específica del dominio de proteína; Unión del ADN; unión de iones de magnesio; Actividad de la ADN N-glicosilasa de uracilo; Unión de ATP; Actividad de la ADN N-glicosilasa de pares de bases desapareados específicos de pirimidina; unión de iones de sodio; unión de iones cloruro; Vinculación SUMO; autoasociación de proteínas; Actividad de la uracilo-ADN glicosilasa específica del desajuste G/U;
Componente celular	Cuerpo de PML; membrana plasmática; nucleoplasm; núcleo;
Proceso biológico	regulación de la transcripción, plantilla de ADN; desarrollo del embrión; Regulación negativa de la unión de la cromatina.; desmetilación oxidativa del ADN; Regulación negativa de la transcripción por la ARN polimerasa II; regulación negativa de la unión de proteínas; transcripción, plantilla de ADN; Respuesta celular al estímulo de daño del ADN; despirimidinación; Desmetilación del ADN; reparación por escisión de base; Reparación del ADN; Reparación de desajustes de ADN; regulación de la expresión genética, epigenética; reparación por escisión de base, formación del sitio AP; Regulación de la actividad de la ADN N-glicosilasa; organización de la cromatina; regulación del desarrollo embrionario;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	6996
	545124
	ENSG00000139372
	n / A
	Q13569
	n / A
	NM_001008411 ; NM_003211 ; NM_001363612
	XM_006521630
	NP_003202 ; NP_001350541
	n / A
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La ADN glicosilasa de timina específica para el desajuste G/T es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen TDG . ^[4]^[5]^[6] Varias proteínas bacterianas tienen una fuerte homología de secuencia con esta proteína. ^[7]

Función

La proteína codificada por este gen pertenece a la familia de las glicosilasas de ADN TDG/mug . La glicosilasa de ADN-timina (TDG) elimina las fracciones de timina de los emparejamientos incorrectos G/T hidrolizando el enlace carbono-nitrógeno entre la cadena principal de azúcar-fosfato del ADN y la timina desapareada. Con una actividad menor, esta enzima también elimina la timina de los emparejamientos incorrectos C/T y T/T. La TDG también puede eliminar el uracilo y el 5-bromouracilo de los emparejamientos incorrectos con guanina. Los modelos de ratones con TDG inactivado no mostraron un aumento en la frecuencia de emparejamientos incorrectos, lo que sugiere que otras enzimas, como el homólogo funcional MBD4, pueden proporcionar redundancia funcional. Este gen puede tener un pseudogén en el brazo p del cromosoma 12. ^[6]

Además, en 2011, se informó que la ADN glicosilasa de timina humana (hTDG) escinde de manera eficiente la 5-formilcitosina (5fC) y la 5-carboxilcitosina (5caC), los productos de oxidación clave de la 5-metilcitosina en el ADN genómico. ^[8] Más tarde, se publicó la estructura cristalina del dominio catalítico de hTDG en complejo con ADN dúplex que contiene 5caC, lo que respalda el papel de TDG en la desmetilación de la 5-metilcitosina en mamíferos. ^[9]

Interacciones

Se ha demostrado que la timina-ADN glicosilasa interactúa con:

Proteína de unión a CREB , ^[10]
Receptor de estrógeno alfa , ^[11]
Proteína de leucemia promielocítica , ^[12]
SUMO3 , ^[13] y
Pequeño modificador relacionado con la ubiquitina 1. [ ^13]^[14]

Mapa interactivo de rutas

Haga clic en los genes, proteínas y metabolitos que aparecen a continuación para acceder a los artículos correspondientes. ^{[§ 1]}

^ El mapa de la ruta interactiva se puede editar en WikiPathways: "FluoropyrimidineActivity_WP1601".

Véase también

Referencias

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Lectura adicional

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