Instituto de Genómica y Biología Integrativa
Instituto de investigación científica de la India

Instituto de Genómica y Biología Integrativa del CSIR
AbreviaturaCSIR-IGIB
Establecido1977
TipoOrganización gubernamental
ObjetivoTraducir los conceptos desarrollados en la investigación biológica básica a tecnologías comercialmente viables para el cuidado de la salud.
Ubicación
  • Sukhdev Vihar, Mathura Road,
    Delhi -110 025.
Director
Anurag Agrawal
Organización de padres
Consejo de Investigaciones Científicas e Industriales
Sitio webwww.igib.res.in
Campus Sur del CSIR-IGIB

El Instituto de Genómica y Biología Integrativa del CSIR ( CSIR-IGIB ) es un instituto de investigación científica dedicado principalmente a la investigación biológica. Forma parte del Consejo de Investigación Científica e Industrial (CSIR) de la India. [1]

El instituto fue fundado en 1977 como Centro de Tecnología Bioquímica con un enfoque principal en la investigación bioquímica, pero desde entonces ha cambiado su enfoque de investigación hacia la biología integrativa.

Ubicación

El Instituto tiene dos campus en Delhi. El Campus Norte es el más antiguo de los dos y se encuentra en el campus de la Universidad de Delhi , en Mall Road, frente al Jubilee Hall. El nuevo campus se encuentra en el sur de Delhi , en Mathura Road, en Sukhdev Vihar.

Historia

El IGIB se creó en 1977 como Centro de Tecnología Bioquímica (CBT). La Unidad de Genómica Funcional se creó en 1998, con un enfoque que pasó de la investigación química a la genómica. En 2002, el instituto pasó a denominarse "Instituto de Genómica y Biología Integrativa".

Logros

En 2009, un equipo del instituto secuenció el genoma del pez cebra de tipo salvaje , con alrededor de 1.700 millones de pares de bases. Esto convirtió al pez, que es originario de la región del Himalaya , en el primer vertebrado cuyo genoma completo fue secuenciado en la India, ya que anteriormente los científicos indios solo habían secuenciado genomas de bacterias y plantas. [2] [3]

En diciembre de 2009, los científicos del IGIB realizaron la primera resecuenciación de un genoma humano en la India. [4] [5] [6] El Instituto también colaboró ​​en la decodificación del primer genoma de Sri Lanka [7] [8] y del genoma de Malasia. [9] El Instituto también es miembro del Consorcio Abierto de Genómica Personal. [10]

Pandemia de COVID-19

El instituto desempeña un papel destacado en la comprensión de las nuevas variantes del SARS-CoV-2 en la India [11] [12] y en todo el mundo. [13] El instituto también mantiene una serie de recursos informáticos que son fundamentales para la identificación y caracterización de las variantes emergentes del SARS-CoV-2. [14] [15]

Los investigadores del instituto informaron sobre el primer enfoque basado en secuenciación de próxima generación de alto rendimiento [16] para la detección y la epidemiología genética del SARS-CoV-2. [17] Este enfoque se ha utilizado ampliamente para comprender la epidemiología genética del SARS-CoV-2 en el estado de Kerala , [18] lo que ha influido significativamente en las políticas y la preparación [19] en el estado para frenar la propagación de la epidemia, así como en la implementación de políticas basadas en evidencia. [20]

El instituto ha sido fundamental en la creación del concepto de MegaLabs para las pruebas de COVID-19 y la vigilancia genómica [21], que también proporcionó la epidemiología genética de estados como Kerala, [22] Andhra Pradesh [23] y Maharashtra. [24]

Los investigadores del instituto también informaron de los primeros casos de reinfección por COVID-19 en el país [25], además de identificar un nuevo clado de SARS-CoV-2 en la India llamado I/A3i. [26] Los investigadores del instituto también descubrieron un linaje emergente con mutación N440K en la proteína de pico asociada con el escape inmunológico. [27] [28] Se ha mantenido un conjunto integral de recursos computacionales para comprender los genomas y la epidemiología genética del SARS-CoV-2. [15] El instituto informó de uno de los primeros casos caracterizados genéticamente de infecciones posvacunación por COVID-19. [29]

