Depsipéptido

Un depsipéptido es un péptido en el que uno o más de sus grupos amida , -C(O)NHR-, se reemplazan por el éster correspondiente , -C(O)OR-. [1] Muchos depsipéptidos tienen enlaces peptídicos y ésteres. [2] La eliminación del grupo N–H en una estructura peptídica da como resultado una disminución de la capacidad de unión de H, que es responsable de la estructura secundaria y los patrones de plegamiento de los péptidos, induciendo así la deformación estructural de las estructuras de hélice y lámina β. [2] [3] Debido a la disminución de la deslocalización por resonancia en los ésteres en relación con las amidas, los depsipéptidos tienen barreras rotacionales más bajas para la isomerización cis-trans y, por lo tanto, tienen estructuras más flexibles que sus análogos nativos. [2] [3] Se encuentran principalmente en productos naturales marinos y microbianos. [4]

Ejemplo de un depsipéptido con 3 grupos amida (resaltados en azul ) y un grupo éster (resaltado en verde ). R 1 y R 3 son grupos orgánicos (por ejemplo, metilo) o un átomo de hidrógeno que se encuentra en los ácidos α-hidroxicarboxílicos. R 2 , R 4 y R 5 son grupos orgánicos o un átomo de hidrógeno que se encuentra en aminoácidos comunes.

Productos naturales Depsipeptide

La enteroquelina es un depsipéptido que transporta hierro. [5]

Se ha descubierto que varios depsipéptidos exhiben propiedades anticancerígenas. [6]

Un inhibidor de la enzima depsipeptídica es la romidepsina , un miembro de la clase de péptidos bicíclicos, un inhibidor conocido de la histona desacetilasa (HDACi). Fue aislada por primera vez como un producto de fermentación de Chromobacterium violaceum por la compañía farmacéutica Fujisawa. [7]

En 2010, se demostró en datos preliminares que la etamicina tiene una potente actividad contra el SAMR en un modelo de ratón. [8] Varios depsipéptidos de Streptomyces exhiben actividad antimicrobiana. [9] [10] Estos forman una nueva clase potencial de antibióticos conocidos como acildepsipéptidos ( ADEP ). Los ADEP se dirigen a la proteasa lítica de caseína ( ClpP ) y la activan para iniciar la degradación descontrolada de péptidos y proteínas desplegadas, matando a muchas bacterias Gram-positivas. [11] [12] [13]

Los depsipéptidos se pueden formar a través de una reacción de Passerini . [14]

