APOBEC3H

APOBEC3H
Identificadores
Alias	APOBEC3H , A3H, ARP-10, ARP10, subunidad catalítica 3H de la enzima de edición de ARNm de la apolipoproteína B
Identificaciones externas	OMIM : 610976; HomoloGene : 52306; Tarjetas genéticas : APOBEC3H; OMA :APOBEC3H - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 22 (humano)
Fin	39.104.067 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	granulocito; ; mucosa gástrica; ; sangre; ; ganglio linfático; ; bazo; ; apéndice; ; trompa uterina derecha; ; vesícula biliar; ; tejido muscular liso; ; corteza suprarrenal derecha;
	n / A
	Más datos de expresión de referencia
	n / A
Ontología genética
Función molecular	Actividad hidrolasa, que actúa sobre enlaces carbono-nitrógeno (pero no peptídicos), en amidinas cíclicas.; actividad de la citidina desaminasa; unión de iones de zinc; unión a proteínas; actividad catalítica; actividad hidrolasa; unión de iones metálicos; Unión de ARN;
Componente celular	citoplasma; Cuerpo P; núcleo;
Proceso biológico	regulación negativa de la transposición; respuesta inmune innata; respuesta de defensa al virus; Desaminación de la citosina del ADN; regulación negativa del proceso viral; Regulación negativa de la replicación del ARN viral monocatenario a través de un intermediario de ADN bicatenario.; proceso del sistema inmunológico; desaminación de citidina; Edición de citidina a uridina; Desmetilación del ADN;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	164668
	n / A
	ENSG00000100298
	n / A
	Q6NTF7
	n / A
	NM_001166002 ; NM_001166003 ; NM_001166004 ; NM_181773
	n / A
	NP_001159474 ; NP_001159475 ; NP_001159476 ; NP_861438
	n / A
	Wikidatos
Ver/Editar humano

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La enzima editora de ADN dC->dU APOBEC-3H , también conocida como enzima editora de ARNm de la apolipoproteína B similar al polipéptido catalítico 3H o proteína relacionada con APOBEC 10 , es una proteína que en los humanos está codificada por el gen APOBEC3H . ^[3]

Función

Este gen codifica un miembro de la familia de proteínas del polipéptido catalítico de la enzima editora de ARNm de la apolipoproteína B ( APOBEC ). La proteína codificada es una citidina desaminasa que tiene actividad antirretroviral al generar hipermutaciones letales en los genomas virales. Los polimorfismos y el empalme alternativo en este gen influyen en su actividad antirretroviral y están asociados con una mayor resistencia a la infección por el virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 en ciertas poblaciones. Hay solo uno o dos miembros de esta familia de genes en mamíferos no primates, pero al menos siete miembros en primates. APOBEC3H es un efector antiviral. En los monos del Viejo Mundo, APOBEC3H tiene una actividad antiviral eficiente contra los lentivirus de primates y es sensible a la inactivación por la proteína Vif del virus de la inmunodeficiencia de los simios, y es capaz de hipermutar genomas retrovirales. El gen APOBEC3H humano típico se expresa de forma inherentemente pobre en las células de primates y es ineficaz para inhibir la replicación retroviral. ^[4] Es importante destacar que cada persona tiene una potencia y una concentración de APOBEC3H diferentes. Las personas con una versión del gen APOBEC3H que produce variaciones estables de la proteína pueden limitar con éxito la capacidad del VIH-1 para replicarse. ^[5]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000100298 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ "Entrez Gene: enzima de edición de ARNm de la apolipoproteína B".
^ OhAinle M, Kerns JA, Malik HS, Emerman M (abril de 2006). "Evolución adaptativa y actividad antiviral de la citidina desaminasa conservada de mamíferos APOBEC3H". Journal of Virology . 80 (8): 3853–62. doi :10.1128/JVI.80.8.3853-3862.2006. PMC 1440450 . PMID 16571802.
^ Refsland EW, Hultquist JF, Luengas EM, Ikeda T, Shaban NM, Law EK, et al. (noviembre de 2014). "Los polimorfismos naturales en APOBEC3H humano y Vif del VIH-1 se combinan en los linfocitos T primarios para afectar los niveles de mutación de G a A viral y la infectividad". PLOS Genetics . 10 (11): e1004761. doi : 10.1371/journal.pgen.1004761 . PMC 4238949 . PMID 25411794.

