Eugenio Koonin
Biólogo estadounidense
Eugenio Koonin
Nacido
Eugene V. Koonin

( 26 de octubre de 1956 )26 de octubre de 1956 (68 años)
Moscú
CiudadaníaEstados Unidos
Alma máterUniversidad Estatal de Moscú (1978)
Carrera científica
CamposBiología computacional
InstitucionesCentro Nacional de Información Biotecnológica
TesisOrganización multienzimática de los complejos de replicación del virus de la encefalomiocarditis  (1983)
Asesor de doctoradoVadim I. Agol
Sitio webwww.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Koonin/

Eugene Viktorovich Koonin (en ruso: Евге́ний Ви́кторович Ку́нин; nacido el 26 de octubre de 1956) es un biólogo ruso-estadounidense e investigador principal del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). Es un reconocido experto en el campo de la biología evolutiva y computacional . [1] [2] [3]

Educación

Koonin obtuvo una maestría en ciencias en 1978 y un doctorado en 1983 en biología molecular , ambos en el Departamento de Biología de la Universidad Estatal de Moscú . Su tesis doctoral, titulada "Organización multienzimática de los complejos de replicación del virus de la encefalomiocarditis", fue supervisada por Vadim I. Agol . [4]

Investigación

Desde 1985 hasta 1991, Koonin trabajó como científico investigador en biología computacional en los Institutos de Poliomielitis y Microbiología de la Academia de Ciencias Médicas de la URSS , estudiando bioquímica de virus y genética bacteriana. En 1991, Koonin se trasladó al NCBI, donde ha ocupado un puesto de investigador principal desde 1996. [4]

Los principales objetivos de investigación de Koonin incluyen el análisis comparativo de genomas secuenciados y métodos automáticos para la anotación a escala del genoma de las funciones genéticas. [5] También investiga en la aplicación de la genómica comparativa para el análisis filogenético, la reconstrucción de formas de vida ancestrales y la construcción de escenarios evolutivos a gran escala, así como el modelado matemático de la evolución del genoma . [6] [7] [8] La investigación de Koonin también investiga el estudio computacional de las principales transiciones en la evolución de la vida, como el origen de los eucariotas , [9] la evolución de la señalización eucariota y las vías de desarrollo desde la perspectiva genómica comparativa. [10]

Koonin es un defensor de la síntesis evolutiva extendida . [11]

En 2011, Koonin expuso sus puntos de vista sobre la evolución en el libro "La lógica del azar: la naturaleza y el origen de la evolución biológica". [2]

Carrera

Koonin ha trabajado como profesor adjunto en el Instituto de Tecnología de Georgia , la Universidad de Boston y la Universidad de Haifa . [4] [12]

A partir de 2014, Koonin forma parte del consejo editorial asesor de Trends in Genetics , [13] y es coeditor en jefe de la revista de acceso abierto Biology Direct . [14] Fue miembro del consejo editorial de Bioinformatics desde 1999 hasta 2001. Koonin también es miembro del consejo asesor en bioinformática en Faculty of 1000. [ 15]

En 2016 fue elegido miembro de la Academia Nacional de Ciencias . [16] [17]

En 2016, el programa de inteligencia artificial Semantic Scholar incluyó a Koonin en su lista de los diez investigadores biomédicos más influyentes. [18]

Posiciones políticas

En febrero de 2022, firmó una carta abierta de científicos rusos condenando la invasión rusa de Ucrania en 2022 , [19] y renunció a su membresía en la Academia de Ciencias de Rusia en protesta. [20]

