Acetil-CoA carboxilasa

acetil-CoA carboxilasa
Homodímero ACC1 humano con dominios catalíticos resaltados: carboxilasa de biotina (rojo), unión a biotinilo (azul) y carboxiltransferasa (verde). PDB : 6G2D
Identificadores
N.º CE	6.4.1.2
N.º CAS	9023-93-2
Bases de datos
IntEnz	Vista de IntEnz
BRENDA	Entrada de BRENDA
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MetaCiclo	vía metabólica
PRIAMO	perfil
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Ontología genética	AmiGO / QuickGO
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La acetil-CoA carboxilasa ( ACC ) es una enzima dependiente de biotina ( EC 6.4.1.2) que cataliza la carboxilación irreversible de acetil-CoA para producir malonil-CoA a través de sus dos actividades catalíticas, biotina carboxilasa (BC) y carboxiltransferasa (CT). La ACC es una enzima de múltiples subunidades en la mayoría de los procariotas y en los cloroplastos de la mayoría de las plantas y algas, mientras que es una enzima grande y de múltiples dominios en el citoplasma de la mayoría de los eucariotas . La función más importante de la ACC es proporcionar el sustrato de malonil-CoA para la biosíntesis de ácidos grasos . ^[1] La actividad de la ACC puede controlarse a nivel transcripcional, así como mediante moduladores de moléculas pequeñas y modificación covalente . El genoma humano contiene los genes de dos ACC diferentes ^[2] : ACACA ^[3] y ACACB . ^[4]

Los procariotas y las plantas tienen ACC de múltiples subunidades compuestas de varios polipéptidos. La actividad de la biotina carboxilasa (BC), la proteína transportadora de carboxilo de biotina (BCCP) y la actividad de la carboxiltransferasa (CT) están contenidas cada una en una subunidad diferente. La estequiometría de estas subunidades en la holoenzima ACC difiere entre organismos. ^[1] Los humanos y la mayoría de los eucariotas han desarrollado un ACC con dominios catalíticos CT y BC y dominios BCCP en un solo polipéptido. La mayoría de las plantas también tienen esta forma homomérica en el citosol. ^[5] Las regiones funcionales del ACC, comenzando desde el extremo N hasta el extremo C, son la biotina carboxilasa (BC), la unión a la biotina (BB), la carboxiltransferasa (CT) y la unión a ATP (AB). AB se encuentra dentro de BC. La biotina está unida covalentemente a través de un enlace amida a la cadena lateral larga de una lisina que reside en BB. Como BB se encuentra entre las regiones BC y CT, la biotina puede translocarse fácilmente a ambos sitios activos donde se requiere.

En los mamíferos donde se expresan dos isoformas de ACC, la principal diferencia estructural entre estas isoformas es el extremo N extendido de ACC2 que contiene una secuencia de orientación mitocondrial . ^[1]

Los polipéptidos que componen las subunidades múltiples de ACC de procariotas y plantas están codificados por genes distintos. En Escherichia coli , accA codifica la subunidad alfa de la acetil-CoA carboxilasa, ^[6] y accD codifica su subunidad beta. ^[7]

La reacción general de ACAC(A,B) se lleva a cabo mediante un mecanismo de dos pasos. ^[8] La primera reacción es llevada a cabo por BC e implica la carboxilación dependiente de ATP de la biotina con bicarbonato como fuente de CO ₂ . El grupo carboxilo se transfiere de la biotina al acetil-CoA para formar malonil-CoA en la segunda reacción, que es catalizada por CT.

