Jaguar (software)
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| Desarrollador(es) | Schrödinger Inc. |
|---|---|
| Sistema operativo | Linux , Microsoft Windows , Mac OS X |
| Tipo | Química computacional |
| Licencia | Comercial |
| Sitio web | https://www.schrodinger.com/jaguar |
Jaguar es un paquete de software informático utilizado para realizar cálculos de química cuántica ab initio tanto para fases gaseosas como disueltas. [1] Es un software comercial comercializado por la empresa Schrödinger . El programa se originó en los grupos de investigación de Richard Friesner y William Goddard y se llamó inicialmente PS-GVB (en referencia al llamado método de enlace de valencia generalizado pseudoespectral que presentaba el programa).
Jaguar es un componente de otros dos productos de Schrödinger: Maestro, que proporciona la interfaz gráfica de usuario de Jaguar, y un programa QM/MM, QSite, que utiliza Jaguar como motor químico cuántico. La versión actual es Jaguar 10.4 (2020).
Características
Una característica distintiva de Jaguar es el uso de la aproximación pseudoespectral. [2] Esta aproximación se puede aplicar a operaciones integrales computacionalmente costosas presentes en la mayoría de los cálculos químicos cuánticos. Como resultado, los cálculos son más rápidos y con poca pérdida de precisión. [3] [4] [5]
La versión actual incluye la siguiente funcionalidad:
- Hartree-Fock ( RHF , UHF , ROHF ) y teoría funcional de la densidad ( LDA , corregida por gradiente, corregida por dispersión y funcionales híbridos )
- Teoría de perturbación local de Møller-Plesset de segundo orden (LMP2)
- Cálculos de emparejamiento perfecto de enlace de valencia generalizado (GVB-PP) y GVB-LMP2
- Predicción de estados excitados mediante interacción de configuración (CIS) y teoría funcional de densidad dependiente del tiempo (TDDFT)
- Optimización de geometría y búsqueda de estados de transición
- Cálculos de solvatación basados en la ecuación de Poisson-Boltzmann
- Predicción de espectros infrarrojos (IR), de resonancia magnética nuclear (RMN), ultravioleta (UV) y de dicroísmo circular vibracional (VCD)
- Predicción de pKa
- Generación de diversas superficies moleculares ( potencial electrostático , densidad electrónica , orbitales moleculares , etc.)
- predicción de diversas propiedades moleculares ( momentos multipolares , polarizabilidades , frecuencias vibracionales , etc.)
Véase también
Referencias
- ^ Young, David (2001). "Apéndice AA2.5 Jaguar". Química computacional . Wiley-Interscience. pág. 337.
- ^ Orszag, Steven A. (septiembre de 1972). "Comparación de la aproximación pseudoespectral y espectral". Estudios en Matemáticas Aplicadas . 51 (3): 253–259. doi :10.1002/sapm1972513253.
- ^ Friesner, RA (octubre de 1991). "Nuevos métodos para cálculos de estructura electrónica en moléculas grandes". Revista anual de química física . 42 (1): 341–367. Bibcode :1991ARPC...42..341F. doi :10.1146/annurev.pc.42.100191.002013. PMID 1747190. S2CID 32730211.
- ^ Friesner, Richard A.; Murphy, Robert B.; Beachy, Michael D.; Ringnalda, Murco N.; Pollard, W. Thomas; Dunietz, Barry D.; Cao, Yixiang (abril de 1999). "Cálculos de estructura electrónica ab initio correlacionados para moléculas grandes". The Journal of Physical Chemistry A . 103 (13): 1913–1928. Bibcode :1999JPCA..103.1913F. doi :10.1021/jp9825157.
- ^ Lado, F.; Lomba, E.; Lombardero, M. (1995). "Algoritmo de ecuación integral para fluidos de moléculas completamente anisotrópicas" (PDF) . The Journal of Chemical Physics . 103 (1): 481. Bibcode :1995JChPh.103..481L. doi :10.1063/1.469615.
Enlaces externos
- Schrödinger Inc
