Juan M. Jumper

Biólogo computacional estadounidense (nacido en 1985)

Juan saltador
Saltador en 2024
Nacido
John Michael Saltador

1985 (38-39 años) [1]
Little Rock, Arkansas , Estados Unidos [1]
Educación
Conocido porPliegue alfa
PremiosNature's 10 (2021)
Premio Fundación BBVA Fronteras del Conocimiento (2022)
Premio Breakthrough en Ciencias de la Vida (2023)
Premio Nobel de Química (2024)
Carrera científica
CamposInteligencia artificial
Aprendizaje automático
InstitucionesGoogle
DeepMind
TesisNuevos métodos que utilizan aprendizaje automático riguroso para el plegamiento y la dinámica de proteínas de grano grueso  (2017)
Asesor de doctoradoTobin R Sosnick
Karl Freed

John Michael Jumper (nacido en 1985) [1] es un químico y científico informático estadounidense. Actualmente se desempeña como director de Google DeepMind . [2] [3] [4] Jumper y sus colegas crearon AlphaFold , [5] un modelo de inteligencia artificial (IA) para predecir las estructuras de las proteínas a partir de su secuencia de aminoácidos con gran precisión. [6] Jumper afirmó que el equipo de AlphaFold planea publicar 100 millones de estructuras de proteínas. [7]

La revista científica Nature incluyó a Jumper como una de las diez "personas que importaron" en la ciencia en su lista anual de Nature 's 10 en 2021. [6] [8] Jumper y Demis Hassabis recibieron la mitad del Premio Nobel de Química de 2024 por sus predicciones de las estructuras de las proteínas. [9] [10]

Educación

Jumper recibió una Licenciatura en Ciencias con especialización en física y matemáticas de la Universidad de Vanderbilt en 2007, [11] una Maestría en Filosofía en física teórica de la materia condensada de la Universidad de Cambridge en 2010 con una Beca Marshall , [12] una Maestría en Ciencias en química teórica de la Universidad de Chicago en 2012, y un Doctorado en Filosofía en química teórica de la Universidad de Chicago en 2017. [13] Sus asesores de doctorado en la Universidad de Chicago fueron Tobin R. Sosnick y Karl Freed . [14]

Carrera

La investigación de Jumper investiga algoritmos para la predicción de la estructura de las proteínas . [2]

Pliegue alfa

Esta imagen representa el producto final de AlphaFold y compara sus resultados con otros competidores en la competencia CASP.

AlphaFold [5] [15] es un algoritmo de aprendizaje profundo desarrollado por Jumper y su equipo en DeepMind, un laboratorio de investigación adquirido por la empresa matriz de Google, Alphabet Inc. Es un programa de inteligencia artificial que realiza predicciones de la estructura de las proteínas . [16]

Premios y honores

En noviembre de 2020, AlphaFold fue nombrado ganador de la 14.ª edición de la competición de evaluación crítica de la predicción de la estructura (CASP). [17] [18] [19] Esta competición internacional evalúa los algoritmos para determinar cuál puede predecir mejor la estructura 3D de las proteínas. AlphaFold ganó la competición, superando a otros algoritmos con una puntuación superior a 90 para alrededor de dos tercios de las proteínas en la prueba de distancia global (GDT) de CASP, una prueba que mide el grado en el que la estructura predicha por un programa computacional es similar a la estructura determinada por el experimento de laboratorio, siendo 100 una coincidencia completa, dentro del límite de distancia utilizado para calcular la GDT. [20] [21]

En 2021, Jumper fue galardonado con el Premio Fundación BBVA Fronteras del Conocimiento en la categoría "Biología y Biomedicina". [22] En 2022, Jumper recibió el Premio Wiley en Ciencias Biomédicas [23] y para 2023 el Premio Breakthrough en Ciencias de la Vida por desarrollar AlphaFold, que predice con precisión la estructura de una proteína. [24] En 2023 fue galardonado con el Premio Internacional Gairdner de Canadá [25] y el Premio Albert Lasker de Investigación Médica Básica . [26]

En 2024, Jumper y Demis Hassabis compartieron la mitad del Premio Nobel de Química por sus predicciones sobre el plegamiento de proteínas, la otra mitad fue para David Baker por el diseño computacional de proteínas . [9] [10]