En el sitio activo , la reacción procede con una amplia interacción de los residuos Glu296 y Arg338 y Arg292 cargados positivamente con los sustratos. ^[9] Dos Mg2 ⁺ están coordinados por los grupos fosfato en el ATP y son necesarios para la unión del ATP a la enzima. El bicarbonato es desprotonado por Glu296, aunque en solución, esta transferencia de protones es poco probable ya que el pKa del bicarbonato es 10,3. La enzima aparentemente manipula el pKa para facilitar la desprotonación del bicarbonato. El pKa del bicarbonato disminuye por su interacción con las cadenas laterales cargadas positivamente de Arg338 y Arg292. Además, Glu296 interactúa con la cadena lateral de Glu211, una interacción que se ha demostrado que causa un aumento en el pKa aparente. Después de la desprotonación del bicarbonato, el oxígeno del bicarbonato actúa como un nucleófilo y ataca al fosfato gamma en el ATP. El intermedio carboxifosfato se descompone rápidamente en CO2 _y PO43− _. El PO43− _desprotona la biotina, creando un enolato, estabilizado por Arg338, que posteriormente ataca al CO2 ^dando _como ^resultado la producción de carboxibiotina. ^[9] La carboxibiotina se transloca al sitio activo de la carboxil transferasa (CT), donde el grupo carboxilo se transfiere a acetil-CoA. A diferencia del dominio BC, se sabe poco sobre el mecanismo de reacción de la CT. Un mecanismo propuesto es la liberación de CO2 _de la biotina, que posteriormente abstrae un protón del grupo metilo de la acetil-CoA carboxilasa. El enolato resultante ataca al CO2 _para formar malonil-CoA. En un mecanismo competitivo, la abstracción de protones está concertada con el ataque de acetil-CoA.

La función de la ACC es regular el metabolismo de los ácidos grasos. Cuando la enzima está activa, se produce el producto, malonil-CoA, que es un componente básico para nuevos ácidos grasos y puede inhibir la transferencia del grupo acilo graso del acil-CoA a la carnitina con la carnitina aciltransferasa , que inhibe la betaoxidación de los ácidos grasos en las mitocondrias .

En los mamíferos , se expresan dos isoformas principales de ACC, ACC1 y ACC2, que difieren tanto en la distribución tisular como en la función. ACC1 se encuentra en el citoplasma de todas las células, pero se enriquece en el tejido lipogénico, como el tejido adiposo y las glándulas mamarias lactantes , donde la síntesis de ácidos grasos es importante. ^[10] En los tejidos oxidativos, como el músculo esquelético y el corazón , la proporción de ACC2 expresada es mayor. ACC1 y ACC2 se expresan en gran medida en el hígado , donde tanto la oxidación como la síntesis de ácidos grasos son importantes. ^[11] Las diferencias en la distribución tisular indican que ACC1 mantiene la regulación de la síntesis de ácidos grasos , mientras que ACC2 regula principalmente la oxidación de ácidos grasos (oxidación beta).

Una isoforma mitocondrial de ACC1 (mACC1) desempeña un papel parcialmente redundante en la síntesis de ácido lipoico y, por lo tanto, en la lipoilación de proteínas al proporcionar malonil-CoA para la síntesis de ácidos grasos mitocondriales (mtFASII) junto con ACSF3 . ^{[12] [13]}

La regulación del ACC de los mamíferos es compleja, ya que permite controlar dos grupos distintos de malonil-CoA que dirigen la inhibición de la beta oxidación o la activación de la biosíntesis de lípidos. ^[14]

La ACC1 y la ACC2 de los mamíferos están reguladas transcripcionalmente por múltiples promotores que median la abundancia de ACC en respuesta al estado nutricional de las células. La activación de la expresión génica a través de diferentes promotores da como resultado un empalme alternativo ; sin embargo, la importancia fisiológica de isoenzimas ACC específicas sigue sin estar clara. ^[11] La sensibilidad al estado nutricional resulta del control de estos promotores por factores de transcripción como la proteína 1 de unión al elemento regulador de esteroles , controlada por la insulina a nivel transcripcional, y ChREBP , cuya expresión aumenta con dietas ricas en carbohidratos . ^{[15] [16]}

A través de un ciclo de retroalimentación, el citrato activa alostéricamente la ACC. ^[17] El citrato puede aumentar la polimerización de la ACC para aumentar la actividad enzimática; sin embargo, no está claro si la polimerización es el mecanismo principal del citrato para aumentar la actividad de la ACC o si la polimerización es un artefacto de experimentos in vitro. Otros activadores alostéricos incluyen el glutamato y otros ácidos dicarboxílicos . ^[18] Los acil-CoA grasos de cadena larga y corta son inhibidores de retroalimentación negativa de la ACC. ^[19] Uno de estos moduladores alostéricos negativos es el palmitoil-CoA. ^[20]

