Los equipos se dividieron en 3 grupos de 3 equipos cada uno. Los equipos jugarían entre sí en partidos de ida y vuelta. Los 2 ganadores de grupo con el mejor récord clasificarían. El ganador del grupo con el peor récord avanzaría al Play-off Intercontinental CONMEBOL / OFC .
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El sorteo de los grupos clasificatorios tuvo lugar en Zúrich , Suiza, el 12 de diciembre de 1987. Durante el sorteo, los equipos fueron seleccionados de 3 bombos preclasificados para los 3 grupos clasificatorios.
1 El partido fue abandonado en el minuto 67 con Brasil ganando 1-0 después de que Chile abandonara el campo cuando un petardo lanzado desde la multitud supuestamente golpeó al portero Roberto Rojas en la cabeza, dejándolo ensangrentado y teniendo que ser sacado del campo en una camilla; una investigación posterior de la FIFA encontró que la lesión de Rojas fue autoinfligida, utilizando una hoja de afeitar oculta en su guante. El 13 de septiembre, el partido fue otorgado 2-0 a Brasil, y Chile fue prohibido de clasificarse para la siguiente Copa del Mundo . Rojas fue sancionado de por vida del fútbol competitivo (levantado en 2001), al igual que el entrenador chileno Orlando Aravena , el vicecapitán Fernando Astengo y el médico del equipo Daniel Rodríguez.
Eliminatorias interconfederales
El ganador de este play-off se clasificó para la Copa Mundial de la FIFA de 1990.
Equipo 1
Agreg.Puntaje agregado de la descripción emergente
^ El partido Chile-Venezuela se jugó en campo neutral en Argentina en lugar de en Chile porque Chile fue sancionado por disturbios durante el partido Chile vs Brasil.