Los investigadores del instituto han sido fundamentales en el desarrollo de COVIDSure [30], un kit basado en la reacción en cadena de la polimerasa con transcripción inversa para el diagnóstico de COVID-19, que ahora se utiliza ampliamente en la India y es comercializado por Trivitron Healthcare. [31]

Los investigadores del CSIR-IGIB también desarrollaron la prueba denominada FELUDA, basada en la edición genética CRISPR , que es muy eficiente y rápida para hacer frente a la capacidad de prueba del país y ha sido aprobada por el Contralor General de Medicamentos de la India . La prueba ha sido licenciada a Tata Group para su producción comercial. [32]

El instituto también ha desempeñado un papel destacado en el consorcio nacional de genómica de COVID-19 [33] y mantiene los recursos informáticos y los paneles de control. [14]

Genómica de enfermedades genéticas raras

El instituto ha iniciado un programa único para utilizar tecnologías genómicas de vanguardia para comprender las enfermedades genéticas raras en la India y es pionero en la aplicación de la genómica para la medicina de precisión en las clínicas. Uno de los programas que se ha iniciado en este frente es Genomics for Understanding Rare Disease, India Alliance Network (GUaRDIAN). [34] GUaRDIAN es una red colaborativa a gran escala de médicos de toda la India que intentan utilizar la genómica en la práctica clínica, con el objetivo centrado en comprender la estructura genética de las enfermedades genéticas raras en la India. [35]

El consorcio tiene como objetivo utilizar tecnología genómica de vanguardia para permitir la identificación de variaciones genéticas en enfermedades y permitir a los médicos llegar a un diagnóstico preciso de enfermedades genéticas raras. Además de trabajar en estrecha colaboración con los médicos, el consorcio tiene como objetivo fomentar la educación, la concienciación y la adopción generalizada de la tecnología genómica en entornos clínicos, además de crear y difundir los más altos estándares de generación e interpretación de datos genómicos en la India. [36]

En los últimos años, ha podido trabajar en estrecha colaboración con los médicos de la red para poder ofrecer pruebas de principios para la aplicación de la genómica para la medicina de precisión. [37] [38] [39] También está en funcionamiento un programa integral de derivación de pacientes. [40]

Programa IndiGen para la Salud Pública

El programa IndiGen sobre genómica de salud pública [41] tiene como objetivo llevar a cabo la secuenciación completa del genoma de 1000 individuos indios que representan diversos grupos étnicos de la India. Los datos generados como parte de IndiGen proporcionarían la base de referencia para las frecuencias alélicas de las variantes genéticas para la epidemiología genética y ayudarían a la toma de decisiones políticas. Las frecuencias de las variantes genéticas clínicamente relevantes formarían la plantilla para permitir enfoques de diagnóstico para enfermedades genéticas prevalentes y también para optimizar terapias a través de la farmacogenómica. También se pone a disposición un recurso integral que proporciona acceso a los datos mediante búsquedas. [42]

Centros de Extensión (Sucursales)

El campus principal del IGIB está ubicado en Mall Road, Nueva Delhi, cerca del campus norte de la Universidad de Delhi. La alianza del IGIB con el sector biotecnológico y farmacéutico ha propiciado su crecimiento y la creación de dos centros de extensión: uno en el sur de Delhi (el anexo del IGIB en TCGA, Okhla) y el otro en el oeste de Delhi, en Naraina.

Reuniones internacionales

El IGIB fue coanfitrión de la 13ª reunión de la Organización del Genoma Humano (HUGO) en 2008, celebrada en el Centro Internacional de Convenciones de Hyderabad . [43]

