Receptores similares a la rodopsina
Familia de proteínas
Receptores similares a la rodopsina
Estructura de la rodopsina: receptor acoplado a proteína AG. [1]
Identificadores
Símbolo7tm_1
PfamPF00001
Clan PfamGPCR_A
InterprofesionalIPR000276
PROSITIOPDOC00211
SCOP21f88 / ALCANCE / SUPFAM
Superfamilia OPM6
Proteína OPM1 gzm
Diligenciamiento de conflictoscd00637
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura
AP1U19 2R4R 2R4S 2RH1 1f88 , 1hzx , 1l9h , 2g87 , 2hpy , 2i35 , 2i36 , 2i37 , 2j4y , 2ped

Los receptores similares a la rodopsina son una familia de proteínas que comprenden el grupo más grande de receptores acoplados a proteína G. [ 2]

Alcance

Los receptores acoplados a proteína G, GPCR, constituyen una vasta familia de proteínas que abarca una amplia gama de funciones (incluidos varios procesos autocrinos, paracrinos y endocrinos). Muestran una diversidad considerable a nivel de secuencia, sobre la base de la cual se pueden separar en grupos distintos. Los GPCR suelen describirse como "superfamilia" porque abarcan un grupo de familias para las que existen indicios de relación evolutiva, pero entre las que no hay una similitud estadísticamente significativa en la secuencia. [2] Los miembros de la superfamilia actualmente conocidos incluyen los GPCR similares a la rodopsina (esta familia), los GPCR similares a la secretina , los receptores de AMPc , los receptores de feromonas de apareamiento fúngico y la familia de receptores de glutamato metabotrópicos . Existe una base de datos especializada para GPCR . [3]

Función

Los GPCR similares a la rodopsina representan una familia de proteínas muy extendida que incluye receptores de hormonas, neuropéptidos, neurotransmisores y luz, todos los cuales transducen señales extracelulares a través de la interacción con proteínas de unión al nucleótido de guanina (G). Aunque sus ligandos activadores varían ampliamente en estructura y carácter, las secuencias de aminoácidos de los receptores son muy similares y se cree que adoptan un marco estructural común que comprende 7 hélices transmembrana (TM). [4] [5] [6]

Clases

Los GPCR similares a rodopsina se han clasificado en los siguientes 19 subgrupos (A1-A19) según un análisis filogenético. [7]

Subfamilia A1

Subfamilia A2

Subfamilia A3

Subfamilia A4

Subfamilia A5

Subfamilia A6

Subfamilia A7

Subfamilia A8

Subfamilia A9

Subfamilia A10

Subfamilia A11

Subfamilia A12

Subfamilia A13

Subfamilia A14

Subfamilia A15

Subfamilia A16

Subfamilia A17

Subfamilia A18

Subfamilia A19

Sin clasificar

Referencias

  1. ^ Palczewski K, Kumasaka T, Hori T, et al. (agosto de 2000). "Estructura cristalina de la rodopsina: receptor acoplado a proteína AG". Science . 289 (5480): 739–45. Bibcode :2000Sci...289..739P. doi :10.1126/science.289.5480.739. PMID  10926528.
  2. ^ ab Attwood TK, Findlay JB (1994). "Huellas dactilares de receptores acoplados a proteína G". Protein Eng . 7 (2): 195–203. doi :10.1093/protein/7.2.195. PMID  8170923.
  3. ^ "Sistema de información para receptores acoplados a proteína G". GPCRDB . www.gpcr.org. Archivado desde el original el 22 de abril de 2009 . Consultado el 5 de diciembre de 2008 .
  4. ^ Birnbaumer L (1990). "Proteínas G en la transducción de señales". Annu. Rev. Pharmacol. Toxicol . 30 : 675–705. doi :10.1146/annurev.pa.30.040190.003331. PMID  2111655.
  5. ^ Gilman AG, Casey PJ (1988). "Participación de la proteína G en el acoplamiento receptor-efector". J. Biol. Chem . 263 (6): 2577–2580. doi : 10.1016/S0021-9258(18)69103-3 . PMID  2830256.
  6. ^ Attwood TK, Findlay JB (1993). "Diseño de una huella digital discriminante para receptores acoplados a proteína G". Protein Eng . 6 (2): 167–176. doi :10.1093/protein/6.2.167. PMID  8386361.
  7. ^ Joost P, Methner A (2002). "Análisis filogenético de 277 receptores acoplados a proteína G humanos como herramienta para la predicción de ligandos de receptores huérfanos". Genome Biol . 3 (11): research0063.1–0063.16. doi : 10.1186/gb-2002-3-11-research0063 . PMC 133447. PMID  12429062 . 
  8. ^ Terakita A (2005). "Las opsinas". Genome Biol . 6 (3): 213. doi : 10.1186 /gb-2005-6-3-213 . PMC 1088937. PMID  15774036. 
  9. ^ ab Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (septiembre de 2011). "Investigaciones independientes de HHsearch, basadas en Needleman—Wunsch y análisis de motivos revelan la jerarquía general de la mayoría de las familias de receptores acoplados a proteína G". Biología molecular y evolución . 28 (9): 2471–80. doi : 10.1093/molbev/msr061 . PMID  21402729.
  • Vriend G, Horn F, Oliveira L, Bywater RP, Cohen FE. "GPCRDB (Base de datos de receptores acoplados a proteína G): datos derivados de secuencias". Archivado desde el original el 14 de noviembre de 2007. Consultado el 10 de diciembre de 2007 .
  • Horn F, Bettler E, Oliveira L, Campagne F, Cohen FE, Vriend G (2003). "Sistema de información GPCRDB para receptores acoplados a proteína G". Nucleic Acids Res . 31 (1): 294–7. doi :10.1093/nar/gkg103. PMC  165550 . PMID  12520006. Esta base de datos incluye múltiples alineaciones de secuencias de todas las familias y subfamilias de GPCR.
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