Andreas Dräger
Bioinformático alemán (nacido en 1980)
Andreas Dräger
Dräger en la Conferencia Internacional sobre Biología de Sistemas (ICSB) en Okinawa 2019
Nacido( 20 de septiembre de 1980 )20 de septiembre de 1980 (44 años)
Wippra , Alemania del Este
Alma máter
Conocido porModelado matemático de enfermedades infecciosas , JSBML
Niñostres
Premios
Carrera científica
Campos
Instituciones
TesisModelado computacional de redes bioquímicas  (2011)
Asesor de doctoradoAndreas Zell
Otros asesores académicos
Sitio webuni-tuebingen.de/es/127116

Andreas Dräger ( en alemán: [anˈdʁeːas ˈdʁɛːɡɐ] ; nacido el 20 de septiembre de 1980) es un bioinformático alemán que dirige el grupo de investigación de análisis de datos y bioinformática en la Universidad Martin Luther de Halle-Wittenberg .

Educación

En la escuela secundaria, Dräger estaba fascinado por la informática y los recientes avances en genética y biotecnología a finales de la década de 1990. Cuando se enteró de un nuevo programa de grado que permitía combinar esas tecnologías, se sintió inspirado de inmediato. Así, Dräger estudió bioinformática en la Universidad Martin Luther de Halle-Wittenberg en Halle (Saale) de 2000 a 2006. Trabajó como pasante de secuenciación genómica en el Instituto Max Planck de Genética Molecular , Berlín . Preparó su tesis sobre bacterias resistentes a metales pesados ​​en el departamento de microbiología de la Universidad de Illinois en Chicago . Dräger obtuvo su doctorado en el Centro de Bioinformática de Tübingen (ZBIT), centrándose en la simulación dinámica de redes metabólicas en un hígado virtual . Durante este tiempo, trabajó como estudiante visitante de investigación en ingeniería de software en la Universidad de Keio en Yokohama en 2010. Después de regresar de Japón, la Facultad de Ciencias de la Universidad de Tübingen honró su tesis con el premio de disertación de 2011. [a]

Carrera

A principios de 2011, Dräger recibió financiación para un proyecto de investigación independiente como líder de grupo junior postdoctoral. En 2013, emprendió otro programa postdoctoral de dos años como becario de investigación Marie-Curie en La Jolla . Trabajó en el Grupo de Investigación de Biología de Sistemas en la UCSD (la Universidad de California, San Diego ). Al regresar a Tübingen en 2015, fundó un grupo de investigación independiente en la universidad. En 2018 fue nombrado profesor junior de Biología de Sistemas Computacionales de Infecciones y Patógenos Resistentes a los Antimicrobianos dentro del recién creado Instituto interfacultativo de Bioinformática e Informática Médica (IBMI) de Tübingen. Su grupo de investigación pertenecía al Clúster de Excelencia de Tübingen , "Control de microbios para combatir infecciones" (CMFI). En febrero de 2024, Dräger fue nombrado profesor universitario y desde entonces ocupa la cátedra de análisis de datos y bioinformática en la Universidad Martin Luther de Halle-Wittenberg , [b] mientras que su grupo sigue siendo parte del Centro Nacional Alemán de Investigación de Infecciones (DZIF) en la Universidad de Tübingen .

Investigación

La investigación de Andreas Dräger se centra en modelos matemáticos de los mecanismos metabólicos detrás de la resistencia a los antibióticos. El aspecto central de su grupo de investigación es el microbioma humano que vive dentro de las vías respiratorias desde las cavidades nasales hasta los pulmones . Dräger tiene como objetivo identificar nuevas formas de combatir las infecciones bacterianas [1] [2] y virales potencialmente mortales . [3] [4] Las infecciones adquiridas en el hospital del tracto respiratorio tienen la máxima prioridad del esfuerzo porque a menudo involucran gérmenes con multirresistencia al tratamiento con antibióticos. Las bacterias particularmente dañinas en este hábitat incluyen Pseudomonas aeruginosa [5] [2] y Staphylococcus aureus [ 1] Otra área de investigación involucra a los grupos de riesgo, como los pacientes con fibrosis quística . La aplicación de modelos de redes metabólicas para este esfuerzo requiere una comprensión integral de los procesos subyacentes de las interacciones mutuas entre patógenos , bacterias comensales y su anfitrión . [6] [7]

