This article relies largely or entirely on a single source. Relevant discussion may be found on the talk page. Please help improve this article by introducing citations to additional sources. Find sources: "2006 UEFA European Under-21 Championship qualification" – news · newspapers · books · scholar · JSTOR(December 2009)
Los grupos de clasificación para el Campeonato Europeo Sub-21 de la UEFA de 2006 coincidieron, en la medida de lo posible, con los grupos de clasificación para el Mundial de 2006 de 7 y 6 equipos de las selecciones absolutas europeas. Las excepciones fueron Andorra , Islas Feroe , Liechtenstein e Irlanda del Norte , ninguno de los cuales presentó un equipo sub-21. Alemania , cuya selección absoluta no necesitaba clasificarse para el Mundial (ya que será la anfitriona), fue añadida a uno de los grupos de 5 equipos creados por la ausencia de las naciones antes mencionadas.
Las 48 selecciones sub-21 participantes se dividieron en ocho grupos (seis grupos de 6 + un grupo de 5 + un grupo de 7). Los ocho primeros de grupo se enfrentaron a los ocho segundos en partidos de ida y vuelta para decidir los ocho equipos clasificados.