Grupo BGI
Compañía china de secuenciación del genoma
Grupo BGI
Nombre nativo
深圳华大基因科技有限公司
AntesInstituto de Genómica de Beijing
Tipo de empresaPrivado
IndustriaÓmicas
Secuenciación del genoma
Biotecnología
Fundado9 de septiembre de 1999 ; hace 25 años ( 09-09-1999 )
FundadorWang Jian
Yu Jun
Yang Huanming
Liu Siqi
SedeShenzhen, Cantón, China
Número de ubicaciones
Una presencia global en más de 100 países y regiones [1] [2]
Área atendida
Mundial
Personas clave
Wang Jian (cofundador y presidente)
ProductosPlataforma DNBseq (plataforma de secuenciación de nueva generación), pruebas RT-PCR para la detección del virus SARS CoV-2 y sus mutaciones. Solución de laboratorio integrada Huo-Yan. La prueba NIFTY (una prueba prenatal no invasiva)
MarcasDNBseq, NIFTY, Huafeiran, Huachangkang, Huajianwei, Huachangan, Huafanan, SeqHPV, PMseq
GananciaAumentar251 millones de dólares (2016) [2]
Aumentar51,7 millones de dólares (2016) [2]
DueñoWang Jian
Número de empleados
~ 10.000 (en todo el mundo)
DivisionesBGI China (continental)
BGI Asia Pacífico
BGI Américas
BGI Europa (Europa y África)
Subsidiarias
Sitio webgenómica.cn

BGI Group , anteriormente Beijing Genomics Institute, es una empresa genómica china con sede en Yantian , Shenzhen . La empresa se formó originalmente en 1999 como un centro de investigación genética para participar en el Proyecto Genoma Humano . [3] [4] También secuencia los genomas de otros animales, plantas y microorganismos. [5]

BGI se ha transformado de un pequeño instituto de investigación, notable por decodificar el ADN de pandas y plantas de arroz, en una empresa diversificada activa en la clonación animal , pruebas de salud e investigación por contrato. [6] [7] [8] La investigación anterior de BGI fue continuada por el Instituto de Genómica de Beijing , Academia China de Ciencias. [9] BGI Research, la división sin fines de lucro del grupo, trabaja con el Instituto de Genómica y opera el Banco Nacional de Genes de China bajo un contrato con el gobierno chino. [10] [11] BGI Genomics, una subsidiaria, cotizó en la Bolsa de Valores de Shenzhen en 2017. La empresa cuenta con el apoyo de varios Fondos de Orientación del Gobierno de China y empresas estatales chinas . [12]

A partir de 2021, salieron a la luz detalles sobre múltiples controversias que involucran al Grupo BGI. [13] Estas controversias incluyen la supuesta colaboración con el Ejército Popular de Liberación (EPL) y el uso de datos genéticos de pruebas prenatales . [14] BGI negó que comparta datos genéticos prenatales con el EPL. [15]

Historia

Instituto de Genómica de Beijing

Wang Jian , Yu Jun, Yang Huanming y Liu Siqi crearon BGI, originalmente llamado Instituto de Genómica de Beijing, en septiembre de 1999, [16] en Beijing, China como un instituto de investigación independiente no gubernamental para participar en el Proyecto Genoma Humano como representante de China. [17] [18] Después de que se completó el proyecto, la financiación se agotó, después de lo cual BGI se trasladó a Hangzhou a cambio de financiación del Gobierno Municipal de Hangzhou. En 2002, BGI secuenció el genoma del arroz , que fue un artículo de portada en la revista Science . En 2003, BGI decodificó el genoma del virus del SARS y creó un kit para la detección del virus. [19] En 2003, la Academia China de Ciencias fundó el Instituto de Genómica de Beijing en cooperación con BGI, con Yang Huanming como su primer director. BGI Hangzhou y la Universidad de Zhejiang también fundaron un nuevo instituto de investigación, el Instituto James D. Watson de Ciencias del Genoma, Universidad de Zhejiang. [20] : 39 

Spin-off del Instituto de Genómica de Beijing

En 2007, BGI se separó de la Academia China de Ciencias, se convirtió en una empresa privada y se trasladó a Shenzhen. [21] [10] Yu Jun dejó BGI en ese momento supuestamente vendiendo su participación a los otros tres fundadores por una suma nominal. [5] En 2008, BGI publicó el primer genoma humano de un individuo asiático. [17] [22]

En 2010, BGI compró 128 máquinas de secuenciación genética Illumina HiSeq 2000 , [3] [17] que fueron respaldadas por US$1.500 millones en "fondos colaborativos" durante los siguientes 10 años del prestamista estatal China Development Bank . [5] [23] [24] A finales de año, según se informa, tenían un presupuesto de 30 millones de dólares. [25] En 2010, se estableció BGI Americas con su oficina principal en Cambridge, Massachusetts , EE. UU., y BGI Europe se estableció en Copenhague , Dinamarca. [26] [27] Para 2018, BGI abrió oficinas y laboratorios en Seattle y San José en EE. UU., [3] y Londres en el Reino Unido, y también se fundó BGI Asia Pacific con oficinas en Hong Kong , Kobe (Japón), Bangkok (Tailandia), Laos , Singapur , Brisbane (Australia) y muchos otros. [28] [29] [ se necesita una fuente de terceros ]

En 2011, BGI informó que empleaba a 4.000 científicos y técnicos, [30] y tenía 192 millones de dólares en ingresos. [5] BGI realizó la secuenciación del genoma del mortal brote de E. coli O104:H4 en Alemania en 2011 en tres días y lo publicó bajo una licencia abierta. [31] Desde 2012, ha comenzado a comercializar sus servicios, con inversiones de China Life Insurance Company , Goldstone Investment de CITIC Group , Yunfeng Capital de Jack Ma y SoftBank China Capital. [32] Ese año también lanzaron su propia revista científica, GigaScience , [33] asociándose con BioMed Central para publicar artículos sobre ciencias de la vida con gran cantidad de datos. [34] Posteriormente se formó una nueva asociación entre el departamento de prensa de GigaScience de BGI y Oxford University Press y desde 2017 GigaScience se ha coeditado con Oxford University Press. [35] [36]

En 2013, BGI compró Complete Genomics de Mountain View, California , un importante proveedor de tecnología de secuenciación de ADN, por 118 millones de dólares, tras obtener la aprobación del Comité de Inversión Extranjera de los Estados Unidos . [5] [31] [37] Complete Genomics es una subsidiaria de MGI con sede en EE. UU. , MGI era una subsidiaria de BGI antes de que se escindiera y cotizara en la Bolsa de Valores de Shanghái en 2022. [38]

En 2015, BGI firmó un acuerdo de colaboración con el Centro de Medicina Clínica de Precisión del Hospital Zhongshan en Shanghái, inaugurado en mayo de 2015 con un presupuesto de 100 millones de yenes. Según se informa, están participando como institución de secuenciación en el proyecto de investigación de 9200 millones de dólares estadounidenses de China para atención médica que durará 15 años. [3] [39] En mayo de 2017, se anunció la formación del Centro de Innovación de la Costa Oeste, ubicado en Seattle y San José, en el primer lugar planificado para trabajar en medicina de precisión y presentar colaboraciones con la Universidad de Washington , el Instituto Allen de Ciencias del Cerebro , la Fundación Bill y Melinda Gates y la Universidad Estatal de Washington , mientras que en el segundo laboratorio ya existente con 100 empleados se desarrollarán tecnologías de secuenciación de próxima generación . [3] En mayo de 2018, llegó a un acuerdo con el Hospital Mount Sinai (Toronto) , Canadá, para la primera instalación de plataformas BGISEQ en América del Norte. [40]

BGI Genomics, una subsidiaria del grupo [41], realizó una oferta pública inicial en julio de 2017 en la Bolsa de Valores de Shenzhen . [10] En 2018, se informó que Wang Jian poseía el 85,3% de BGI y el grupo posee el 42,4% de su unidad principal, BGI Genomics. [42]

En 2019, se informó que una subsidiaria de BGI, Forensic Genomics International, había creado una base de datos habilitada para WeChat de perfiles genéticos de personas de todo el país. [43] [44] [45] [46] [47] En julio de 2020, se informó que BGI devolvió un préstamo del Programa de Protección de Cheques de Pago luego del escrutinio de los medios. [48]

En 2021, las empresas estatales State Development and Investment Corporation y China Merchants Group adquirieron participaciones en BGI Genomics. [49]

Sanciones de EE.UU.

En julio de 2020, la Oficina de Industria y Seguridad del Departamento de Comercio de los Estados Unidos incluyó a dos subsidiarias de BGI en su Lista de entidades por ayudar en presuntos abusos de los derechos humanos debido a su trabajo de análisis genético en Xinjiang . [50] [51] En marzo de 2023, el Departamento de Comercio de los Estados Unidos agregó a BGI Research y BGI Tech Solutions (Hong Kong) a la Lista de entidades por acusaciones de vigilancia y represión de minorías étnicas. [52]

Posteriormente, BGI contrató a los cabilderos de Steptoe & Johnson para suavizar el lenguaje de la Ley de Autorización de Defensa Nacional para el Año Fiscal 2024 que prohibiría la financiación gubernamental de BGI y sus subsidiarias. [53]