Véase también

Referencias

  1. ^ Sitio web del Consejo de Investigación Científica e Industrial de la India Archivado el 27 de septiembre de 2015 en Wayback Machine .
  2. ^ Página web sobre el genoma del pez cebra Archivado el 19 de julio de 2018 en Wayback Machine 'Institute of Genomics and Integrative Biology' (IGIB)
  3. ^ Descifrando el misterio del genoma Indian Express , 5 de julio de 2009.
  4. ^ Científicos indios descifran el genoma humano Indian Express , 10 de diciembre de 2009 [ enlace inactivo ]
  5. ^ * Patowary A, Purkanti R, Singh M, Chauhan RK, Bhartiya D, Dwivedi OP, et al. (julio de 2012). "Análisis sistemático y anotación funcional de variaciones en el genoma de un individuo indio". Human Mutation . 33 (7): 1133–40. doi : 10.1002/humu.22091 . PMID  22461382. S2CID  11466942.[1]
  6. ^ Recopilación de artículos de noticias y comunicados de prensa sobre el genoma indio, 10 de diciembre de 2009
  7. ^ "Genoma de Sri Lanka". Archivado desde el original el 18 de febrero de 2013. Consultado el 17 de enero de 2013 .
  8. ^ Dissanayake VH, Samarakoon PS, Scaria V, Patowary A, Sivasubbu S, Gokhale RS, et al. (2012). "El Proyecto Genoma Personal de Sri Lanka: una descripción general". Revista de Informática Biomédica de Sri Lanka . 1 (2): 4–8.[2] Archivado el 5 de abril de 2013 en Wayback Machine.
  9. ^ "Artículos complementarios para el día de la boda".[ enlace muerto permanente ]
  10. ^ "Consorcio OpenPGx". Archivado desde el original el 18 de diciembre de 2017 . Consultado el 7 de noviembre de 2018 .
  11. ^ Dandekar, Vikas. "El genoma se encuentra con GitHub: utilizando herramientas tecnológicas, los cazadores de virus de la India rastrean a un asesino que cambia de forma". The Economic Times . Consultado el 14 de agosto de 2021 .
  12. ^ "Cómo uno de los principales institutos de investigación de la India está rastreando nuevas variantes del SARS-COV2". The Indian Express . 3 de agosto de 2021 . Consultado el 14 de agosto de 2021 .
  13. ^ "Conozca a las personas que advierten al mundo sobre las nuevas variantes del covid". MIT Technology Review . Consultado el 14 de agosto de 2021 .
  14. ^ ab "Vigilancia genómica de la COVID-19". clingen.igib.res.in . Consultado el 14 de agosto de 2021 .
  15. ^ ab "Epidemiología genética de patógenos nuevos y emergentes en la India". clingen.igib.res.in . Consultado el 30 de octubre de 2020 .
  16. ^ "Hay planes en marcha para instalar megalaboratorios en cuatro estados para reforzar la vigilancia". Hindustan Times . 24 de septiembre de 2020 . Consultado el 30 de octubre de 2020 .
  17. ^ Bhoyar, Rahul C.; Jain, Abhinav; Sehgal, Paras; Divakar, Mohit Kumar; Sharma, Disha; Imran, Mohamed; Jolly, Bani; Ranjan, Gyan; Rophina, Mercy; Sharma, Sumit; Siwach, Sanjay (10 de agosto de 2020). "Detección de alto rendimiento y epidemiología genética del SARS-CoV-2 utilizando la secuenciación de próxima generación COVIDSeq". bioRxiv : 2020.08.10.242677. doi : 10.1101/2020.08.10.242677 . S2CID  221141897.
  18. ^ Maya, C. (12 de septiembre de 2020). "Los viajes entre estados trajeron cepas de coronavirus a Kerala: estudio". The Hindu . ISSN  0971-751X . Consultado el 30 de octubre de 2020 .
  19. ^ Bhagat, Shalini Venugopal (23 de mayo de 2021). "Mientras India tropieza, un Estado traza su propio rumbo frente al Covid". The New York Times . ISSN  0362-4331 . Consultado el 28 de mayo de 2021 .
