Código internacional de nomenclatura de procariotas

Código de nomenclatura

El Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas ( CIPE ) o Código Procariota , anteriormente Código Internacional de Nomenclatura de Bacterias ( CINB ) o Código Bacteriológico ( BC ), rige los nombres científicos de Bacterias y Archaea . [1] [2] Denota las reglas para nombrar taxones de bacterias, según su rango relativo. Como tal, es uno de los códigos de nomenclatura de la biología .

Originalmente, el Código Internacional de Nomenclatura Botánica se ocupaba de las bacterias, y mantuvo las referencias a las bacterias hasta que fueron eliminadas en el Congreso Botánico Internacional de 1975. Un primer Código para la nomenclatura de bacterias fue aprobado en el 4º Congreso Internacional de Microbiología en 1947, pero luego fue descartado.

La última versión impresa en forma de libro es la Revisión de 1990, [3] pero el libro no representa las reglas actuales. Las Revisiones de 2008 y 2022 se han publicado en la Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva (IJSEM). [2] Las reglas son mantenidas por el Comité Internacional de Sistemática de Procariotas (ICSP; anteriormente Comité Internacional de Bacteriología Sistemática, ICSB).

La base de referencia para los nombres bacterianos son las Listas Aprobadas [4] con un punto de partida de 1980. La ICSP revisa los nombres bacterianos nuevos para comprobar que cumplen con las Reglas de Nomenclatura y los publica en el IJSEM .

Cianobacterias

Desde 1975, la mayoría de las bacterias estaban incluidas en el código bacteriológico. Sin embargo, las cianobacterias seguían estando incluidas en el código botánico. A partir de 1999, las cianobacterias pasaron a estar incluidas tanto en el código botánico como en el bacteriológico. Esta situación ha provocado problemas de nomenclatura para las cianobacterias. [5] [6] En 2020, había tres propuestas para resolver la situación:

  1. Excluir las cianobacterias del código bacteriológico. [7]
  2. Aplicar el código bacteriológico a todas las cianobacterias. [8]
  3. Considere una publicación válida según el código botánico como una publicación válida según el código bacteriológico. [9]

En 2021, el ICSP realizó una votación formal sobre las tres propuestas y se eligió la tercera opción. [10]

Tipo de cepa

Desde 2001, cuando se describe una nueva especie bacteriana o arqueal, se debe designar una cepa tipo. [11] La cepa tipo es un cultivo vivo al que se adjunta formalmente el nombre científico de ese organismo. Para que el nombre de una nueva especie se publique de forma válida, la cepa tipo debe estar depositada en una colección de cultivos públicos en al menos dos países diferentes. [12] Antes de 2001, una especie también podía tipificarse utilizando una descripción, un espécimen preservado o una ilustración. [11] Existe una única cepa tipo para cada especie procariota, pero diferentes colecciones de cultivos pueden designar un nombre único para la misma cepa. Por ejemplo, la cepa tipo de E. coli (originalmente cepa U5/41) se denomina ATCC 11775 por la American Type Culture Collection , DSM 30083 por la German Collection of Microorganisms and Cell Cultures , JCM 1649 por la Japan Collection of Microorganisms y LMG 2092 por la Belgian Coordinated Collections of Microorganisms . [13] [14] Cuando una especie procariota no se puede cultivar en el laboratorio (y por lo tanto no se puede depositar en una colección de cultivos), se le puede dar un nombre de candidato provisional , pero no se considera válidamente publicada. [15]

Versiones

  • Buchanan, RE y Ralph St. John-Brooks. (1947, junio) (Editores). Código de nomenclatura bacteriológica propuesto . Desarrollado a partir de propuestas aprobadas por el Comité Internacional de Nomenclatura Bacteriológica en la Reunión del Tercer Congreso Internacional de Microbiología. Publicación autorizada en Sesión Plenaria, págs. 61. Iowa State College Press, Ames, Iowa. EE.UU. Hathi Trust.
  • Buchanan RE, St, John-Brooks R., Breed RS (1948). "Código bacteriológico internacional de nomenclatura". Revista de bacteriología . 55 (3): 287–306. doi : 10.1128/jb.55.3.287-306.1948 . PMC  518444 . PMID  16561459.{{cite journal}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )Reimpreso en 1949, Journal of General Microbiology 3, 444–462.
  • Comité Internacional de Nomenclatura Bacteriológica. (1958, junio). Código internacional de nomenclatura de bacterias y virus . Ames, Iowa State College Press. BHL.
  • Lapage, SP, Sneath, PHA, Lessel, EF, Skerman, VBD, Seeliger, HPR y Clark, WA (1975). Código internacional de nomenclatura de bacterias . Revisión de 1975. Sociedad Estadounidense de Microbiología, Washington, DC
  • Lapage, SP, Sneath, PHA, Lessel, EF, Skerman, VBD, Seeliger, HPR y Clark, WA (1992). Código internacional de nomenclatura de bacterias . Código bacteriológico. Revisión de 1990. Sociedad Estadounidense de Microbiología, Washington, DC.
  • Parker, CT, Tindall, BJ y Garrity, GM, eds. (2019). Código internacional de nomenclatura de procariotas. Código procariota (revisión de 2008). Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva 69(1A): S1–S111. doi: 10.1099/ijsem.0.000778
  • Oren, Aharon; Arahal, David R.; Göker, Markus; Moore, Edward RB; Rossello-Mora, Ramon; Sutcliffe, Iain C. (1 de mayo de 2023). "Código internacional de nomenclatura de procariotas. Código procariota (revisión de 2022)". Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva . 73 (5a). doi : 10.1099/ijsem.0.005585 . hdl : 10261/338243 . PMID  37219928.