Referencias

  1. ^ IUPAC , Compendio de terminología química , 2.ª edición (el "Libro de oro") (1997). Versión corregida en línea: (2006–) "depsipeptides". doi :10.1351/goldbook.D01604
  2. ^ abc Avan, Ilker; Tala, Srinivasa R.; Steel, Peter J.; Katritzky, Alan R. (17 de junio de 2011). "Síntesis de depsipéptidos y oligoésteres mediada por benzotriazol". The Journal of Organic Chemistry . 76 (12): 4884–4893. doi :10.1021/jo200174j. PMID  21452874.
  3. ^ ab Avan, Ilker; Hall, C. Dennis; Katritzky, Alan R. (2014). "Peptidomiméticos a través de modificaciones de aminoácidos y enlaces peptídicos". Chemical Society Reviews . 43 (10): 3575–3594. doi :10.1039/C3CS60384A. PMID  24626261.
  4. ^ Yasumasa Hamada; Takayuki Shioiri (2005). "Progreso reciente de los estudios sintéticos de péptidos cíclicos marinos biológicamente activos y depsipéptidos". Chem. Rev. 105 ( 12): 4441–4482. doi :10.1021/cr0406312. PMID  16351050.
  5. ^ Walsh; Christopher T.; Jun Liu; Frank Rusnak; Masahiro Sakaitani (1990). "Estudios moleculares sobre enzimas en el metabolismo del corismato y la vía biosintética de la enterobactina". Chemical Reviews . 90 (7): 1105–1129. doi :10.1021/cr00105a003.
  6. ^ Kitagaki, J.; Shi, G.; Miyauchi, S.; Murakami, S.; Yang, Y. (2015). "Depsipéptidos cíclicos como posibles terapias contra el cáncer". Medicamentos contra el cáncer . 26 (3): 259–71. doi :10.1097/CAD.0000000000000183. PMID  25419631. S2CID  22071968.
  7. ^ Yurek-George, Alexander; Cecil, Alexander Richard Liam; Mo, Alex Hon Kit; Wen, Shijun; Rogers, Helen; Habens, Fay; Maeda, Satoko; Yoshida, Minoru; et al. (2007). "Los primeros análogos sintéticos biológicamente activos de FK228, el inhibidor de la histona desacetilasa del depsipéptido". Journal of Medicinal Chemistry . 50 (23): 5720–5726. doi :10.1021/jm0703800. PMID  17958342.
  8. ^ Prisa, Nina M; Perera, Varahenage R; Maloney, Katherine N; Tran, Dan N; Jensen, Pablo; Fenical, William; Nizet, Víctor; Hensler, María E (2010). "Actividad del antibiótico estreptogramina etamicina contra Staphylococcus aureus resistente a meticilina". Revista de antibióticos . 63 (5): 219–24. doi :10.1038/ja.2010.22. PMC 2889693 . PMID  20339399. 
  9. ^ KH Michel, RE Kastner (Eli Lilly and Company), EE. UU. 4492650, 1985 [Chem. Abstr. 1985, 102, 130459]
  10. ^ Osada, Hiroyuki; Yano, Tatsuya; Koshino, Hiroyuki; Isono, Kiyoshi (1991). "Enopeptina A, un nuevo antibiótico depsipéptido con actividad antibacteriófago". The Journal of Antibiotics . 44 (12): 1463–1466. doi : 10.7164/antibiotics.44.1463 . PMID  1778798.
  11. ^ Li; Él Shun, Dominic; Guarne, Alba; Maurizi, Michael R.; Cheng, Yi-Qiang; Wright, Gerard D.; Ghirlando, Rodolfo; José, Ebenezer; Gloyd, Melanie; Seon Chung, Yu; Ortega, Joaquín (2010). "Los antibióticos acildepsipéptidos inducen la formación de un canal axial estructurado en ClpP: un modelo para el estado de ClpP unido a ClpX/ClpA". Química y Biología . 17 (9): 959–969. doi :10.1016/j.chembiol.2010.07.008. PMC 2955292 . PMID  20851345. 
  12. ^ Hinzen, Berthold; Labischinski, Harald; Brötz-Oesterhelt, Heike ; Endermann, Rainer; Benet-Buchholz, Jordi; Hellwig, Verónica; Habich, Dieter; Schumacher, Andrés; Lámpara, Thomas; Paulsen, Holger; Raddatz, Siegfried (2006). "Optimización de la química medicinal de los acildepsipéptidos de los antibióticos de la clase enopeptina". ChemMedChem . 1 (7): 689–693. doi :10.1002/cmdc.200600055. PMID  16902918. S2CID  36525372.
  13. ^ Carney, Daniel W.; Schmitz, Karl R.; Truong, Jonathan V.; Sauer, Robert T.; Sello, Jason K. (2014). "La restricción de la dinámica conformacional de los antibióticos acildepsipéptidos cíclicos mejora su actividad antibacteriana". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 136 (5): 1922–1929. doi : 10.1021/ja410385c . PMC 4004210 . PMID  24422534. 
  14. ^ Li, Jie Jack (2021), "Reacción de Passerini", Reacciones de nombres , Cham: Springer International Publishing, págs. 424–426, doi :10.1007/978-3-030-50865-4_115, ISBN 978-3-030-50864-7, consultado el 26 de octubre de 2022

Lectura adicional

  • papuamida Ford, PW; Gustafson, KR; McKee, TC; Shigematsu, N; Maurizi, LK; Pannell, LK; Williams, DE; de Silva, ED; Lassota, P; Allen, TM; Van Soest, R; Andersen, RJ; Boyd, señor (1999). "Papuamidas AD, depsipéptidos citotóxicos e inhibidores del VIH de las esponjas Theonella mirabilis y Theonella swinhoei recolectadas en Papúa Nueva Guinea". J. Am. Química. Soc . 121 : 5899–5909. doi :10.1021/ja990582o.
  • Neamphamide A Oku, N; Gustafson, KR; Cartner, LK; Wilson, JA; Shigematsu, N; Hess, S; Pannell, LK; Boyd, MR; McMahon, JB (2004). "Neamphamide A. Un nuevo depsipéptido inhibidor del VIH de la esponja marina de Papúa Nueva Guinea Neamphius huxleyi ". J. Nat. Prod . 67 (8): 1407–11. doi :10.1021/np040003f. PMID  15332865.
  • callipeltin A Zampella, A; D'Auria, MV; Paloma, LG; Casapullo, A; Minale, L; Débito, C; Henin, Y (1996). "Callipeltin A, un depsipéptido cíclico contra el VIH de la esponja Lithistida Callipelta sp de Nueva Caledonia ". J. Am. Química. Soc . 118 (26): 6202–9. doi :10.1021/ja954287p.
  • mirabamides AD Plaza, A; Gustchina, E; Baker, HL; Kelly, M; Bewley, CA (2007). "Mirabamides AD. Depsipéptidos de la esponja Siliquariaspongia mirabilis que inhiben la fusión del VIH-1". J. Nat. Prod . 70 (11): 1753–60. doi :10.1021/np070306k. PMID  17963357.; Andjelic, CD; Planelles, V; Barrows, LR (2008). "Caracterización de la actividad anti-VIH de la papuamida A" . Mar Drugs . 6 (4): 528–49. doi : 10.3390/md20080027 . PMC 2630844 . PMID  19172193. 
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