Referencias

  1. ^ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/CBBresearch/Koonin/ Página de Koonin en el Centro Nacional de Información Biotecnológica
  2. ^ por Eugene V. Koonin (23 de junio de 2011). La lógica del azar: la naturaleza y el origen de la evolución biológica. FT Press. ISBN 978-0-13-262317-9. Recuperado el 5 de abril de 2013 .
  3. ^ Koonin, EV (2004). "Eugene V. Koonin". Current Biology . 14 (3): R96–97. doi : 10.1016/j.cub.2004.01.010 . PMID  14986627.
  4. ^ abc "CV E. Koonin". Instituto de Evolución de Haifa . Archivado desde el original el 29 de julio de 2019. Consultado el 28 de julio de 2020 .
  5. ^ Lander, ES ; Linton, M.; Birren, B.; Nusbaum, C.; Zody, C.; Baldwin, J.; Devon, K.; Dewar, K.; Doyle, M.; Fitzhugh, W.; Funke, R.; calibre, D.; Harris, K.; Heaford, A.; Howland, J.; Kann, L.; Lehoczky, J.; Levine, R.; McEwan, P.; McKernan, K.; Meldrim, J.; Mesirov, JP; Miranda, C.; Morris, W.; Naylor, J.; Raymond, C.; Rosetti, M.; Santos, R.; Sheridan, A.; et al. (febrero de 2001). «Secuenciación inicial y análisis del genoma humano» (PDF) . Naturaleza . 409 (6822): 860–921. Código Bibliográfico :2001Natur.409..860L. doi : 10.1038/35057062 . ISSN  0028-0836. PMID  11237011.
  6. ^ Koonin, EV (2011). Bourne, Philip E. (ed.). "¿Existen leyes de la evolución del genoma?". PLOS Computational Biology . 7 (8): e1002173. arXiv : 1108.3589 . Bibcode :2011PLSCB...7E2173K. doi : 10.1371/journal.pcbi.1002173 . PMC 3161903 . PMID  21901087.  Icono de acceso abierto
  7. ^ Koonin, EV (2007). "El modelo del Big Bang biológico para las principales transiciones en la evolución". Biology Direct . 2 : 21. doi : 10.1186/1745-6150-2-21 . PMC 1973067 . PMID  17708768. 
  8. ^ Koonin, EV; Senkevich, TG; Dolja, VV (2006). "El antiguo mundo de los virus y la evolución de las células". Biology Direct . 1 : 29. doi : 10.1186/1745-6150-1-29 . PMC 1594570 . PMID  16984643. 
  9. ^ Martin, William; Koonin, Eugene V. (2006). "Intrones y el origen de la compartimentación núcleo-citosol". Nature . 440 (7080): 41–45. doi :10.1038/nature04531. ISSN  0028-0836.
  10. ^ Uhlmann, F ; Wernic, D; Poupart, MA; Koonin, EV; Nasmyth, K (2000). "La escisión de la cohesina por la proteasa del clan CD, separina, desencadena la anafase en la levadura". Cell . 103 (3): 375–386. doi : 10.1016/s0092-8674(00)00130-6 . PMID  11081625. S2CID  2667617.
  11. ^ Svensson, Erik I. (2023). "La estructura de la teoría evolutiva: más allá del neodarwinismo, el neolamarckismo y las narrativas históricas sesgadas sobre la síntesis moderna". Biología evolutiva: reflexiones contemporáneas e históricas sobre la teoría central . Biología evolutiva: nuevas perspectivas sobre su desarrollo. Vol. 6. págs. 173–217. doi :10.1007/978-3-031-22028-9_11. ISBN 978-3-031-22027-2.
  12. ^ "Facultad e investigadores". Instituto de Evolución de Haifa . Archivado desde el original el 1 de agosto de 2019. Consultado el 28 de julio de 2020 .
  13. ^ "Masthead: Trends in Genetics" (Encabezado: Tendencias en genética). cell.com . Consultado el 3 de septiembre de 2014 .
  14. ^ "Biology Direct – Editorial Board". biologydirect.com . Consultado el 3 de septiembre de 2014 .
  15. ^ "Eugene Koonin: miembro del consejo asesor en bioinformática – F1000Prime". f1000.com . Consultado el 3 de septiembre de 2014 .
  16. ^ Se eligen miembros y asociados extranjeros de la Academia Nacional de Ciencias, Noticias de la Academia Nacional de Ciencias, Academia Nacional de Ciencias , 3 de mayo de 2016, archivado desde el original el 6 de mayo de 2016 , consultado el 14 de mayo de 2016.
  17. ^ Gabrielsen, Paul (31 de enero de 2017). "Perfil de Eugene V. Koonin". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 114 (5): 793–796. Código Bibliográfico :2017PNAS..114..793G. doi : 10.1073/pnas.1621406114 . ISSN  0027-8424. PMC 5293061 . PMID  28115717. 
  18. ^ Chawla, Dalmeet Singh (17 de octubre de 2017). "¿Quién es el científico biomédico más influyente? Un programa informático guiado por inteligencia artificial dice que lo sabe". Ciencia | AAAS . Consultado el 16 de febrero de 2022 .
  19. ^ "Открытое письмо российских учёных и научных журналистов против войны с Украиной" [Una carta abierta de científicos y periodistas científicos rusos contra la guerra en Ucrania] (en ruso). 24 de febrero de 2022 . Consultado el 2 de abril de 2022 .
  20. ^ "La comunidad científica mundial condena la invasión rusa de Ucrania". Scientific American . Archivado desde el original el 12 de marzo de 2023.

Bibliografía seleccionada

  • Dolja, Valerian V.; Krupovic, Mart; Koonin, Eugene V. (25 de agosto de 2020). "Raíces profundas y ramas espléndidas del viroma vegetal global" (PDF) . Revisión anual de fitopatología . 58 (1). Revisiones anuales : 23–53. doi :10.1146/annurev-phyto-030320-041346. ISSN  0066-4286. PMID  32459570. S2CID  218974980. Identificación HAL : 02861246.
  • Dolja, Valerian V.; Karasev, Alexander V.; Koonin, Eugene V. (1994). "Biología molecular y evolución de closterovirus: construcción sofisticada de genomas de ARN grandes". Revisión anual de fitopatología . 32 (1). Revisiones anuales : 261–285. doi :10.1146/annurev.py.32.090194.001401. ISSN  0066-4286.
  • Makarova, Kira S.; Lobo, Yuri I.; Alkhnbashi, Omer S.; Costa, Fabricio; Shah, Shiraz A.; Saunders, Sita J.; Barrangou, Rodolfo; Brouns, Stan JJ; Charpentier, Emmanuelle ; Haft, Daniel H.; Horvath, Philippe; Moineau, Sylvain; Mojica, Francisco JM; Charranes, Rebecca M.; Charranes, Michael P.; Blanco, Malcolm F.; Yakunin, Alexander F.; Garrett, Roger A.; van der Oost, John; Backofen, Rolf; Koonin, Eugene V. (28 de septiembre de 2015). "Una clasificación evolutiva actualizada de los sistemas CRISPR-Cas". Revisiones de la naturaleza Microbiología . 13 (11). Portafolio de naturaleza : 722–736. doi :10.1038/nrmicro3569. Revista de  Biología Molecular y  Genética  .
  • Gabaldón, Toni; Koonin, Eugene V. (4 de abril de 2013). "Implicaciones funcionales y evolutivas de la ortología génica". Nature Reviews Genetics . 14 (5). Nature Portfolio : 360–366. doi :10.1038/nrg3456. ISSN  1471-0056. PMC  5877793 . PMID  23552219.
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