CNOT2

CNOT2
Estructuras disponibles
AP	Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB
Lista de códigos de identificación del PDB
	4C0D, 4C0F, 5FU6, 5FU7
Identificadores
Alias	CNOT2 , CDC36, NOT2, NOT2H, HSPC131, subunidad 2 del complejo de transcripción CCR4-NOT, IDNADFS
Identificaciones externas	OMIM : 604909; MGI : 1919318; HomoloGene : 40953; Tarjetas genéticas : CNOT2; OMA :CNOT2 - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 12 (humano)
Fin	70.354.993 pb
Ubicación del gen ( ratón )
Cristo.	Cromosoma 10 (ratón)
Fin	116.417.416 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	ovocito; ; ovocito secundario; ; tendón de Aquiles; ; pezón; ; epitelio de la nasofaringe; ; pene humano; ; epitelio del colon; ; eminencia ganglionar; ; piel del abdomen; ; corteza cerebelosa;
	Top expresado en
	tubérculo genital; ; cuerpo ciliar; ; arteria carótida interna; ; arteria carótida externa; ; conducto colector medular; ; iris; ; cola del embrión; ; veta primitiva; ; epitelio pigmentario de la retina; ; célula cúmulo;
	Más datos de expresión de referencia
	Más datos de expresión de referencia
Ontología genética
Función molecular	Actividad de ribonucleasa específica de poli(A); Actividad correguladora de la transcripción; unión de proteínas;
Componente celular	citoplasma; membrana; Complejo CCR4-NOT; Cuerpo P; Complejo central CCR4-NOT; núcleo; citosol; membrana plasmática;
Proceso biológico	acortamiento de la cola poli(A) del ARNm transcrito nuclearmente; regulación negativa de la traducción; regulación de la transcripción, plantilla de ADN; Regulación de la transcripción por la ARN polimerasa II; Regulación del mantenimiento de la población de células madre; Regulación negativa de la transcripción por la ARN polimerasa II; transcripción, con plantilla de ADN; desarrollo de organismos multicelulares; Regulación positiva del ensamblaje del cuerpo de procesamiento del ARNm citoplasmático; diferenciación de células trofectodérmicas; silenciamiento genético; Regulación negativa de la vía de señalización del receptor de estrógeno intracelular; regulación de la traducción; Proceso catabólico del ARNm transcrito nuclearmente, desintegración dependiente de la desadenilación; Respuesta al daño del ADN, transducción de señales por el mediador de la clase p53 que da como resultado el arresto del ciclo celular; Hidrólisis del enlace fosfodiéster del ARN, exonucleolítica;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	4848
	72068
	ENSG00000111596
	ENSMUSG00000020166
	Q9NZN8
	Q8C5L3
	NM_001199302 ; NM_001199303 ; NM_014515
NM_001037846 ; NM_001037847 ; NM_001037848 ; NM_028082 ; NM_001359247;
	NM_001359248 ; NM_001359249 ; NM_001359250 ; NM_001359251 ; NM_001359252 ; NM_001359253 ; NM_001359563
	NP_001186231 ; NP_001186232 ; NP_055330
NP_001032935 ; NP_001032936 ; NP_001032937 ; NP_082358 ; NP_001346176;
	NP_001346177 ; NP_001346178 ; NP_001346179 ; NP_001346180 ; NP_001346181 ; NP_001346182 ; NP_001346492
	Wikidatos
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Gen codificador de proteínas en humanos

La subunidad 2 del complejo de transcripción CCR4-NOT es una proteína que en los humanos está codificada por el gen CNOT2 . ^[5]^[6] Es una subunidad del complejo deadenilasa CCR4-Not .

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000111596 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020166 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
^ Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (marzo de 2000). "Aislamiento y caracterización de ortólogos humanos de subunidades del complejo CCR4-NOT de levadura". Nucleic Acids Res . 28 (3): 809–17. doi :10.1093/nar/28.3.809. PMC 102560 . PMID 10637334.
^ "Gen Entrez: complejo de transcripción CNOT2 CCR4-NOT, subunidad 2".

Enlaces externos

Página de ubicación del genoma humano CNOT2 y detalles del gen CNOT2 en el navegador de genoma de la UCSC .

Lectura adicional

Zhang QH, Ye M, Wu XY, et al. (2001). "Clonación y análisis funcional de ADNc con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente indefinidos expresados en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+". Genome Res . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200. PMC 310934 . PMID 11042152.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 ADNc humanos de longitud completa". Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID: 14702039.
Zwartjes CG, Jayne S, van den Berg DL, Timmers HT (2004). "Represión de la actividad promotora por CNOT2, una subunidad del complejo regulador de la transcripción Ccr4-not". J. Biol. Chem . 279 (12): 10848–54. doi : 10.1074/jbc.M311747200 . PMID 14707134.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "El estado, la calidad y la expansión del proyecto de ADNc de longitud completa del NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)". Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928 . PMID 15489334.
Shi J, Nelson MA (2005). "La quinasa dependiente de ciclina 11 interactúa con NOT2". Biochem. Biophys. Res. Commun . 334 (4): 1310–6. doi :10.1016/j.bbrc.2005.07.026. PMID 16039607.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "Hacia un mapa a escala del proteoma de la red de interacción proteína-proteína humana". Nature . 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de promotores alternativos putativos de genes humanos". Genome Res . 16 (1): 55–65. doi :10.1101/gr.4039406. PMC 1356129 . PMID 16344560.
Jayne S, Zwartjes CG, van Schaik FM, Timmers HT (2006). "Participación del complejo SMRT/NCoR-HDAC3 en la represión transcripcional por la subunidad CNOT2 del complejo humano Ccr4-Not". Biochem. J . 398 (3): 461–7. doi :10.1042/BJ20060406. PMC 1559471 . PMID 16712523.

Este artículo sobre un gen del cromosoma 12 humano es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000111596 – Ensembl , mayo de 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000020166 – Ensembl , mayo de 2017

[3] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[4] "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .

[pmid10637334-5] Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (marzo de 2000). "Aislamiento y caracterización de ortólogos humanos de subunidades del complejo CCR4-NOT de levadura". Nucleic Acids Res . 28 (3): 809–17. doi :10.1093/nar/28.3.809. PMC 102560 . PMID 10637334.

[entrez-6] "Gen Entrez: complejo de transcripción CNOT2 CCR4-NOT, subunidad 2".