Excisiónasa

Proteína similar a la escisasa
Estructura cristalina del complejo lambda xis-dna
Identificadores
SímboloExcª
PfamPF07825
Clan PfamCL0123
InterprofesionalIPR012884
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura

En biología molecular, la excisasa es una proteína bacteriófaga codificada por el gen Xis. Participa en la recombinación excisiva regulando el ensamblaje del intasoma excisivo e inhibiendo la integración viral . Adopta una estructura inusual de hélice alada en la que dos hélices alfa se empaquetan contra dos hebras extendidas. También está presente en la estructura una lámina beta antiparalela de dos hebras, cuyas hebras están conectadas por un ala de cuatro residuos. Durante la interacción con el ADN , se cree que la hélice alfa2 se inserta en el surco mayor, mientras que el ala entra en contacto con el surco menor adyacente o la estructura principal de fosfodiéster . La región C-terminal de la excisasa participa en la interacción con la integrasa codificada por fagos (Int), y una supuesta hélice alfa C-terminal puede plegarse tras la interacción con Int y/o ADN. [1]

Referencias

  1. ^ Sam MD, Papagiannis CV, Connolly KM, Corselli L, Iwahara J, Lee J, Phillips M, Wojciak JM, Johnson RC, Clubb RT (diciembre de 2002). "Regulación de la direccionalidad en la recombinación específica del sitio del bacteriófago lambda: estructura de la proteína Xis". J. Mol. Biol . 324 (4): 791–805. doi :10.1016/S0022-2836(02)01150-6. PMID  12460578.
Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR012884
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