  20. ^ "Pinarayi presiona por el uso de doble mascarilla; se planean más restricciones en Kerala". The Indian Express . 1 de mayo de 2021 . Consultado el 28 de mayo de 2021 .
  21. ^ Koshy, Jacob (12 de agosto de 2020). "Coronavirus | CSIR propone 'mega laboratorios' para impulsar las pruebas de COVID-19". The Hindu . ISSN  0971-751X . Consultado el 14 de agosto de 2021 .
  22. ^ Radhakrishnan, Chandni; Divakar, Mohit Kumar; Jain, Abhinav; Viswanathan, Prasanth; Bhoyar, Rahul C.; Jolly, Bani; Imran, Mohamed; Sharma, Disha; Rophina, Mercy; Ranjan, Gyan; Sehgal, Paras (2021). "Los conocimientos iniciales sobre la epidemiología genética de los aislamientos de SARS-CoV-2 de Kerala sugieren una propagación local a partir de introducciones limitadas". Frontiers in Genetics . 12 : 630542. doi : 10.3389/fgene.2021.630542 . ISSN  1664-8021. PMC 8010186 . PMID  33815467. 
  23. ^ Rani, Pallavali Roja; Imran, Mohamed; Lakshmi, J. Vijaya; Jolly, Bani; Afsar, S.; Jain, Abhinav; Divakar, Mohit Kumar; Suresh, Panyam; Sharma, Disha; Rajesh, Nambi; Bhoyar, Rahul C. (3 de agosto de 2021). "Información sobre genomas y epidemiología genética de los aislamientos del SARS-CoV-2 del estado de Andhra Pradesh". Epidemiología e infección . 149 : e181. doi :10.1017/S0950268821001424. ISSN  0950-2688. PMC 8367868 . 
  24. ^ "Maharashtra se acerca al IGIB para realizar la secuenciación genómica de muestras de coronavirus". The Indian Express . 3 de mayo de 2021 . Consultado el 14 de agosto de 2021 .
  25. ^ Gupta, Vivek; Bhoyar, Rahul C.; Jain, Abhinav; Srivastava, Saurabh; Upadhayay, Rashmi; Imran, Mohamed; Jolly, Bani; Divakar, Mohit Kumar; Sharma, Disha; Sehgal, Paras; Ranjan, Gyan (2020). "Reinfección asintomática en dos trabajadores sanitarios de la India con el coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo genéticamente distinto". Enfermedades infecciosas clínicas . 73 (9): e2823–e2825. doi :10.1093/cid/ciaa1451. PMC 7543380 . PMID  32964927. 
  26. ^ Banú, Sofía; Jolly, Baní; Mukherjee, Payel; Singh, Priya; Khan, Shagufta; Zaveri, Lamuk; Shambhavi, Sakshi; Gaur, Namami; Reddy, Shashikala; Kaveri, K.; Srinivasan, Sivasubramanian (2020). "Un grupo filogenético distinto de aislados indios de SARS-CoV-2". Foro Abierto Enfermedades Infecciosas . 7 (11): ofaa434. doi :10.1093/ofid/ofaa434. PMC 7543508 . PMID  33200080. 
  27. ^ "La mutación india de Covid-19 'N440k' se encuentra en un tercio de los genomas del coronavirus de Andhra Pradesh". Heraldo de Deccan . 27 de diciembre de 2020 . Consultado el 28 de diciembre de 2020 .
  28. ^ Alegre, Bani; Rofina, Misericordia; Shamnat, Afra; Imran, Mahoma; Bhoyar, Rahul C.; Divakar, Mohit Kumar; Rani, Pallaví Roja; Ranjan, Gyan; Sehgal, Paras; Chandrasekhar, Pulala; Afsar, S. (26 de diciembre de 2020). "Epidemiología genética de variantes asociadas con el escape inmunológico de los genomas globales del SARS-CoV-2". bioRxiv : 2020.12.24.424332. doi : 10.1101/2020.12.24.424332. S2CID  229935726.
  29. ^ J, Beena Philomina; Jolly, Baní; Juan, Neethu; Bhoyar, Rahul C.; Majeed, Nisha; Senthivel, Vigneshwar; P, Fairoz C.; Rofina, Misericordia; Vasudevan, Bindhu; Imran, Mohamed; Viswanathan, Prasanth (24 de mayo de 2021). "Encuesta genómica de infecciones irruptivas de la vacuna SARS-CoV-2 en trabajadores sanitarios de Kerala, India". Revista de infección . 83 (2): 237–279. doi :10.1016/j.jinf.2021.05.018. ISSN  0163-4453. PMC 8143909 . PMID  34044037. 