A partir de 2024, BGI está identificada en una lista por el Departamento de Defensa de los Estados Unidos como una empresa militar china que opera en los EE. UU. [54] En abril de 2024, el Comité Selecto de la Cámara de Representantes de los Estados Unidos sobre Competencia Estratégica entre los Estados Unidos y el Partido Comunista Chino solicitó al Departamento de Defensa una explicación de por qué las subsidiarias de BGI, Innomics y STOmics, no estaban incluidas en la misma lista. [55]

Investigación

E. coli

En 2011, BGI secuenció el genoma de la bacteria E. coli que causó una epidemia en Europa para identificar los genes que conducen a la resistencia a los antibióticos. [56]

COVID-19

En enero de 2020, BGI Genomics anunció su kit de RT-PCR fluorescente en tiempo real que ayuda a identificar el virus SARS-CoV-2 que causa la COVID-19. Posteriormente, este kit fue verificado y autorizado para su uso en 14 países y regiones, incluida la lista de uso de emergencia de la Organización Mundial de la Salud . [57] BGI Genomics informó que, en abril de 2021, los kits de RT-PCR se habían distribuido a más de 180 países y regiones. BGI también desarrolló laboratorios de detección de ácidos nucleicos de alto rendimiento de nivel 2 de bioseguridad, denominados laboratorios Huo-Yan. [36] [58]

En la primera mitad de 2020, BGI Group ofreció ayudar al estado de California a instalar laboratorios de pruebas de COVID-19 a un costo razonable. El gobierno de California rechazó la oferta debido a preocupaciones geopolíticas, pero el condado de Santa Clara compró kits y equipos de prueba de COVID-19 a BGI. [59]

El 25 de agosto de 2020, Reuters informó que a unas 3.700 personas en Suecia se les dijo por error que tenían el coronavirus debido a una falla en un kit de prueba de COVID-19 de BGI Genomics. [60] A pesar de ser la quinta prueba en recibir la Lista de uso de emergencia de la OMS, [61] y obtener las mejores calificaciones en pruebas de sensibilidad en un estudio holandés que validó de forma independiente pruebas disponibles comercialmente. [62] BGI Genomics defendió el producto, culpando a las diferencias en los umbrales utilizados entre los laboratorios que analizan niveles muy bajos del virus. [63]

Tecnología bioinformática

El presupuesto anual para el centro de cómputo fue de 9 millones de dólares estadounidenses. [25] Ese mismo año, los biólogos computacionales de BGI desarrollaron el primer algoritmo exitoso, basado en la teoría de grafos , para alinear miles de millones de cadenas de 25 a 75 pares de bases producidas por secuenciadores de próxima generación, específicamente el Genome Analyzer de Illumina , durante la secuenciación de novo. [64]

SOAPdenovo es parte del " Paquete de análisis de oligonucleótidos cortos " (SOAP) , un conjunto de herramientas desarrolladas por BGI para el ensamblaje de novo de genomas de tamaño humano, alineación, detección de SNP, resecuenciación, búsqueda de indel y análisis de variación estructural. Creado para las lecturas cortas de los secuenciadores Illumina, SOAPdenovo se ha utilizado para ensamblar múltiples genomas humanos [65] [66] [67] (identificando una inserción de ocho kilobases no detectada mediante el mapeo al genoma humano de referencia [68] ) y animales, como el panda gigante. [69]

Hasta 2015, BGI había lanzado BGISEQ-100, basado en el dispositivo Ion Torrent de Thermo Fisher Scientific , y BGISEQ-1000, para los cuales ambos recibieron una aprobación de la CFDA para una prueba prenatal NIFTY (Prueba de trisomía fetal no invasiva). [70] En octubre de 2015, BGI lanzó BGISEQ-500, [71] un sistema de secuenciación de escritorio más grande. Según se informa, recibió más de 500 pedidos para el sistema y ejecutó más de 112.000 pruebas hasta finales de 2016. [70] El Banco Nacional de Genes de China, abierto por BGI y el Gobierno chino en septiembre de 2016, [72] tiene 150 instrumentos del sistema. [70] El BGISEQ-500 se desarrolló como una plataforma de secuenciación capaz de competir con las plataformas de Illumina. [73] En noviembre de 2016, BGI lanzó BGISEQ-50, una versión en miniatura de un secuenciador de escritorio. [74] En 2017, BGI comenzó a ofrecer WGS por $600. [3] En septiembre de 2022, MGI lanzó DNBSeq-G99, un nuevo secuenciador de ultraalta velocidad y rendimiento medio a bajo. [75]

