Proteína relacionada con la autofagia 101

ATG101
Estructuras disponibles AP Búsqueda de ortólogos: PDBe RCSB Lista de códigos de identificación del PDB 4WZG, 5C50
Identificadores
Alias	ATG101 , C12orf44, relacionado con la autofagia 101
Identificaciones externas	OMIM : 615089; MGI : 1915368; HomoloGene : 11072; Tarjetas genéticas : ATG101; OMA :ATG101 - ortólogos
Ubicación genética ( humana ) Cristo. Cromosoma 12 (humano) [1] Banda 12t13.13 Comenzar 52.069.246 pb [1] Fin 52.077.495 pb [1]
Ubicación del gen ( ratón ) Cristo. Cromosoma 15 (ratón) [2] Banda 15|15 F1 Comenzar 101.182.153 pb [2] Fin 101.188.826 pb [2]
Patrón de expresión del ARN Bgee Humano Ratón (ortólogo) Top expresado en célula estromal del endometrio glándula parótida mucosa del colon transverso cuerpo del estómago piel del abdomen piel de la pierna vesícula biliar Islote de Langerhans testículo izquierdo granulocito Top expresado en granulocito mórula vesícula ótica músculo del muslo sáculo riñón derecho labio Giro dentado del hipocampo Formación de células granulares embrión placoda ótica Más datos de expresión de referencia BioGPS n / A
Ontología genética Función molecular unión de proteínas unión de proteínas idénticas unión de complejos que contienen proteínas Componente celular citoplasma citosol sitio de ensamblaje del fagóforo membrana del retículo endoplasmático Proceso biológico autofagia macroautofagia ensamblaje del autofagosoma regulación de la macroautofagia Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos Especies Humano Ratón Entre 60673 68118 Conjunto ENSG00000123395 ENSMUSG00000037204 Protección unificada Q9BSB4 Q9D8Z6 RefSeq (ARNm) NM_021934 NM_001098673 Número nuevo_026566 RefSeq (proteína) NP_001092143 NP_068753 NP_080842 Ubicación (UCSC) Crónica 12: 52.07 – 52.08 Mb Crónicas 15:101.18 – 101.19 Mb Búsqueda en PubMed [3] [4]
Wikidatos
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La proteína 101 relacionada con la autofagia, también conocida como ATG101, es una proteína que en los humanos está codificada por el gen C12orf44 ( marco de lectura abierto 44 del cromosoma 12). ^[5]

La autofagia es el proceso de secuestrar proteínas diana, orgánulos, agregados y otras especies citoplasmáticas dentro de grandes vesículas unidas a la membrana y entregarlas a los lisosomas para su degradación. La proteína ATG101 se localiza en el citoplasma , pero posiblemente también se pueda encontrar unida a una estructura conocida como fagóforo, involucrada en los pasos iniciales de la autofagia. El gen está altamente conservado entre los mamíferos, además de mostrar conservación entre la mayoría de los eucariotas. Se cree que interactúa directamente con ATG13 en el complejo ULK1 , lo que puede ser importante para activar los fagóforos.

ATG101 es una de las docenas de proteínas diversas que reciben su nombre por su participación en la autofagia, un proceso bien conservado entre la mayoría de los organismos eucariotas. Sin embargo, ATG101 no es homóloga de ninguna de las otras proteínas ATG. ATG101 interactúa con la proteína esencial de autofagia ATG13 en mamíferos, que es una proteína que interactúa con ULK1 . ^[6] Se cree que ULK1 (quinasa 1 similar a unc-51) es importante en la activación de la macroautofagia en mamíferos. Se sugiere que ATG101 protege a ATG13 de la degradación proteasomal , estabilizando así los niveles de ATG13 encontrados en las células y regulando los niveles de macroautofagia. ^[7] Según artículos publicados, se dice que ATG101 se localiza en la membrana de aislamiento, también conocida como fagóforo. Esta unión al fagóforo posiblemente podría explicar el sitio de palmitoilación encontrado en el tercer aminoácido, que es una cisteína . Los fagóforos son los encargados de reconocer y rodear los materiales que van a ser degradados en el lisosoma .

La proteína ATG101 contiene un dominio DUF1649 (dominio de función desconocida 1649).

La proteína ATG101 está muy conservada en la mayoría de los vertebrados, incluidos animales como los ratones, cuyo ancestro común con los humanos se cree que divergió hace entre 65 y 85 millones de años. Esto puede ser una prueba de que la proteína ATG101 es importante de tal manera que debe permanecer conservada estructuralmente para mantener su función. Solo se conocen 2 SNP sin sentido en la secuencia de ADN de ATG101, lo que demuestra que no existen otras versiones de esta proteína, lo que también sugiere su importancia estructural.

En esta traducción conceptual se puede observar el sitio de palmitoilación en el tercer aminoácido, así como un posible sitio de fosforilación que se muestra entre corchetes. Los aminoácidos están alineados sobre la región codificante del ARNm, que también está numerada a los lados. En ATG101, esta proteína es rica en valina.

No existen datos concretos que establezcan la presencia de ATG101 en un área en particular. Al observar múltiples conjuntos de expresión tanto en humanos como en ratones, se ha planteado la hipótesis de que se expresa de forma ubicua en los tejidos.

• Proteína de andamiaje asociada a GRASP GRP1 (receptor general de fosfoinosítidos 1) ^[8] -

Los códigos para una proteína receptora general relativamente desconocida, ubicada en la misma cadena que C12orf44 como se ve a continuación, abarcan 8924 pb.

• NR4A1 (subfamilia 4 de receptores nucleares, grupo A, miembro 1) -

Este gen codifica el factor de crecimiento nervioso IB, que es miembro de la superfamilia de receptores de hormonas esteroides-tiroideas-retinoides. La expresión es inducida por la fitohemaglutinina en los linfocitos humanos y por la estimulación sérica de fibroblastos detenidos. La proteína codificada actúa como un factor de transcripción nuclear. La translocación de la proteína desde el núcleo a las mitocondrias induce la apoptosis. La ubicación es en la misma cadena que C12orf44, abarca 8097 pb.

• OR7E47P (receptor olfativo, familia 7, subfamilia E, pseudogen miembro 47) -

Los receptores olfativos interactúan con las moléculas odoríferas de la nariz para iniciar una respuesta neuronal que desencadena la percepción de un olor. Las proteínas receptoras olfativas son miembros de una gran familia de receptores acoplados a proteína G (GPCR) que surgen de genes de un solo exón codificante. Los receptores olfativos comparten una estructura de 7 dominios transmembrana con muchos receptores de neurotransmisores y hormonas y son responsables del reconocimiento y la transducción mediada por proteína G de señales odoríferas. Ubicado después de C12orf44 en el cromosoma, se encuentra en la misma hebra y tiene una longitud de 946 pb.

• KRT80 (queratina 80) -

Este gen codifica una queratina epitelial que se expresa débilmente en la lengua. Está ubicado en la cadena opuesta a C12orf44 y tiene una longitud de 23.005 pb.

• Página de detalles del gen ATG101 y ubicación del genoma humano ATG101 en el navegador de genoma de la UCSC .