Este trabajo también requiere el desarrollo de software especializado para crear, analizar y compartir modelos informáticos en biología de sistemas en general. Por esta razón, el grupo también participa activamente en varios esfuerzos de estandarización en biología de sistemas [8] que forman parte de las iniciativas de la Red de Modelado Computacional en Biología de investigadores internacionales. Dräger ve la interoperabilidad mejorada y la reutilización de los modelos informáticos desarrollados de acuerdo con los principios de datos FAIR (encontrables, accesibles, interoperables y reutilizables) como un requisito previo para la implementación confiable de la simulación por computadora en biología. [9] Con este fin, Dräger y su grupo desarrollan software científico de código abierto , como JSBML o SBSCL . [10] En 2015, la comunidad científica lo eligió como editor para desarrollar el formato de archivo de biología de sistemas SBML y en 2018 como editor para el lenguaje de modelado gráfico SBGN . [11] En 2016, Dräger fue uno de los fundadores de la reunión anual de la comunidad con un interés especial en el modelado de sistemas (SysMod) [12] dentro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) , donde se desempeñó como presidente de facto desde 2018 hasta que renunció en 2022. [13]

Durante la pandemia de COVID-19 , el trabajo de Dräger sobre el modelado computacional del SARS-CoV-2 dentro de células humanas [14] [15] despertó interés internacional [c] [d] [e] [f] [g] [h] [i] porque predijo objetivos potencialmente explotables para el desarrollo de fármacos. Uno de ellos es la enzima humana guanilato quinasa . El trabajo en curso de Dräger sobre este tema se centra en la preparación para pandemias. [16]

Compromiso y Voluntariado

Durante más de tres años impartió un curso de bioinformática y biología de sistemas para estudiantes de secundaria en el instituto "Otto-Hahn" de Nagold , incluida una tutoría en el concurso de investigadores jóvenes . [j]

  • Publicaciones de Andreas Dräger indexadas en Google Scholar
  • El grupo de investigación de Andreas Dräger
  • Software para biología de sistemas
  • Canal de YouTube de Andreas Dräger

Apariciones en noticias y medios públicos (selección)

  1. ^ "Zentrale Promotionsfeier der Universität Tübingen" [Ceremonia central de graduación de la Universidad de Tübingen]. Boletín informativo Uni Tübingen aktuell nr. 4/2011: Termine und Veranstaltungen (en alemán). Universidad de Tubinga . 2011-07-16.
  2. ^ Universidad Martín Lutero Halle-Wittenberg (27 de marzo de 2024). "Neue Professorinnen und Professoren an der Universität Halle". Neue Professorinnen und Professoren an der Universität Halle (en alemán). Halle (Saale) . Consultado el 8 de agosto de 2024 .{{cite web}}: Mantenimiento CS1: fecha y año ( enlace )
  3. ^ Wittig, Frank (18 de marzo de 2021). "¿Wo bleiben die Medikamente?" [¿Dónde están las drogas?]. odysso - Wissen im SWR (en alemán). SWR Fernsehen .
  4. ^ Agustín, Birgit (3 de febrero de 2021). "Corona: Wie wirksam sind neue Medikamente gegen das Virus?" [Corona: ¿Qué tan efectivos son los nuevos medicamentos contra el virus?]. Visita (en alemán). Norddeutscher Rundfunk .
  5. ^ Petrunova, Tsvetelina (17 de enero de 2021). "Ексклузивно: Първа стъпка към откриването лекарство срещу COVID-19" [Exclusiva: Primer paso hacia el descubrimiento de un fármaco contra el COVID-19]. Тази неделя (en búlgaro). bTV (Bulgaria) .
  6. ^ Beremliyski, Nikolay (17 de enero de 2021). "СЛАБОТО МЯСТО НА COVID-19: ¿Bliso ли сме до победата над заразата?" [EL PUNTO DEBILIDAD DEL COVID-19: ¿Estamos cerca de vencer a la plaga?]. неделята (en búlgaro). Nova (canal de televisión búlgaro) .
  7. ^ "Ученые РФ и ФРГ нашли способы уничтожать COVID-19" [Científicos de Rusia y Alemania han encontrado formas de destruir el COVID-19]. Смотрим (en ruso). Rusia-24 . 2021-11-01.
  8. ^ Hannemann, Cornelia (10 de enero de 2021). "Entdeckung könnte Weg zu Corona-Medikament ebnen" [El descubrimiento podría allanar el camino hacia el fármaco Corona]. Wissen (en alemán). n-tv .
  9. ^ Priese, Anna (9 de enero de 2021). "Neuer Ansatz für Corona-Therapie an Tübinger Uni" [Nuevo enfoque para la terapia corona en la Universidad de Tübingen]. SWR Aktuell (en alemán). SWR Fernsehen .
  10. ^ "Mit Stolz präsentieren sie erste Ergebnisse" [Presentan con orgullo sus primeros resultados]. Schwarzwälder Bote (en alemán). Schwarzwald Bote Mediengesellschaft mbH. 2021-07-21.