Lectura adicional

Dang Y, Siew LM, Wang X, Han Y, Lampen R, Zheng YH (abril de 2008). "La citidina desaminasa humana APOBEC3H restringe la replicación del VIH-1". The Journal of Biological Chemistry . 283 (17): 11606–14. doi : 10.1074/jbc.M707586200 . PMC 2430661 . PMID 18299330.
Wang X, Abudu A, Son S, Dang Y, Venta PJ, Zheng YH (abril de 2011). "Análisis de los haplotipos humanos de APOBEC3H y actividad anti-virus de inmunodeficiencia humana tipo 1". Journal of Virology . 85 (7): 3142–52. doi :10.1128/JVI.02049-10. PMC 3067873 . PMID 21270145.
Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (abril de 2003). "Edición de ARN mensajero en mamíferos: nuevos miembros de la familia APOBEC que buscan un papel en el negocio familiar". Tendencias en genética . 19 (4): 207–16. doi :10.1016/S0168-9525(03)00054-4. PMID 12683974.
OhAinle M, Kerns JA, Malik HS, Emerman M (abril de 2006). "Evolución adaptativa y actividad antiviral de la citidina desaminasa conservada de mamíferos APOBEC3H". Journal of Virology . 80 (8): 3853–62. doi :10.1128/JVI.80.8.3853-3862.2006. PMC 1440450 . PMID 16571802.
Vartanian JP, Guétard D, Henry M, Wain-Hobson S (abril de 2008). "Evidencia de edición del ADN del virus del papiloma humano por APOBEC3 en lesiones benignas y precancerosas". Science . 320 (5873): 230–3. Bibcode :2008Sci...320..230V. doi :10.1126/science.1153201. PMID 18403710. S2CID 23886176.
Ooms M, Majdak S, Seibert CW, Harari A, Simon V (agosto de 2010). "La localización de las variantes de APOBEC3H en los viriones del VIH-1 determina su actividad antiviral". Journal of Virology . 84 (16): 7961–9. doi :10.1128/JVI.00754-10. PMC 2916534 . PMID 20519396.
Tan L, Sarkis PT, Wang T, Tian C, Yu XF (enero de 2009). "La única copia de la citidina desaminasa humana tipo Z2 APOBEC3H tiene actividad inhibidora contra los retrotransposones y el VIH-1". FASEB Journal . 23 (1): 279–87. doi : 10.1096/fj.07-088781 . PMC 2626612 . PMID 18827027.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, et al. (2004). "Un enfoque basado en la anotación del genoma para la clonación del ORFeome humano". Genome Biology . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, et al. (diciembre de 2002). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
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OhAinle M, Kerns JA, Li MM, Malik HS, Emerman M (septiembre de 2008). "La actividad antirretroelemento de APOBEC3H se perdió dos veces en la evolución humana reciente". Cell Host & Microbe . 4 (3): 249–59. doi :10.1016/j.chom.2008.07.005. PMC 2608726 . PMID 18779051.
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Enlaces externos

Ubicación del genoma humano APOBEC3H y página de detalles del gen APOBEC3H en el navegador de genoma de la UCSC .

Este artículo sobre un gen del cromosoma humano 22 es un esbozo . Puedes ayudar a Wikipedia expandiéndolo.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000100298 – Ensembl , mayo de 2017

[2] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[entrez-3] "Entrez Gene: enzima de edición de ARNm de la apolipoproteína B".

[pmid16571802-4] OhAinle M, Kerns JA, Malik HS, Emerman M (abril de 2006). "Evolución adaptativa y actividad antiviral de la citidina desaminasa conservada de mamíferos APOBEC3H". Journal of Virology . 80 (8): 3853–62. doi :10.1128/JVI.80.8.3853-3862.2006. PMC 1440450 . PMID 16571802.

[pmid25411794-5] Refsland EW, Hultquist JF, Luengas EM, Ikeda T, Shaban NM, Law EK, et al. (noviembre de 2014). "Los polimorfismos naturales en APOBEC3H humano y Vif del VIH-1 se combinan en los linfocitos T primarios para afectar los niveles de mutación de G a A viral y la infectividad". PLOS Genetics . 10 (11): e1004761. doi : 10.1371/journal.pgen.1004761 . PMC 4238949 . PMID 25411794.