DDX42

DDX42
Identificadores
Alias	DDX42 , DDX42P, RHELP, RNAHP, SF3B8, SF3b125, helicasa de caja muerta 42
Identificaciones externas	OMIM : 613369; MGI : 1919297; HomoloGene : 49137; Tarjetas genéticas : DDX42; OMA :DDX42 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 17 (humano)
Fin	63.819.317 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 11 (ratón)
Fin	106.249.139 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	cuerpo del páncreas; ; trompa uterina derecha; ; mucosa gástrica; ; ovario izquierdo; ; ovario derecho; ; epitelio del colon; ; tendón de Aquiles; ; canal del cuello uterino; ; nervio sural; ; glándulas salivales menores;
	Top expresado en
	capa neural de la retina; ; zona ventricular; ; cola del embrión; ; tubo neural; ; epiblast; ; Giro dentado del hipocampo Formación de células granulares; ; lente; ; giro frontal superior; ; saco vitelino; ; timo;
	Más datos de expresión de referencia
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	unión de nucleótidos; unión a proteínas; actividad hidrolasa; Unión de ATP; actividad de helicasa; unión de ácidos nucleicos; Unión de ARN;
Componente celular	citoplasma; Cuerpo de Cajal; membrana; núcleo; nucleoplasm; citosol; mota nuclear; nucleolo;
Proceso biológico	localización de proteínas; Desenrollado de la estructura secundaria del ARN; Empalme de ARNm, a través del espliceosoma; Regulación del proceso apoptótico;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	11325
	72047
	ENSG00000198231
	ENSMUSG00000020705
	Q86XP3
	Q810A7
	Número de serie 007372 Número de ; serie 203499
	Número nuevo_028074
	NP_031398NP_987095;
	NP_082350 ; NP_001348569 ; NP_001348571 ; NP_001348572 ; NP_001348573
	Wikidatos
Ver/Editar humano	Ver/Editar ratón

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La helicasa de ARN dependiente de ATP DDX42 es una enzima que en los humanos está codificada por el gen DDX42 . ^[5]^[6]

Función

Este gen codifica un miembro de la familia de proteínas de la caja Asp - Glu - Ala -Asp (DEAD) . Los miembros de esta familia de proteínas son supuestas helicasas de ARN y están implicadas en una serie de procesos celulares que implican la alteración de la estructura secundaria del ARN , como el inicio de la traducción , el empalme nuclear y mitocondrial y el ensamblaje de ribosomas y espliceosomas . Se cree que los miembros de esta familia están involucrados en la embriogénesis , la espermatogénesis y el crecimiento y la división celular . Se han identificado dos variantes de transcripción que codifican la misma proteína para este gen. ^[6]

Interacciones

Se ha demostrado que DDX42 interactúa con SF3B1 . ^[7]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000198231 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020705 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Suk K, Kim S, Kim YH, Oh SH, Lee MK, Kim KW, Kim HD, Seo YS (abril de 2000). "Identificación de un nuevo miembro humano de la familia de proteínas DEAD box". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bases moleculares de las enfermedades . 1501 (1): 63–9. doi :10.1016/S0925-4439(00)00010-7. PMID 10727850.
^ ab "Entrez Gene: DDX42 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) caja polipéptido 42".
^ Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (septiembre de 2002). "Caracterización de nuevas proteínas SF3b y 17S U2 snRNP, incluyendo un homólogo de Prp5p humano y una proteína SF3b DEAD-box". The EMBO Journal . 21 (18): 4978–88. doi :10.1093/emboj/cdf480. PMC 126279 . PMID 12234937.

Lectura adicional

Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (noviembre de 2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización". Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573.
Uhlmann-Schiffler H, Jalal C, Stahl H (2006). "Ddx42p: una proteína DEAD box humana con actividades de chaperona de ARN". Investigación de ácidos nucleicos . 34 (1): 10–22. doi :10.1093/nar/gkj403. PMC 1325199 . PMID 16397294.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (noviembre de 2004). "Análisis fosfoproteómico del cerebro en desarrollo del ratón". Molecular & Cellular Proteomics . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747.
Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (septiembre de 2002). "Caracterización de nuevas proteínas SF3b y 17S U2 snRNP, incluyendo un homólogo de Prp5p humano y una proteína SF3b DEAD-box". The EMBO Journal . 21 (18): 4978–88. doi :10.1093/emboj/cdf480. PMC 126279 . PMID 12234937.

Este artículo sobre un gen del cromosoma humano 17 es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000198231 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020705 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[pmid10727850-5] Suk K, Kim S, Kim YH, Oh SH, Lee MK, Kim KW, Kim HD, Seo YS (abril de 2000). "Identificación de un nuevo miembro humano de la familia de proteínas DEAD box". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bases moleculares de las enfermedades . 1501 (1): 63–9. doi :10.1016/S0925-4439(00)00010-7. PMID 10727850.

[entrez-6] "Entrez Gene: DDX42 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) caja polipéptido 42".

[pmid12234937-7] Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (septiembre de 2002). "Caracterización de nuevas proteínas SF3b y 17S U2 snRNP, incluyendo un homólogo de Prp5p humano y una proteína SF3b DEAD-box". The EMBO Journal . 21 (18): 4978–88. doi :10.1093/emboj/cdf480. PMC 126279 . PMID 12234937.