La fosforilación puede resultar cuando las hormonas glucagón ^[21] o epinefrina ^[22] se unen a los receptores de la superficie celular , pero la principal causa de la fosforilación se debe a un aumento en los niveles de AMP cuando el estado energético de la célula es bajo, lo que lleva a la activación de la proteína quinasa activada por AMP (AMPK). AMPK es el principal regulador quinasa de ACC, capaz de fosforilar una serie de residuos de serina en ambas isoformas de ACC. ^[23] En ACC1, AMPK fosforila Ser79, Ser1200 y Ser1215. La proteína quinasa A también tiene la capacidad de fosforilar ACC, con una capacidad mucho mayor para fosforilar ACC2 que ACC1. Ser80 y Ser1263 en ACC1 también pueden servir como un sitio de fosforilación como mecanismo regulador. ^[24] Sin embargo, actualmente se desconoce la importancia fisiológica de la proteína quinasa A en la regulación de ACC. Los investigadores plantean la hipótesis de que existen otras quinasas ACC importantes para su regulación, ya que hay muchos otros posibles sitios de fosforilación en ACC. ^[25]

Cuando la insulina se une a sus receptores en la membrana celular , activa una enzima fosfatasa llamada proteína fosfatasa 2A (PP2A) para desfosforilar la enzima, eliminando así el efecto inhibidor. Además, la insulina induce una fosfodiesterasa que reduce el nivel de AMPc en la célula, inhibiendo así la PKA, y también inhibe directamente la AMPK. ^{[ cita requerida ]}

Esta proteína puede utilizar el modelo de morfeína de regulación alostérica . ^[26]

En la unión de las vías de síntesis y oxidación de lípidos, el ACC presenta muchas posibilidades clínicas para la producción de nuevos antibióticos y el desarrollo de nuevas terapias para la diabetes , la obesidad y otras manifestaciones del síndrome metabólico . ^[27] Los investigadores apuntan a aprovechar las diferencias estructurales entre los ACC bacterianos y humanos para crear antibióticos específicos para el ACC bacteriano, en un esfuerzo por minimizar los efectos secundarios para los pacientes. Los resultados prometedores para la utilidad de un inhibidor de ACC incluyen el hallazgo de que los ratones sin expresión de ACC2 tienen una oxidación continua de ácidos grasos, una masa grasa corporal reducida y un peso corporal reducido a pesar de un aumento en el consumo de alimentos. Estos ratones también están protegidos de la diabetes. ^[14] La falta de ACC1 en ratones mutantes es letal ya en la etapa embrionaria. Sin embargo, se desconoce si los medicamentos dirigidos a los ACC en humanos deben ser específicos para ACC2. ^[28]

El firsocostat (anteriormente GS-976, ND-630, NDI-010976) es un potente inhibidor alostérico de la ACC que actúa en el dominio BC de la ACC. ^[29] El firsocostat está en desarrollo en 2019 (fase II) ^[30] por la compañía farmacéutica Gilead como parte de un tratamiento combinado para la esteatohepatitis no alcohólica (NASH), que se cree que es una causa creciente de insuficiencia hepática. ^[31]

Además, los inhibidores de ACC selectivos de plantas se utilizan ampliamente como herbicidas , ^[32] lo que sugiere una aplicación clínica contra los parásitos Apicomplexa que dependen de una isoforma de ACC derivada de plantas, ^[33] incluida la malaria .

Se cree que los fenotipos clínicos heterogéneos de la enfermedad metabólica aciduria combinada malónica y metilmalónica (CMAMMA) debida a la deficiencia de ACSF3 son resultado de la compensación parcial de una isoforma mitocondrial de ACC1 (mACC1) por ACSF3 deficiente en la síntesis de ácidos grasos mitocondriales (mtFASII). ^[34]

• Herbicidas inhibidores de la ACCasa
• Malonil-CoA descarboxilasa