Una exorribonucleasa es una exonucleasa ribonucleasa , que son enzimas que degradan el ARN eliminando nucleótidos terminales del extremo 5' o del extremo 3' de la molécula de ARN. Las enzimas que eliminan nucleótidos del extremo 5' se denominan exorribonucleasas 5'-3' , y las enzimas que eliminan nucleótidos del extremo 3' se denominan exorribonucleasas 3'-5' .
Las exorribonucleasas pueden utilizar agua para romper el enlace nucleótido-nucleótido (que se denomina actividad hidrolítica) o fosfato inorgánico (que se denomina actividad fosforolítica). Las exorribonucleasas hidrolíticas se clasifican con el número CE 3.1 y las exorribonucleasas fosforolíticas con el número CE 2.7.7. Como las enzimas fosforolíticas utilizan fosfato inorgánico para romper enlaces, liberan nucleótidos difosfatos , mientras que las enzimas hidrolíticas (que utilizan agua) liberan nucleótidos monofosfatos .
Las exorribonucleasas existen en todos los reinos de la vida, las bacterias , las arqueas y los eucariotas . Las exorribonucleasas están involucradas en la degradación de muchas especies diferentes de ARN, incluido el ARN mensajero , el ARN de transferencia , el ARN ribosómico y el miARN . Las exorribonucleasas pueden ser proteínas individuales (como la ARNasa D o la ARNasa PH ) pero también pueden ser complejos de múltiples proteínas, como el complejo de exosomas (en el que están representadas cuatro de las principales familias de exorribonucleasas).
Familia | Ejemplos de miembros | Distribución | Actividad catalítica |
---|---|---|---|
RNR | ARNasa R | La mayoría de las bacterias, todos los eucariotas. | 3'-5' hidrolítico |
ARNasa II | |||
Rrp44 | |||
Muerto | ARNasa D | Ciertas bacterias, todas eucariotas | 3'-5' hidrolítico |
ARNasa T | |||
PM/Scl-100 | |||
Oligoribonucleasa | |||
RBN | ARNasa BN | Ciertas bacterias | 3'-5' hidrolítico |
PDX | PNPasa | Todos los reinos | 3'-5' fosforolítico |
PM/Scl-75 | |||
ARNasa PH | |||
RRP4 | Rrp4 | Todos los eucariotas, la mayoría de las arqueas. | 3'-5' hidrolítico |
5 píxeles | Exorribonucleasa I | Todos los eucariotas | 5'-3' hidrolítico |
Exorribonucleasa II |