La proteína 4 de unión al ADN de la helicasa del cromodominio es una enzima que en los seres humanos está codificada por el gen CHD4 . [5] [6] [7] CHD4 es el componente central de remodelación de nucleosomas del complejo de remodelación de nucleosomas y desacetilasa ( NuRD ). [8] [9] [10]
Función
El producto de este gen pertenece a la familia de helicasas SNF2/RAD54. Representa el componente principal del complejo de remodelación de nucleosomas y desacetilasa y desempeña un papel importante en la represión transcripcional epigenética. Los pacientes con dermatomiositis desarrollan anticuerpos contra esta proteína. [7]
^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000111642 – Ensembl , mayo de 2017
^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000063870 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Referencia de PubMed sobre ratón". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Seelig HP, Moosbrugger I, Ehrfeld H, Fink T, Renz M, Genth E (octubre de 1995). "El principal autoantígeno Mi-2 específico de la dermatomiositis es una presunta helicasa implicada en la activación transcripcional". Arthritis and Rheumatism . 38 (10): 1389–1399. doi :10.1002/art.1780381006. PMID 7575689.
^ Seelig HP, Renz M, Targoff IN, Ge Q, Frank MB (octubre de 1996). "Dos formas de la proteína antigénica principal del autoantígeno Mi-2 específico de la dermatomiositis". Arthritis and Rheumatism . 39 (10): 1769–1771. doi :10.1002/art.1780391029. PMID 8843877.
^ ab "Entrez Gene: proteína de unión al ADN de la helicasa del cromodominio CHD4 4".
^ Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (octubre de 1998). "Desacetilación de la cromatina por un complejo de remodelación de nucleosomas dependiente de ATP". Nature . 395 (6705): 917–921. Bibcode :1998Natur.395..917T. doi :10.1038/27699. PMID 9804427. S2CID 4355885.
^ Xue Y, Wong J, Moreno GT, Young MK, Côté J, Wang W (diciembre de 1998). "NURD, un nuevo complejo con actividades de remodelación de cromatina dependientes de ATP y desacetilasa de histonas". Molecular Cell . 2 (6): 851–861. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80299-3 . PMID 9885572.
^ Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (octubre de 1998). "El autoantígeno específico de la dermatomiositis Mi2 es un componente de un complejo que contiene histona desacetilasa y actividades de remodelación de nucleosomas". Cell . 95 (2): 279–289. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . PMID 9790534.
^ ab Yao YL, Yang WM (octubre de 2003). "Las proteínas 1 y 2 asociadas a la metástasis forman complejos proteicos distintos con actividad de la histona desacetilasa". The Journal of Biological Chemistry . 278 (43): 42560–42568. doi : 10.1074/jbc.M302955200 . PMID 12920132.
^ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL (abril de 1999). "Tres proteínas definen una clase de histonas desacetilasas humanas relacionadas con la levadura Hda1p". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 96 (9): 4868–4873. Bibcode :1999PNAS...96.4868G. doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . PMC 21783 . PMID 10220385.
^ ab Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (octubre de 1998). "Desacetilación de la cromatina por un complejo de remodelación de nucleosomas dependiente de ATP". Nature . 395 (6705): 917–921. Bibcode :1998Natur.395..917T. doi :10.1038/27699. PMID 9804427. S2CID 4355885.
^ Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (febrero de 2003). "Un gen candidato para el retraso mental ligado al cromosoma X es un componente de una nueva familia de complejos que contienen histona desacetilasa". The Journal of Biological Chemistry . 278 (9): 7234–7239. doi : 10.1074/jbc.M208992200 . PMID 12493763.
^ ab Schmidt DR, Schreiber SL (noviembre de 1999). "Asociación molecular entre ATR y dos componentes del complejo de remodelación y desacetilación de nucleosomas, HDAC2 y CHD4". Bioquímica . 38 (44): 14711–14717. CiteSeerX 10.1.1.559.7745 . doi :10.1021/bi991614n. PMID 10545197.
^ Yasui D, Miyano M, Cai S, Varga-Weisz P, Kohwi-Shigematsu T (octubre de 2002). "SATB1 se dirige a la remodelación de la cromatina para regular genes a largas distancias". Nature . 419 (6907): 641–645. Bibcode :2002Natur.419..641Y. doi :10.1038/nature01084. PMID 12374985. S2CID 25822700.
^ Weiss K, Lazar HP, Kurolap A, Martinez AF, Paperna T, Cohen L, Smeland MF, Wallen S, Solveig H, Keren B, Terhal P, Irving M, Takaku M, Roberts JD, Petrovich RM, Schrier Vergano SA11, 12, Kenney A11, Hove H13, DeChene E, Quinonez SC, Colin E, Ziegler A, Rumple M, Jain M, Monteil D, Roeder ER, Nugent K, van Haeringen A, Gambello M, Santani A, Medne L, Krock B, Skraban CM, Zackai EH, Dubbs HA, Smol T, Ghoumid J, Parker M, Wright M, Turnpenny P, Clayton -Smith J, Metcalfe K, Kurumizaka H, Gelb BD, Baris Feldman H, Campeau PM34, Muenke M5, Wade PA, Lachlan K. (2019) El síndrome relacionado con CHD4: una investigación exhaustiva del espectro clínico, las correlaciones genotipo-fenotipo y la base molecular. Genet Med
Denslow SA, Wade PA (agosto de 2007). "El complejo humano Mi-2/NuRD y la regulación génica". Oncogene . 26 (37): 5433–5438. doi :10.1038/sj.onc.1210611. PMID 17694084. S2CID 26445975.
