OPI13

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

OPI13
Estructuras disponibles
APBúsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Identificadores
AliasIPO13 , IMP13, KAP13, LGL2, RANBP13, importación 13
Identificaciones externasOMIM : 610411; MGI : 2385205; HomoloGene : 40968; Tarjetas Gene : IPO13; OMA :IPO13 - ortólogos
Ortólogos
EspeciesHumanoRatón
Entre
Conjunto
Protección unificada
RefSeq (ARNm)

Número nuevo_014652

Número nuevo_146152

RefSeq (proteína)

NP_055467

NP_666264

Ubicación (UCSC)Cronica 1: 43,95 – 43,97 MbCrónica 4: 117,75 – 117,77 Mb
Búsqueda en PubMed[3][4]
Wikidatos
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La importina-13 es una proteína codificada por el gen IPO13 en humanos. [5] [6] [7] La ​​importina-13 es un miembro de la familia importina -β de receptores de transporte nuclear (NTR) y se identificó por primera vez como un receptor de transporte en 2000. [8] Según PSI-blast based secondary structure PREDiction (PSIPRED), la importina-13 contiene 38 α-hélices . [9] La importina-13 acomoda una variedad de cargas debido a su estructura superhelicoidal flexible y un sistema de unión y liberación de carga que es distinto de otros receptores de transporte similares a la importina. [8] [10] La IPO13 se expresa ampliamente en una variedad de tejidos en el cuerpo humano, incluido el corazón, [11] la córnea, [11] el pulmón fetal, [11] el cerebro, [11] el carcinoma endometrial , [11] y los testículos. [10]

Transporte nucleocitoplasmático

En las células eucariotas , las macromoléculas mayores de ~40 kDa se transportan activamente entre el compartimento nuclear y citosólico a través de complejos de poros nucleares (NPC) mediante receptores de transporte solubles. [8] [9] [12] Los factores similares a la importina-β son la clase más grande de NTR y se clasifican como importinas o exportinas según la dirección del transporte de carga y su respuesta al gradiente de RanGTP a través de la envoltura nuclear . [13] Las importinas cargan sus cargas en el citoplasma en ausencia de RanGTP y liberan sus cargas en el núcleo al unirse a RanGTP. Las exportinas unen sus cargas en el núcleo en presencia de RanGTP y liberan sus cargas en el citoplasma tras la hidrólisis de RanGTP . [8] [11] [13] A diferencia de otras importinas, la importina-13 es un receptor de transporte nuclear versátil con una capacidad de transporte bidireccional, de modo que media la importación nuclear de ciertas cargas y la exportación nuclear de otras cargas. Otros receptores de transporte nuclear que facilitan tanto la importación como la exportación nuclear de macromoléculas son la exportina 5 (Msn5 en levadura) y la exportina 4. [8]

El arco C-terminal de la mayoría de las importinas es el sitio de unión principal para las cargas. Debido a su capacidad de transporte bidireccional, diferentes regiones de la importina-13 interactúan con las cargas para facilitar la importación o exportación. Por ejemplo, la enzima de conjugación de ubiquitina 9 ( Ubc9 ) interactúa principalmente con la región N-terminal, [8] y la caracterización de las estructuras cristalinas de la importina-13 indica que casi todas las cargas de importación nucleares conocidas se unen a sus regiones N-terminales. [10] Las bajas concentraciones totales o activas de importina-13 en el núcleo muestran que la importina-13 es un factor limitante de la velocidad de importación y exportación nuclear de proteínas de carga. [8]

Interacciones

Se han identificado al menos 255 sustratos de importina-13. Según Baade et al., las principales cargas de importación de importina-13 son Ubc9, CHRAC1 y POLE3 . [8] Otras cargas de importación conocidas de importina-13 son MAGOH , [8] NFYB , [8] DR1 , [8] DRAP1 , [8] RBM8 , [14] factores de transcripción de homeodominio de tipo emparejado (TF), [14] myopodinm, [14] el receptor de glucocorticoides (GR), [14] RFPL3 , [11] y el complejo RBM8-MGN. [15] La principal carga de exportación de importina-13 es EIF1A. [8] Otras cargas de exportación conocidas de importina-13 incluyen HMG20A [11] y E1F4G2 . [10] Además, la importina-13 regula la exportación nuclear de los factores de transcripción SPI y KLF4 en condiciones de estrés oxidativo. [12]

Varias cargas de importación de importina-13 se unen a la importina-13 solo como heterodímeros y no se observa interacción con los monómeros solos. [8] como con la importación nuclear del complejo NF-YB/NF-YC. [13] Walter et al. demostraron que la importina-13 media la importación nuclear de los pares de pliegues de histonas CHRAC-15/17 y p12/CHRAC-17 solo en las formas heterodimerizadas de estos sustratos. Además, la plataforma de unión de la importina-13 involucra aminoácidos cargados positivamente conservados entre las subunidades de pliegues de histonas, lo que sugiere que la unión y el transporte de los heterodímeros a través de la importina-13 están impulsados ​​por interacciones electrostáticas . [9]

Función

La importina-13 desempeña un papel importante en la regulación del desarrollo del cerebro y los pulmones, [10] la espermatogénesis y la espermiogénesis , [10] la diferenciación de células madre embrionarias , [16] la importación nuclear de c-Jun en células de melanoma, [17] y la respuesta transcripcional al estrés oxidativo . [12]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000117408 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000033365 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Miyajima N, Tanaka A, et al. (octubre de 1998). "Predicción de las secuencias codificantes de genes humanos no identificados. XI. Las secuencias completas de 100 nuevos clones de ADNc del cerebro que codifican proteínas grandes in vitro". DNA Research . 5 (5): 277–286. doi : 10.1093/dnares/5.5.277 . PMID  9872452.
  6. ^ Mingot JM, Kostka S, Kraft R, Hartmann E, Görlich D (julio de 2001). "Importina 13: un nuevo mediador de la importación y exportación nuclear". The EMBO Journal . 20 (14): 3685–3694. doi :10.1093/emboj/20.14.3685. PMC 125545 . PMID  11447110. 
  7. ^ "Entrez Gene: IPO13 importando 13".
  8. ^ abcdefghijklmn Baade I, Spillner C, Schmitt K, Valerius O, Kehlenbach RH (julio de 2018). "Identificación extensa y validación en profundidad de cargas de importina 13". Proteómica molecular y celular . 17 (7): 1337–1353. doi : 10.1074/mcp.ra118.000623 . PMC 6030721 . PMID  29666159. 
  9. ^ abc Walker P, Doenecke D, Kahle J (abril de 2009). "La importina 13 media la importación nuclear de heterodímeros complejos de accesibilidad de cromatina que contienen pliegues de histonas". The Journal of Biological Chemistry . 284 (17): 11652–11662. doi : 10.1074/jbc.m806820200 . PMC 2670169 . PMID  19218565. 
  10. ^ abcdef Fatima S, Wagstaff KM, Lieu KG, Davies RG, Tanaka SS, Yamaguchi YL, et al. (Marzo de 2017). "Interactoma de la isoforma inhibidora del transportador nuclear Importin 13". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Investigación de células moleculares . 1864 (3): 546–561. doi : 10.1016/j.bbamcr.2016.12.017 . PMID  27993670.
  11. ^ abcdefgh Zohud BA, Guo P, Zohud BA, Li F, Hao JJ, Shan X, et al. (octubre de 2020). "Importin 13 promueve la progresión del NSCLC mediando la translocación nuclear de RFPL3 y la regulación positiva de la expresión de hTERT". Muerte celular y enfermedad . 11 (10): 879. doi : 10.1038/s41419-020-03101-9. PMC 7575581 . PMID  33082305. 
  12. ^ abc Gajewska KA, Lescesen H, Ramialison M, Wagstaff KM, Jans DA (octubre de 2021). "El transportador nuclear Importin-13 desempeña un papel clave en la respuesta transcripcional al estrés oxidativo". Nature Communications . 12 (1): 5904. Bibcode :2021NatCo..12.5904G. doi :10.1038/s41467-021-26125-x. PMC 8501021 . PMID  34625540. 
  13. ^ abc Kahle J, Baake M, Doenecke D, Albig W (julio de 2005). "Las subunidades del factor de transcripción heterotrimérico NF-Y se importan al núcleo por vías distintas que involucran a la importina beta y la importina 13". Biología molecular y celular . 25 (13): 5339–5354. doi :10.1128/mcb.25.13.5339-5354.2005. PMC 1157003 . PMID  15964792. 
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  16. ^ Fatima S, Wagstaff KM, Lim SM, Polo JM, Young JC, Jans DA (enero de 2021). "El transportador nuclear importina 13 es fundamental para la supervivencia celular durante la diferenciación de células madre embrionarias". Comunicaciones de investigación bioquímica y biofísica . 534 : 141–148. doi :10.1016/j.bbrc.2020.11.099. PMID  33333437. S2CID  229316304.
  17. ^ Kappelmann-Fenzl M, Kuphal S, Krupar R, Schadendorf D, Umansky V, Vardimon L, et al. (noviembre de 2019). "La formación de complejos con α-tubulina monomérica e importina 13 fomenta la estabilidad de la proteína c-Jun y es necesaria para la translocación nuclear y la actividad de c-Jun". Cánceres . 11 (11): 1806. doi : 10.3390/cancers11111806 . PMC 6895814 . PMID  31744174. 

Lectura adicional

  • Ploski JE, Shamsher MK, Radu A (junio de 2004). "Los factores de transcripción homeodominio de tipo emparejado son importados al núcleo por la carioferina 13". Biología molecular y celular . 24 (11): 4824–4834. doi :10.1128/MCB.24.11.4824-4834.2004. PMC  416398 . PMID  15143176.
  • Zhang C, Sweezey NB, Gagnon S, Muskat B, Koehler D, Post M, Kaplan F (abril de 2000). "Un nuevo homólogo de la carioferina beta se regula hormonal y evolutivamente en el pulmón fetal". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology . 22 (4): 451–459. doi :10.1165/ajrcmb.22.4.3929. PMID  10745026.
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