Cloracidobacteria
| Cloracidobacteria | |
|---|---|
Clasificación científica  | |
| Dominio: | Bacteria |
| Filo: | Acidobacterias |
| Clase: | "Acidobacterias" |
| Orden: | Acidobacterias |
| Familia: | Acidobacterias |
| Género: | “Chloracidobacterium” Tank y Bryant 2015 [1] |
| Especie tipo | |
| "Clorácidobacterium thermophilum" Tanque y Bryant 2015 | |
| Especies [2] | |
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| Sinónimos | |
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Chloracidobacterium es un género de la familia Acidobacteriota . [4] Actualmente está asignado a la familia Acidobacteriaceae , pero la evidencia filogenética sugiere que pertenece a Blastocatellia . [5]
Se trata de un grupo de bacterias fotosintéticas que se descubrieron en 2007 y su identificación amplía el número de filos bacterianos que pueden llevar a cabo la fotosíntesis basada en clorofila de cinco a seis. [3] [6]
"CandidatoCloracidobacterium thermophilum"
El organismo " Candidatus Chloracidobacterium thermophilum" se detectó inicialmente a través de los análisis bioinformáticos de los datos de secuencia metagenómica de los tapetes microbianos recolectados de una fuente termal en el Parque Nacional de Yellowstone. [7] Posteriormente se aisló después de la inhibición de las especies de Synechococcus en las muestras de tapetes microbianos, lo que llevó a un cocultivo de C. thermophilum , especies de Anoxybacillus y especies de Meiothermus . C. thermophilum se sembró en un medio de cultivo Midnight Medium (CTM) para cultivarlo para un aislamiento puro. La secuenciación genómica de la bacteria reveló que no contenía genes para las enzimas que reducen el sulfato, pero dependía de una fuente de azufre reducida. Los investigadores probablemente especularon que compartía una relación mutualista con los cocultivos de especies de Meiothermus y especies de Anoxybacillus para el acceso a fuentes de azufre reducidas. Además, se determinó que la bacteria era aerófila, moderadamente termófila, anoxigénica y fotoheterotrófica. Finalmente, descubrieron que depende de una fuente reducida de azufre, bicarbonato, L-lisina y vitamina B 12 para el aislamiento previo al cultivo. [7]
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) [2] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) [8].
| LTP basado en ARNr 16S _01_2022 [9] [10] [11] y Dedysh & Yilmaz 2018 [12] | 120 proteínas marcadoras basadas en GTDB 07-RS207 [13] [14] [15] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Véase también
Referencias
- ^ Tank M, Bryant DA. (2015). "Chloracidobacterium thermophilum gen. nov., sp. nov.: Una acidobacteria clorofotoheterotrófica microaerófila anoxigénica". Int J Syst Evol Microbiol . 65 : 1426–1430. doi : 10.1099/ijs.0.000113 . PMID 25667398.
- ^ ab AC Parte; et al. "Chloracidobacterium". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 9 de septiembre de 2022 .
- ^ ab Bryant DA, Costas AM, Maresca JA, Chew AG, Klatt CG, Bateson MM, et al. (julio de 2007). "" Candidatus Chloracidobacterium thermophilum": una acidobacterium fototrófica aeróbica ". Science . 317 (5837): 523–6. Bibcode :2007Sci...317..523B. doi :10.1126/science.1143236. PMID 17656724. S2CID 20419870.
- ^ Véase la página web del NCBI sobre Chloracidobacterium. Datos extraídos de los "Recursos de taxonomía del NCBI". Centro Nacional de Información Biotecnológica . Consultado el 19 de marzo de 2007 .
- ^ Dedysh SN, Yilmaz P. (2018). "Refinamiento de la estructura taxonómica del filo Acidobacteria". Int J Syst Evol Microbiol . 68 : 3796–3806. doi : 10.1099/ijsem.0.003062 . PMID 30325293.
- ^ Raymond J (febrero de 2008). "Coloreando el árbol de la vida". Tendencias en microbiología . 16 (2): 41–3. doi :10.1016/j.tim.2007.11.003. PMID 18182293.
- ^ ab Tank M, Bryant DA (27 de marzo de 2015). "Requerimientos nutricionales y fisiología del crecimiento de la bacteria fotoheterotrófica Acidobacterium, Chloracidobacterium thermophilum". Frontiers in Microbiology . 6 : 226. doi : 10.3389/fmicb.2015.00226 . PMC 4376005 . PMID 25870589.
- ^ Sayers; et al. "Chloracidobacterium". Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 9 de septiembre de 2022 .
- ^ "El LTP" . Consultado el 23 de febrero de 2022 .
- ^ "Árbol LTP_all en formato newick". Archivado desde el original el 4 de septiembre de 2022 . Consultado el 23 de febrero de 2022 .
- ^ "Notas de la versión LTP_01_2022" (PDF) . Consultado el 23 de febrero de 2022 .
- ^ Dedysh SN, Yilmaz P (2018). "Refinamiento de la estructura taxonómica del filo Acidobacteria". Int J Syst Evol Microbiol . 68 : 3796–3806. doi : 10.1099/ijsem.0.003062 . PMID 30325293.
- ^ "GTDB release 07-RS207". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .
- ^ "bac120_r207.sp_labels". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .
- ^ "Historia del taxón". Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 20 de junio de 2022 .
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