En 2021, BGI desarrolló Stereo-seq, su tecnología de transcriptómica espacial de todo el genoma y publicó los primeros resultados de la investigación de un consorcio de usuarios científicos de la tecnología en 2022. [76] [77] En 2022, BGI-Research y la Universidad de la Academia de Ciencias de China , junto con científicos de todo el mundo, utilizaron tecnologías de secuenciación para realizar la secuenciación de células individuales para ampliar la comprensión del desarrollo embrionario humano temprano, para completar el primer atlas de células de cuerpo completo de un primate no humano, para completar el primer atlas de transcriptoma de células individuales de todo el cuerpo de cerdos del mundo y para estudiar los cerebros de las hormigas para explicar por primera vez cómo la división social del trabajo dentro de las colonias de hormigas está determinada por la especialización funcional de sus cerebros a nivel celular. [78] [79]

Agricultura y biodiversidad

En 2002, BGI publicó el genoma de la variedad de arroz Indica. [80] En 2014, BGI también colaboró ​​en un proyecto para resecuenciar 3.000 genomas de arroz de 89 países. [81]

BGI es miembro del Proyecto BioGenoma de la Tierra, un proyecto internacional cuyo objetivo es secuenciar el ADN de todas las especies eucariotas conocidas en la Tierra. [82] BGI ha contribuido al Proyecto de secuenciación del genoma 10KP, un proyecto afiliado para secuenciar más de 10 000 genomas de plantas. [83]

En 2019, el competidor Illumina, Inc. presentó múltiples demandas por infracción de patentes contra BGI. [84] [85] En respuesta, BGI ha presentado demandas por infracción de patentes contra Illumina alegando violaciones de las leyes federales antimonopolio y de competencia desleal de California . [86] En mayo de 2022, un tribunal estadounidense ordenó a Illumina pagar 333,8 millones de dólares a BGI Group tras determinar que los sistemas de secuenciación de ADN de Illumina infringían dos de las patentes de BGI. [87] El fallo también declaró que Illumina infringió las patentes deliberadamente y que tres patentes de las que había acusado a la filial Complete Genomics de BGI de infringir eran inválidas. [88] En julio de 2022, Illumina y MGI Tech Co. y Complete Genomics resolvieron demandas estadounidenses sobre tecnología de secuenciación de ADN, e Illumina acordó pagar 325 millones de dólares para resolver todos los litigios estadounidenses. Como parte del acuerdo, Illumina recibirá una licencia sobre las patentes de las filiales de BGI, y ambas compañías acordaron no demandarse entre sí por violaciones de patentes o leyes antimonopolio en los Estados Unidos durante tres años. [89]

Colaboración con el Ejército Popular de Liberación

En enero de 2021, Reuters informó que BGI ha trabajado con el Ejército Popular de Liberación (EPL) e instituciones afiliadas como la Universidad Nacional de Tecnología de Defensa en esfuerzos para mejorar la fuerza de los soldados y otros proyectos. [90] En julio de 2021, Reuters informó que BGI desarrolló una prueba prenatal, con la ayuda del Ejército Popular de Liberación, que también se utiliza para la recopilación de datos genéticos. [91] [14] En una entrevista con el South China Morning Post , un representante de BGI negó el informe de Reuters. [15] El South China Morning Post afirmó que BGI publicó artículos con el Hospital General del Ejército Popular de Liberación y la Universidad Médica del Ejército , explicando en el artículo que en China "muchos hospitales de primer nivel están afiliados al ejército". [15] BGI declaró además que "Todos los datos NIPT recopilados en el extranjero se almacenan en el laboratorio de BGI en Hong Kong y se destruyen después de cinco años, como lo estipula el Reglamento General de Protección de Datos (GDPR)". [92] BGI también declaró que "nunca se le ha pedido a BGI que proporcione, ni ha proporcionado, datos de sus pruebas NIFTY a las autoridades chinas para fines de seguridad nacional o de seguridad de defensa nacional". [91]

En respuesta al informe de Reuters, un regulador alemán de privacidad inició una investigación sobre el uso de las pruebas genéticas prenatales de BGI por parte de una empresa alemana. [93] En agosto de 2021, el Reino Unido anunció un requisito de registro en la Agencia Reguladora de Medicamentos y Productos Sanitarios para las pruebas prenatales de BGI. [94] Los reguladores de Australia, Estonia, Canadá y Polonia también expresaron su preocupación, al igual que el Centro Nacional de Contrainteligencia y Seguridad de EE. UU . [95] [96] [97]

En noviembre de 2021, Reuters informó que un profesor de la Universidad de Copenhague , Guojie Zhang, que también trabajaba para BGI, estaba desarrollando medicamentos para el EPL para ayudar a los soldados a controlar el mal de altura . [98] BGI declaró que el estudio "no se llevó a cabo con fines militares". [98] El 1 de diciembre de 2021, la Universidad de Copenhague comentó el informe de Reuters. [99]

En octubre de 2022, el Departamento de Defensa de los Estados Unidos agregó a BGI Genomics Co, una subsidiaria que cotiza en bolsa, a una lista de "compañías militares chinas" que operan en los EE. UU. [100] [101]

Véase también

Referencias

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