Véase también

Referencias

  1. ^ "Inicio". the-icsp.org .
  2. ^ ab PHA Sneath, 2003. Una breve historia del Código Bacteriológico URL Archivado el 24 de mayo de 2012 en Wayback Machine
  3. ^ Lapage, SP; Sneath, PHA; Lessel, EF; Skerman, VBD; Seeliger, HPR; Clark, WA (5 de marzo de 1992). Reglas de Nomenclatura con Recomendaciones. Prensa ASM - a través de ncbi.nlm.nih.gov.
  4. ^ VBD Skerman, Vicki McGowan y PHA Sneath, 1989. Listas aprobadas de nombres bacterianos, edición modificada Washington (DC): ASM Press
  5. ^ Oren, A. (2011). "Sistemática y nomenclatura de cianobacterias tal como aparece en el Boletín Internacional de Nomenclatura y Taxonomía Bacteriológica / Revista Internacional de Bacteriología Sistemática / Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 61 (1): 10–15. doi : 10.1099/ijs.0.018838-0 . PMID  21097637. S2CID  206169872.
  6. ^ Oren A, Ventura S. (2017). "El estado actual de la nomenclatura de las cianobacterias bajo el código "procariota" y el "botánico"". Antonie van Leeuwenhoek . 110 (10): 1257–1269. doi :10.1007/s10482-017-0848-0. PMID  28243951. S2CID  23489558.
  7. ^ Oren A, Garrity GM. (2014). "Propuesta para cambiar la Consideración general 5 y el Principio 2 del Código internacional de nomenclatura de procariotas". Int J Syst Evol Microbiol . 64 (1): 309–10. doi :10.1099/ijs.0.059568-0. PMID  24408952.
  8. ^ Pinevich AV. (2015). "Propuesta para aplicar de manera consistente el Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas (CIPN) a los nombres de las bacterias fotosintéticas oxigénicas (cianobacterias), incluidas aquellas publicadas válidamente bajo el Código Internacional de Nomenclatura Botánica (CIBN)/Código Internacional de Nomenclatura para algas, hongos y plantas (CIE), y propuesta para cambiar el Principio 2 del CIPN". Int J Syst Evol Microbiol . 65 (3): 1070–4. doi : 10.1099/ijs.0.000034 . PMID  25505344.
  9. ^ Oren A. (2020). "Tres propuestas alternativas para modificar las reglas del Código internacional de nomenclatura de procariotas para resolver el estatus de las cianobacterias en la nomenclatura procariota". Int J Syst Evol Microbiol . 70 (7): 4406–4408. doi : 10.1099/ijsem.0.004268 . PMID  32602831. S2CID  220270571.
  10. ^ Oren A, Arahal DR, Rosselló-Móra R, Sutcliffe IC, Moore ERB. (2021). "Enmienda de la Consideración General 5 y las Reglas 18a, 24a y 30 del Código Internacional de Nomenclatura de Procariotas para resolver el estatus de las Cianobacterias en la nomenclatura procariota". Revista Internacional de Microbiología Sistemática y Evolutiva . 71 (8): 004939. doi : 10.1099/ijsem.0.004939 . PMID  34342563. S2CID  236884663.
  11. ^ ab Código Procariota (Revisión de 2008), Regla 18a.
  12. ^ Código Procariota (Revisión de 2008), Regla 30.
  13. ^ Euzéby JP, Parte AC. "Escherichia coli". Lista de nombres procariotas con posición en la nomenclatura (LPSN) . Consultado el 21 de junio de 2022 .
  14. ^ Reimer LC, Sardà Carbasse J, Koblitz J, Ebeling C, Podstawka A, Overmann J. "Escherichia coli U5/41". BacDive . Consultado el 21 de junio de 2022 .
  15. ^ Código Procariota (Revisión de 2008), Apéndice 11.
  • Revista internacional de microbiología sistemática y evolutiva en línea
  • Tindall BJ (julio de 1999). "Malentendido del código bacteriológico". Int. J. Syst. Bacteriol . 49 (3): 1313–6. doi : 10.1099/00207713-49-3-1313 . PMID  10425796.
  • Lista de nombres de procariotas con su posición en la nomenclatura
  • Búsqueda de nomenclatura procariota proporcionada por NamesforLife
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