Referencias

  1. ^ abc "John M. Jumper: hechos". El premio Nobel . Nobel Prize Outreach AB. 2024 . Consultado el 9 de octubre de 2024 .
  2. ^ Publicaciones de John M. Jumper indexadas por Google Scholar
  3. ^ Publicaciones de John M. Jumper de Europa PubMed Central
  4. ^ Eisenstein, Michael (2021). "La inteligencia artificial potencia las predicciones del plegamiento de proteínas". Nature . 599 (7886). Springer Nature: 706–708. doi :10.1038/d41586-021-03499-y. S2CID  244528561 . Consultado el 24 de diciembre de 2021 .
  5. ^ ab John Jumper; Richard Evans; Alexander Pritzel; et al. (15 de julio de 2021). "Predicción de la estructura de proteínas de alta precisión con AlphaFold". Nature . Bibcode :2021Natur.596..583J. doi :10.1038/S41586-021-03819-2. ISSN  1476-4687. PMC 8371605 . Wikidata  Q107555821. 
  6. ^ ab Maxmen, Amy (2021). "Nature's 10: John Jumper: Predictor de proteínas". Nature . 600 (7890). Springer Nature: 591–604. doi : 10.1038/d41586-021-03621-0 . PMID  34912110. S2CID  245256541.
  7. ^ Browne, Grace (2021). «La inteligencia artificial de DeepMind finalmente ha demostrado lo útil que puede ser». wired.com . Consultado el 24 de diciembre de 2021 .
  8. ^ John M. Jumper en LinkedIn
  9. ^ ab «El Premio Nobel de Química 2024». Nobel Media AB . Consultado el 9 de octubre de 2024 .
  10. ^ ab «Nota de prensa: El Premio Nobel de Química 2024». NobelPrize.org . Consultado el 9 de octubre de 2024 .
  11. ^ Doster, Stephen. «John Jumper, desarrollador de AlphaFold, presentará una conferencia de Apex el 30 de agosto». Universidad de Vanderbilt . Consultado el 9 de octubre de 2024 .
  12. ^ "Exalumnos de la Universidad de Cambridge reciben el Premio Nobel de Química 2024 | Universidad de Cambridge". www.cam.ac.uk . 9 de octubre de 2024 . Consultado el 9 de octubre de 2024 .
  13. ^ "John Jumper, exalumno de la UChicago, comparte el Premio Nobel por un modelo para predecir las estructuras de las proteínas | Noticias de la Universidad de Chicago". news.uchicago.edu . 9 de octubre de 2024 . Consultado el 9 de octubre de 2024 .
  14. ^ Jumper, John Michael (2017). Nuevos métodos que utilizan aprendizaje automático riguroso para el plegamiento y la dinámica de proteínas de grano grueso. chicago.edu (tesis doctoral). Universidad de Chicago. doi :10.6082/M1BZ647N. OCLC  1237239279. ProQuest  1883866286.
  15. ^ Andrew W Senior; Richard Evans; John Jumper; et al. (15 de enero de 2020). "Predicción mejorada de la estructura de proteínas utilizando potenciales de aprendizaje profundo". Nature . 577 (7792): 706–710. doi :10.1038/S41586-019-1923-7. ISSN  1476-4687. PMID  31942072. Wikidata  Q92669549.
  16. ^ "AlphaFold". Deepmind . Consultado el 30 de noviembre de 2020 .
  17. ^ "AlphaFold: una solución a un gran desafío de hace 50 años en biología". Deepmind . 30 de noviembre de 2020 . Consultado el 30 de noviembre de 2020 .
  18. ^ Sample, Ian (2 de diciembre de 2018). «DeepMind de Google predice formas 3D de proteínas». The Guardian . Consultado el 30 de noviembre de 2020 .
  19. ^ Shead, Sam (30 de noviembre de 2020). "DeepMind resuelve un 'gran desafío' de 50 años con inteligencia artificial que pliega proteínas" CNBC . Consultado el 30 de noviembre de 2020 .
  20. ^ "La inteligencia artificial de DeepMind que plega proteínas ha resuelto un gran desafío de la biología que se remonta a 50 años atrás". MIT Technology Review . Consultado el 30 de noviembre de 2020 .
  21. ^ Robert F. Service, 'El juego ha cambiado'. La IA triunfa en la resolución de estructuras proteínicas, Science , 30 de noviembre de 2020
  22. ^ «Premio Fundación BBVA Fronteras del Conocimiento 2022». frontiersofknowledgeawards-fbbva.es .
  23. ^ "Premio Wiley 2022". wiley.com .
  24. ^ "Premios Breakthrough 2023". breakingprize.org . Consultado el 22 de septiembre de 2022 .
  25. ^ Fundación, The Gairdner (30 de marzo de 2023). «Se anunciaron los ganadores del premio Gairdner de Canadá 2023». The Gairdner Foundation . Consultado el 9 de octubre de 2024 .
  26. ^ Admin, Lasker. "AlphaFold—para predecir estructuras proteicas". Fundación Lasker . Consultado el 9 de octubre de 2024 .
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