Exorribonucleasa

Clase de enzimas que degradan el ARN
Diagramas de reacción para la degradación del ARN por exorribonucleasa 3'-5' tanto hidrolítica (izquierda) como fosforolítica (derecha).

Una exorribonucleasa es una exonucleasa ribonucleasa , que son enzimas que degradan el ARN eliminando nucleótidos terminales del extremo 5' o del extremo 3' de la molécula de ARN. Las enzimas que eliminan nucleótidos del extremo 5' se denominan exorribonucleasas 5'-3' , y las enzimas que eliminan nucleótidos del extremo 3' se denominan exorribonucleasas 3'-5' .

Las exorribonucleasas pueden utilizar agua para romper el enlace nucleótido-nucleótido (que se denomina actividad hidrolítica) o fosfato inorgánico (que se denomina actividad fosforolítica). Las exorribonucleasas hidrolíticas se clasifican con el número CE 3.1 y las exorribonucleasas fosforolíticas con el número CE 2.7.7. Como las enzimas fosforolíticas utilizan fosfato inorgánico para romper enlaces, liberan nucleótidos difosfatos , mientras que las enzimas hidrolíticas (que utilizan agua) liberan nucleótidos monofosfatos .

Las exorribonucleasas existen en todos los reinos de la vida, las bacterias , las arqueas y los eucariotas . Las exorribonucleasas están involucradas en la degradación de muchas especies diferentes de ARN, incluido el ARN mensajero , el ARN de transferencia , el ARN ribosómico y el miARN . Las exorribonucleasas pueden ser proteínas individuales (como la ARNasa D o la ARNasa PH ) pero también pueden ser complejos de múltiples proteínas, como el complejo de exosomas (en el que están representadas cuatro de las principales familias de exorribonucleasas).

Familias mayores

FamiliaEjemplos de miembrosDistribuciónActividad catalítica
RNRARNasa RLa mayoría de las bacterias, todos los eucariotas.3'-5' hidrolítico
ARNasa II
Rrp44
MuertoARNasa DCiertas bacterias, todas eucariotas3'-5' hidrolítico
ARNasa T
PM/Scl-100
Oligoribonucleasa
RBNARNasa BNCiertas bacterias3'-5' hidrolítico
PDXPNPasaTodos los reinos3'-5' fosforolítico
PM/Scl-75
ARNasa PH
RRP4Rrp4Todos los eucariotas, la mayoría de las arqueas.3'-5' hidrolítico
5 píxelesExorribonucleasa ITodos los eucariotas5'-3' hidrolítico
Exorribonucleasa II

Véase también

Referencias

  • Zuo Y; Deutscher MP. (2001). "Superfamilias de exorribonucleasas: análisis estructural y distribución filogenética". Nucleic Acids Res . 29 (5): 1017–26. doi :10.1093/nar/29.5.1017. PMC  56904 . PMID  11222749.
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