Conectoma de referencia de Budapest
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| Desarrollador(es) | Balázs Szalkai, Csaba Kerepesi, Bálint Varga, Vince Grolmusz |
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| Versión estable | 3.0 |
| Escrito en | Perl , JavaScript , WebGL |
| Disponible en | Inglés |
| Tipo | Conectómica |
| Sitio web | pitgroup.org/connectome/ |
El servidor de conectoma de referencia de Budapest calcula las conexiones anatómicas cerebrales que aparecen con frecuencia en 418 sujetos sanos. [1] [2] Se ha preparado a partir de conjuntos de datos de resonancia magnética de difusión del Proyecto Conectoma Humano en un conectoma de referencia (o gráfico cerebral ), que se puede descargar en formatos CSV y GraphML y visualizar en el sitio en 3D.
Características
El conectoma de referencia de Budapest tiene 1015 nodos, que corresponden a áreas de materia gris identificadas anatómicamente. El usuario puede establecer numerosos parámetros y el conectoma de consenso resultante se visualiza fácilmente en la página web. [2] Los usuarios pueden hacer zoom, rotar y consultar la etiqueta anatómica de los nodos en el componente gráfico.
Fondo
El conectoma de referencia de Budapest es un gráfico de consenso de los gráficos cerebrales de 96 sujetos en la versión 2 y 418 sujetos en la versión 3. Solo se devuelven los bordes que están presentes en un porcentaje determinado de los sujetos. Cada uno de los bordes seleccionados tiene un peso determinado en cada uno de los gráficos que contienen ese borde, por lo que estos pesos múltiples se combinan en un único peso, tomando su media (es decir, promedio) o mediana. La interfaz de usuario permite la personalización de estos parámetros: el usuario puede seleccionar la frecuencia mínima de los bordes devueltos. Hay una opción para ver y comparar los conectomas de referencia femeninos o masculinos. Los conectomas de las mujeres contienen significativamente más bordes que los de los hombres, y una porción más grande de los bordes en los conectomas de las mujeres discurren entre los dos hemisferios. [3] [4] [5]
Descubrimientos
El conectoma de referencia de Budapest ha llevado a los investigadores al descubrimiento de la dinámica del conectoma de consenso de los grafos cerebrales humanos . Los bordes que aparecen en todos los grafos cerebrales forman un subgrafo conectado alrededor del tronco encefálico . Al permitir bordes gradualmente menos frecuentes, este subgrafo central crece continuamente, como un arbusto . La dinámica de crecimiento puede reflejar el desarrollo cerebral individual y brindar una oportunidad para dirigir algunos bordes del grafo cerebral de consenso humano. [6]
Referencias
- ^ Szalkai, Balázs; et al. (2015). "El servidor Connectome de referencia de Budapest v2.0". Cartas de Neurociencia . 595 : 60–2. arXiv : 1412.3151 . doi :10.1016/j.neulet.2015.03.071. PMID 25862487. S2CID 6563189.
- ^ ab Szalkai, Balázs; Kerepesi, Csaba; Varga, Balint; Grolmusz, Vince (2017). "Conectomas de consenso parametrizables del Proyecto Human Connectome: Budapest Reference Connectome Server v3.0". Neurodinámica cognitiva . 11 (1): 113–116. arXiv : 1602.04776 . doi :10.1007/s11571-016-9407-z. PMC 5264751 . PMID 28174617.
- ^ Ingalhalikar, M.; Smith, A.; Parker, D.; Satterthwaite, TD; Elliott, MA; Ruparel, K.; Hakonarson, H.; Gur, RE; Gur, RC; Verma, R. (2013). "Diferencias de sexo en el conectoma estructural del cerebro humano". Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 111 (2): 823–828. Bibcode :2014PNAS..111..823I. doi : 10.1073/pnas.1316909110 . ISSN 0027-8424. PMC 3896179 . PMID 24297904.
- ^ Szalkai, Balázs; Varga, Bálint; Grolmusz, Vince (2015). "El análisis teórico de grafos revela: los cerebros de las mujeres están mejor conectados que los de los hombres". PLOS ONE . 10 (7): e0130045. arXiv : 1501.00727 . Bibcode :2015PLoSO..1030045S. doi : 10.1371/journal.pone.0130045 . ISSN 1932-6203. PMC 4488527 . PMID 26132764.
- ^ Szalkai, Balázs; Varga, Bálint; Grolmusz, Vince (2017). "Los parámetros teóricos de grafos compensados por sesgo de tamaño cerebral también son mejores en los conectomas estructurales de las mujeres". Imágenes cerebrales y comportamiento . 12 (3): 663–673. doi :10.1007/s11682-017-9720-0. PMID 28447246. S2CID 4028467.
- ^ Kerepesi, Csaba; et al. (2016). "Cómo dirigir los bordes de los conectomas: dinámica de los conectomas de consenso y el desarrollo de las conexiones en el cerebro humano". PLOS ONE . 11 (6): e0158680. arXiv : 1509.05703 . Bibcode :2016PLoSO..1158680K. doi : 10.1371/journal.pone.0158680 . PMC 4928947 . PMID 27362431.
