DEK (gen)

DEK
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	1T1V, 2JX3
Identificadores
Alias	DEK , D6S231E, protooncogén DEK
Identificaciones externas	OMIM : 125264; MGI : 1926209; HomoloGene : 2593; Tarjetas genéticas : DEK; OMA :DEK - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 6 (humano)
Fin	18.264.548 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 13 (ratón)
Fin	47.259.677 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	tendón de Aquiles; ; epitelio de la nasofaringe; ; zona ventricular; ; tibia; ; eminencia ganglionar; ; hueso trabecular; ; líquido amniótico; ; epitelio germinal; ; piel de la cadera; ; mucosa yeyunal;
	Top expresado en
	cola del embrión; ; cigoto; ; tubérculo genital; ; ovocito secundario; ; ovocito primario; ; epiblast; ; médula ósea; ; zona ventricular; ; timo; ; saco vitelino;
	Más datos de expresión de referencia
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	Unión del ADN; unión de histonas; unión de la cromatina; Unión de ARN;
Componente celular	nucleoplasm; fibra contráctil; núcleo;
Proceso biológico	Mantenimiento epigenético de la cromatina en conformación competente para la transcripción.; replicación del genoma viral; Regulación de la reparación de roturas de doble cadena mediante unión de extremos no homólogos; transcripción por la ARN polimerasa II; Regulación de la transcripción por la ARN polimerasa II; Regulación de la reparación de roturas de doble cadena; transducción de señales; remodelación de la cromatina; organización de la cromatina;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	7913
	110052
	ENSG00000124795
	ENSMUSG00000021377
	P35659
	Q7TNV0
	NM_001134709 ; NM_003472
	Número nuevo_025900
	NP_001128181 ; NP_003463
	NP_080176
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

El gen DEK humano codifica la proteína DEK . ^[5]^[6]

Función

Este gen codifica una proteína con un dominio SAP. La proteína se une al ADN cruciforme y al ADN enrollado en una superhélice , induciendo así superenrollamientos positivos en el ADN circular cerrado. También está involucrado en la selección del sitio de empalme durante el procesamiento del ARNm . Las aberraciones cromosómicas que involucran a esta región aumentan la expresión de este gen y la presencia de anticuerpos contra esta proteína, todo lo cual está asociado con varias enfermedades. ^[6]

Interacciones

DEK interactúa con TFAP2A . ^[7]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000124795 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000021377 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
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^ ab "Entrez Gene: oncogén DEK DEK (unión al ADN)".
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Lectura adicional

von Lindern M, Fornerod M, Soekarman N, van Baal S, Jaegle M, Hagemeijer A, Bootsma D, Grosveld G (1992). "La translocación t(6;9) en la leucemia no linfocítica aguda da como resultado la formación de un gen de fusión DEK-CAN". Baillière's Clinical Haematology . 5 (4): 857–79. doi :10.1016/s0950-3536(11)80049-1. PMID 1308167.
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Enlaces externos

PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para la proteína humana DEK

Este artículo sobre un gen del cromosoma humano 6 es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000124795 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000021377 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .

[pmid1549122-5] von Lindern M, Fornerod M, van Baal S, Jaegle M, de Wit T, Buijs A, Grosveld G (abril de 1992). "La translocación (6;9), asociada con un subtipo específico de leucemia mieloide aguda, da como resultado la fusión de dos genes, dek y can, y la expresión de un ARNm quimérico dek-can específico de la leucemia". Mol. Cell. Biol . 12 (4): 1687–97. doi :10.1128/mcb.12.4.1687. PMC 369612. PMID 1549122 .

[entrez-6] "Entrez Gene: oncogén DEK DEK (unión al ADN)".

[pmid12595566-7] Campillos M, García MA, Valdivieso F, Vázquez J (marzo de 2003). "La activación transcripcional por AP-2alpha está modulada por el oncogén DEK". Nucleic Acids Res . 31 (5): 1571–5. doi :10.1093/nar/gkg247. PMC 149840 . PMID 12595566.