Ge Q, Nilasena DS, O'Brien CA, Frank MB, Targoff IN (octubre de 1995). "Análisis molecular de una región antigénica principal de la proteína de 240 kD del autoantígeno Mi-2". The Journal of Clinical Investigation . 96 (4): 1730–1737. doi :10.1172/JCI118218. PMC 185809 . PMID 7560064.
Woodage T, Basrai MA, Baxevanis AD, Hieter P, Collins FS (octubre de 1997). "Caracterización de la familia de proteínas CHD". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 94 (21): 11472–11477. Bibcode :1997PNAS...9411472W. doi : 10.1073/pnas.94.21.11472 . PMC 23509 . PMID 9326634.
Zhang Y, LeRoy G, Seelig HP, Lane WS, Reinberg D (octubre de 1998). "El autoantígeno específico de la dermatomiositis Mi2 es un componente de un complejo que contiene histona desacetilasa y actividades de remodelación de nucleosomas". Cell . 95 (2): 279–289. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . PMID 9790534. S2CID 18786866.
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL (octubre de 1998). "Desacetilación de la cromatina por un complejo de remodelación de nucleosomas dependiente de ATP". Nature . 395 (6705): 917–921. Bibcode :1998Natur.395..917T. doi :10.1038/27699. PMID 9804427. S2CID 4355885.
Zhang Y, Ng HH, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Bird A, Reinberg D (agosto de 1999). "El análisis de las subunidades de NuRD revela un complejo central de histona desacetilasa y una conexión con la metilación del ADN". Genes & Development . 13 (15): 1924–1935. doi :10.1101/gad.13.15.1924. PMC 316920 . PMID 10444591.
Schmidt DR, Schreiber SL (noviembre de 1999). "Asociación molecular entre ATR y dos componentes del complejo de remodelación y desacetilación de nucleosomas, HDAC2 y CHD4". Biochemistry . 38 (44): 14711–14717. CiteSeerX 10.1.1.559.7745 . doi :10.1021/bi991614n. PMID 10545197.
Humphrey GW, Wang Y, Russanova VR, Hirai T, Qin J, Nakatani Y, Howard BH (marzo de 2001). "Complejos de histona desacetilasa estables distinguidos por la presencia de las proteínas del dominio SANT CoREST/kiaa0071 y Mta-L1". The Journal of Biological Chemistry . 276 (9): 6817–6824. doi : 10.1074/jbc.M007372200 . PMID 11102443.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, et al. (enero de 2002). "Análisis proteómico dirigido del nucléolo humano". Current Biology . 12 (1): 1–11. Bibcode :2002CBio...12....1A. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298. S2CID 14132033.
Koipally J, Georgopoulos K (agosto de 2002). "Una disección molecular del circuito de represión de Ikaros". The Journal of Biological Chemistry . 277 (31): 27697–27705. doi : 10.1074/jbc.M201694200 . PMID 12015313.
Saito M, Ishikawa F (septiembre de 2002). "El dominio de unión a mCpG del MBD3 humano no se une a mCpG pero interactúa con los componentes NuRD/Mi2 HDAC1 y MTA2". The Journal of Biological Chemistry . 277 (38): 35434–35439. doi : 10.1074/jbc.M203455200 . PMID 12124384.
Hakimi MA, Dong Y, Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R (febrero de 2003). "Un gen candidato para el retraso mental ligado al cromosoma X es un componente de una nueva familia de complejos que contienen histona desacetilasa". The Journal of Biological Chemistry . 278 (9): 7234–7239. doi : 10.1074/jbc.M208992200 . PMID 12493763.
Kwan AH, Gell DA, Verger A, Crossley M, Matthews JM, Mackay JP (julio de 2003). "Ingeniería de un andamiaje proteico a partir de un dedo de doctorado". Structure . 11 (7): 803–813. doi : 10.1016/S0969-2126(03)00122-9 . PMID 12842043.
Shimono Y, Murakami H, Kawai K, Wade PA, Shimokata K, Takahashi M (diciembre de 2003). "Mi-2 beta se asocia con la proteína de dedo BRG1 y RET en las distintas regiones con capacidades de activación y represión transcripcional". The Journal of Biological Chemistry . 278 (51): 51638–51645. doi : 10.1074/jbc.M309198200 . PMID 14530259.
Williams CJ, Naito T, Arco PG, Seavitt JR, Cashman SM, De Souza B, et al. (junio de 2004). "El remodelador de cromatina Mi-2beta es necesario para la expresión de CD4 y el desarrollo de células T". Inmunidad . 20 (6): 719–733. doi : 10.1016/j.immuni.2004.05.005 . PMID 15189737.
Lehner B, Sanderson CM (julio de 2004). "Un marco de interacción de proteínas para la degradación del ARNm humano". Genome Research . 14 (7): 1315–1323. doi :10.1101/gr.2122004. PMC 442147 . PMID 15231747.
Este artículo sobre un gen del cromosoma 12 humano es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo.