Familia 19 de las glicósidos hidrolasas
| Familia 19 de las glicosil hidrolasas | |||||||||
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 La estructura cristalina refinada de una endoquitinasa de semillas de Hordeum vulgare L. a una resolución de 1,8 angstroms. | |||||||||
| Identificadores | |||||||||
| Símbolo | Glicohidro_19 | ||||||||
| Pfam | PF00182 | ||||||||
| Clan Pfam | CL0037 | ||||||||
| Interprofesional | IPR000726 | ||||||||
| PROSITIO | PDOC00620 | ||||||||
| SCOP2 | 2baa / ALCANCE / SUPFAM | ||||||||
| CAZy | GH19 | ||||||||
| Diligenciamiento de conflictos | cd00325 | ||||||||
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En biología molecular, la familia 19 de las glicósidos hidrolasas es una familia de glicósidos hidrolasas EC 3.2.1., que son un grupo muy extendido de enzimas que hidrolizan el enlace glicósido entre dos o más carbohidratos, o entre un carbohidrato y una fracción no carbohidrato. Un sistema de clasificación para las glicósidos hidrolasas, basado en la similitud de secuencias, ha llevado a la definición de >100 familias diferentes. [1] [2] [3] Esta clasificación está disponible en el sitio web de CAZy , [4] [5] y también se analiza en CAZypedia, una enciclopedia en línea de enzimas activas en carbohidratos. [6] [7] y[ _]9
La familia 19 de glicósido hidrolasas CAZY GH_19 comprende enzimas con una sola actividad conocida: quitinasa ( EC 3.2.1.14).
Las quitinasas [8] son enzimas que catalizan la hidrólisis de los enlaces beta-1,4-N-acetil-D-glucosamina en polímeros de quitina. Las quitinasas pertenecen a las familias de glicósido hidrolasas 18 o 19. [9] Las quitinasas de la familia 19 (también conocidas como clases IA o I y IB o II) son enzimas de plantas que funcionan en la defensa contra hongos e insectos patógenos destruyendo su pared celular que contiene quitina . Las enzimas de clase IA/I y IB/II se diferencian en la presencia (IA/I) o ausencia (IB/II) de un dominio de unión a quitina N-terminal. El dominio catalítico de estas enzimas consta de alrededor de 220 a 230 residuos de aminoácidos.
Sitio activo
Las enzimas GH19 tienen un motivo de secuencia conservado ([FHY]-GRG-[AP]-ζ-Q-[IL]-[ST]-[FHYW]-[HN]-[FY]-[NY], ζ = aminoácido hidrofílico) en su sitio activo. [11]
Referencias
- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (julio de 1995). "Maquinaria catalítica conservada y predicción de un plegamiento común para varias familias de glicosilhidrolasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 92 (15): 7090–4. Bibcode :1995PNAS...92.7090H. doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC 41477 . PMID 7624375.
- ^ Davies G, Henrissat B (septiembre de 1995). "Estructuras y mecanismos de las glicosilhidrolasas". Structure . 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00220-9 . PMID 8535779.
- ^ Henrissat B, Bairoch A (junio de 1996). "Actualización de la clasificación basada en secuencias de las glicosilhidrolasas". The Biochemical Journal . 316 (Parte 2) (Parte 2): 695–6. doi :10.1042/bj3160695. PMC 1217404 . PMID 8687420.
- ^ "Inicio". CAZy.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (enero de 2014). "La base de datos de enzimas activas en carbohidratos (CAZy) en 2013". Nucleic Acids Research . 42 (número de la base de datos): D490-5. doi :10.1093/nar/gkt1178. PMC 3965031 . PMID 24270786.
- ^ "Glucósido hidrolasa familia 19". CAZypedia.org . Consultado el 6 de marzo de 2018 .
- ^ Consorcio CAZypedia (diciembre de 2018). «Diez años de CAZypedia: una enciclopedia viva de enzimas activas en carbohidratos» (PDF) . Glicobiología . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glycob/cwx089 . PMID 29040563.
- ^ Flach J, Pilet PE, Jollès P (agosto de 1992). "¿Qué hay de nuevo en la investigación sobre quitinasa?". Experientia . 48 (8): 701–16. doi :10.1007/BF02124285. PMID 1516675. S2CID 37362071.
- ^ Henrissat B (diciembre de 1991). "Una clasificación de las glicosilhidrolasas basada en similitudes en la secuencia de aminoácidos". The Biochemical Journal . 280 (Pt 2) (2): 309–16. doi :10.1042/bj2800309. PMC 1130547 . PMID 1747104.
- ^ Eijsink V, Hoell I, Vaaje-Kolstada G (1 de enero de 2010). "Estructura y función de las enzimas que actúan sobre la quitina y el quitosano". Biotechnology & Genetic Engineering Reviews . 27 (1): 331–66. doi : 10.1080/02648725.2010.10648156 . PMID 21415904.
- ^ Udaya Prakash NA, Jayanthi M, Sabarinathan R, Kangueane P, Mathew L, Sekar K (mayo de 2010). "Evolución, conservación de homología e identificación de firmas de secuencia únicas en quitinasas de la familia GH19". Journal of Molecular Evolution . 70 (5): 466–78. Bibcode :2010JMolE..70..466U. doi :10.1007/s00239-010-9345-z. PMID 20480157. S2CID 2202745.