  30. ^ "Tecnologías del CSIR para la mitigación del COVID-19" (PDF) . Consejo de Investigación Científica e Industrial . 14 de agosto de 2021.
  31. ^ "COVIDsure Multiplex Realtime RT-PCR Kit | ensayo de RT-PCR cualitativo para COVID-19". www.trivitron.com . Consultado el 14 de agosto de 2021 .
  32. ^ Rajalakshmi, Niranjana (28 de octubre de 2020). "Explicado: ¿Cómo funciona la prueba Feluda COVID-19 de la India?". La ciencia del alambre . Consultado el 30 de octubre de 2020 .
  33. ^ "INSACOG | Departamento de Biotecnología". Ministerio de Ciencia y Tecnología del Gobierno de la India . Consultado el 28 de septiembre de 2021 .
  34. ^ "Genómica para la comprensión de enfermedades raras: Red de la Alianza de la India (GUaRDIAN)". Archivado desde el original el 16 de mayo de 2021. Consultado el 17 de septiembre de 2015 .
  35. ^ Sivasubbu S, Scaria V, et al. (Consorcio GUaRDIAN) (septiembre de 2019). "Genómica de enfermedades genéticas raras: experiencias de la India". Human Genomics . 14 (1): 52. doi : 10.1186/s40246-019-0215-5 . PMC 6760067 . PMID  31554517. 
  36. ^ Scaria V, Sivasubbu S (2015). Análisis e interpretación de la secuencia del exoma: manual para médicos (primera edición). The Readers Paradise. ISBN 978-93-82110-58-3.
  37. ^ Gupta A, Sharma YK, Vellarikkal SK, Jayarajan R, Dixit V, Verma A, et al. (Abril de 2016). "La secuenciación del exoma completo resuelve el dilema diagnóstico en un caso raro de acroqueratosis verruciforme esporádica". Revista de la Academia Europea de Dermatología y Venereología . 30 (4): 695–7. doi : 10.1111/jdv.12983 . PMID  25622760. S2CID  35181817.
  38. ^ Gupta A, Sharma Y, Deo K, Vellarikkal S, Jayarajan R, Dixit V, et al. (2015). "Informe de caso: la secuenciación completa del exoma ayuda a un diagnóstico molecular preciso en hermanos con una rara coexistencia de duplicación 22q12 heredada por vía paterna e ictiosis autosómica recesiva no sindrómica". F1000Research . 4 : 446. doi : 10.12688/f1000research.6779.1 . PMC 4648218 . PMID  26594337. 
  39. ^ Vellarikkal SK, Patowary A, Singh M, Kumari R, Faruq M, Master DC, et al. (2014). "La secuenciación del exoma revela una nueva mutación, p.L325H, en el gen KRT5 asociada con la epidermólisis ampollosa simple de tipo Koebner autosómica dominante en una gran familia del oeste de la India". Variación del genoma humano . 1 (1): 14007. doi :10.1038/hgv.2014.7. PMC 4785511. PMID  27081501 . 
  40. ^ Página de referencia de pacientes Genómica para la comprensión de enfermedades raras Red de la Alianza de la India (GUaRDIAN)
  41. ^ "Genómica para la salud pública". sites.google.com . Consultado el 3 de septiembre de 2019 .
  42. ^ Jainista, Abhinav; Bhoyar, Rahul C.; Pandhare, Kavita; Mishra, Anushree; Sharma, Disha; Imran, Mohamed; Senthivel, Vigneshwar; Divakar, Mohit Kumar; Rofina, Misericordia; Jolly, Baní; Batra, Arushi (2020). "IndiGenomes: un recurso completo de variantes genéticas de más de 1000 genomas indios". Investigación de ácidos nucleicos . 49 (D1): D1225-D1232. doi : 10.1093/nar/gkaa923 . PMC 7778947 . PMID  33095885. 
  43. ^ Sitio web de HGM-2008 Archivado el 2 de octubre de 2016 en Wayback Machine .
  • Sitio web oficial del IGIB
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