Explosión2GO
 Explosión2GO | |
| Tipo | Software de bioinformática |
|---|---|
| Comienzo | 2011 ( 2011 ) |
| Fabricante | Bioinformática BioBam |
| Modelos realizados | Demo, Básico, Prueba, Pro, Plugin, Línea de comandos |
| Sitio web | https://www.blast2go.com |
Blast2GO , publicado por primera vez en 2005, [1] [2] [3] [4] es una herramienta de software bioinformático para la anotación funcional automática y de alto rendimiento de datos de secuencias novedosas ( genes, proteínas ). Utiliza el algoritmo BLAST [5] para identificar secuencias similares y luego transferir la anotación funcional existente de secuencias aún caracterizadas a la nueva. La información funcional se representa a través de la ontología genética (GO), un vocabulario controlado de atributos funcionales. [ cita requerida ] La ontología genética , o GO , es una importante iniciativa bioinformática para unificar la representación de los atributos de genes y productos genéticos en todas las especies . [6]
Véase también
Referencias
- ^ Conesa, A; Götz, S; García-Gómez, JM; Terol, J; Talón, M; Robles, M (15 de septiembre de 2005). "Blast2GO: una herramienta universal para la anotación, visualización y análisis en la investigación genómica funcional". Bioinformática . 21 (18): 3674–6. doi : 10.1093/bioinformatics/bti610 . PMID 16081474.
- ^ Götz, S; García-Gómez, JM; Terol, J; Williams, TD; Nagaraj, SH; Nueda, MJ; Robles, M; Talón, M; Dopazo, J; Conesa, A (junio de 2008). "Anotación funcional de alto rendimiento y minería de datos con la suite Blast2GO". Nucleic Acids Research . 36 (10): 3420–35. doi :10.1093/nar/gkn176. PMC 2425479 . PMID 18445632.
- ^ Conesa, A; Götz, S (2008). "Blast2GO: una suite completa para el análisis funcional en genómica vegetal". Revista Internacional de Genómica Vegetal . 2008 : 1–12. doi : 10.1155/2008/619832 . PMC 2375974 . PMID 18483572.
- ^ Götz, S; Arnold, R; Sebastián-León, P; Martín-Rodríguez, S; Tischler, P; Jehl, MA; Dopazo, J; Rattei, T; Conesa, A (1 de abril de 2011). "B2G-FAR, un repositorio de anotaciones GO centrado en especies". Bioinformática . 27 (7): 919–24. doi : 10.1093/bioinformática/btr059. PMC 3065692 . PMID 21335611.
- ^ Altschul, SF; Gish, W; Miller, W; Myers, EW; Lipman, DJ (5 de octubre de 1990). "Herramienta básica de búsqueda de alineamiento local". Journal of Molecular Biology . 215 (3): 403–10. doi :10.1016/S0022-2836(05)80360-2. PMID 2231712. S2CID 14441902.
- ^ El Consorcio de Ontología Génica (enero de 2008). "El proyecto de Ontología Génica en 2008". Nucleic Acids Res . 36 (número de la base de datos): D440–4. doi :10.1093/nar/gkm883. PMC 2238979 . PMID 17984083.
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