Referencias

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  3. ^ Bernardes, Joana P.; Mishra, Neha; Tran, Florián; Bahmer, Thomas; Mejor, Lena; Blase, Juana I.; Bordoni, Dora; Franzenburg, Jeanette; Geisen, Ulf; Josephs-Spaulding, Jonathan; Kohler, Philipp; Kunstner, Axel; Rosati, Elisa; Aschenbrenner, Anna C.; Bacher, Petra; Barán, Nathan; Boysén, Teide; Brandt, Burkhard; Bruse, Niklas; Dörr, Jonathan; Dräger, Andreas; Elke, Gunnar; Ellinghaus, David; Fischer, Julia; Forster, Michael; Franke, André; Franzenburg, Sören; Frey, Norberto; Friedrichs, Anette; Fuß, Janina; Glück, Andreas; Hamm, Jacob; Hinrichsen, finlandés; Hoeppner, Marc P.; Hola, Simón; Juenker, Ralf; Káiser, Sina; Kan, Ying H.; Loma, Rainer; Lange, Christoph; Laue, Georg; Mentiroso, Clemes; Lindner, Matías; Marinos, Georgios; Markewitz, Robert; Nattermann, Jacob; Nada, Rainer; Recolectores, Peter; Rabe, Klaus F.; Renz, Alina; Roecken, Christoph; Rupp, enero; Schaffarzyk, Annika; Scheffold, Alejandro; Schulte-Schrepping, Jonas; Schunck, Domagoj; Skowasch, Dirk; Ulas, Tomás; Wandinger, Klaus-Peter; Wittig, Michael; Zimmermann, Johannes; Busch, Hauke; Hoyer, Bimba F.; Kaleta, Christoph; Heyckendorf, enero; Kox, Matthijs; Rybniker, enero; Schreiber, Stefan; Schultze, Joaquín; Rosenstiel, Felipe; Banovich, Nicolás E.; Desai, Tushar; Eickelberg, Oliver; Haniffa, Muzlifa; Horvath, Pedro; Kropski, Jonathan A.; Lafyatis, Robert; Lundeberg, Joakim; Meyer, Kerstin; Nawijn, Martijn C.; Nikolic, Marko; Ordovás Montañés, José; Pe'er, Dana; Tata, Purushothama Rao; Rawlins, Emma; Regev, Aviv; Reyfman, Paul; Samakovlis, Christos; Schultze, Joaquín; Shalek, Alex; Pastor, Douglas; Spence, Jason; Teichmann, Sarah; Theis, Fabián; Tsankov, Alejandro; van den Berge, Martín; Von Papen, Michael; Whitsett, Jeffrey; Zaragosí, Laure Emmanuelle; Angelov, ángel; Bals, Robert; Bartolomé, Alejandro; Becker, Anke; Bezdán, Daniela; Bonifacio, Ezio; Bork, compañero; Clavel, Tomás; Colme-Tatche, María; Diefenbach, Andreas; Dilthey, Alejandro; Fischer, Nicole; Förstner, Konrad; Frick, Julia Stefanie; Gagneur, Julien; Goesmann, Alejandro; Hain, Torsten; Hummel, Michael; Janssen, Stefan; Kalinowski, Jörn; Kallies, René; Kehr, Birte; Keller, Andrés; Kim-Hellmuth, Sarah; Klein, Christoph; Kohlbacher, Oliver; Korbel, Jan O.; Kurth, Ingo; Landthaler, Markus; Li, Yang; Ludwig, Kerstin; Makarewicz, Oliwia; Marz, Manja; McHardy, Alicia; Mertes, cristiano; Nöthen, Markus; Núremberg, Peter; Ohler, Uwe; Ossowski, Stephan; Overmann, Jörg; Pedro, Silke; Pfeffer, Klaus; Poetsch, Anna R.; Pühler, Alfred; Rajewsky, Niklaus; Ralser, Markus; Riess, Olaf; Ripke, Stephan; Nunes da Rocha, Ulises; Saliba, Antoine Emmanuel; Sander, Leif Erik; Sawitzki, Birgit; Schiffer, Philipp; Schulte, Eva Cristina; Sczyrba, Alejandro; Stegle, Oliver; Stoye, Jens; Vehreschild, Janne; Vogel, Jörg; Kleist, Max von; Caminante, Andrés; Walter, Jörn; Wieczorek, Dagmar; Ziebuhr, John (2020). "Los análisis multiómicos longitudinales identifican respuestas de megacariocitos,células eritroides y plasmablastos como marcadores de trayectorias graves de COVID-19”.Inmunidad . 53 (6): 1296–1314.e9. doi :10.1016/j.immuni.2020.11.017. ISSN  1074-7613. PMC  7689306 . PMID  33296687. S2CID  227163641.
  4. ^ Ostaszewski, Marek; et al. (2021). "Mapa de la enfermedad COVID19, un repositorio de conocimiento computacional de los mecanismos de interacción virus-huésped". Biología de sistemas moleculares . 17 (10): e10387. doi :10.15252/msb.202110387. PMC 8524328 . PMID  34664389. S2CID  239027089. 
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