APOBEC3D

APOBEC3D
Identificadores
Alias	APOBEC3D , A3D, APOBEC3DE, APOBEC3E, ARP6, subunidad catalítica 3D de la enzima de edición de ARNm de la apolipoproteína B, A3DE
Identificaciones externas	OMIM : 609900; HomoloGene : 122788; Tarjetas genéticas : APOBEC3D; OMA :APOBEC3D - ortólogos
Ubicación genética ( humana )
Cristo.	Cromosoma 22 (humano)
Fin	39.033.277 pb
Patrón de expresión del ARN
	Top expresado en
	granulocito; ; ganglio linfático; ; bazo; ; células de la médula ósea; ; sangre; ; apéndice; ; trompa uterina derecha; ; monocito; ; vesícula biliar; ; recto;
	n / A
	Más datos de expresión de referencia
	n / A
Ontología genética
Función molecular	Actividad hidrolasa, que actúa sobre enlaces carbono-nitrógeno (pero no peptídicos), en amidinas cíclicas.; unión de iones de zinc; actividad catalítica; actividad hidrolasa; unión de iones metálicos; Unión de ARN; actividad de la citidina desaminasa;
Componente celular	citoplasma; Cuerpo P; núcleo;
Proceso biológico	regulación negativa de la transposición; respuesta inmune innata; respuesta de defensa al virus; Desaminación de la citosina del ADN; Regulación negativa de la replicación del ARN viral monocatenario a través de un intermediario de ADN bicatenario.; proceso del sistema inmunológico; desaminación de citidina; Edición de citidina a uridina; Desmetilación del ADN;
	Fuentes: Amigo / QuickGO
Ortólogos
	140564
	n / A
	ENSG00000243811
	n / A
	B2CML4
	n / A
	Número de serie 152426 Número de ; serie 001363781
	n / A
	NP_689639NP_001350710;
	n / A
	Wikidatos
Ver/Editar humano

Gen codificador de proteínas en la especie Homo sapiens

La enzima editora de ADN dC->dU APOBEC-3D es una proteína que en los humanos está codificada por el gen APOBEC3D . ^[3]^[4]

Este gen es miembro de la familia de genes de la citidina desaminasa . Es uno de los siete genes relacionados o pseudogenes que se encuentran en un grupo , que se cree que es el resultado de la duplicación genética , en el cromosoma 22. Los miembros del grupo codifican proteínas que están relacionadas estructural y funcionalmente con la citidina desaminasa editora de ARN de C a U APOBEC1 e inhiben los retrovirus , como el VIH , al desaminar los residuos de citosina en el ADNc retroviral naciente. ^[4]

Referencias

^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000243811 – Ensembl , mayo de 2017
^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
^ Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (febrero de 2002). "Un locus específico de antropoides de enzimas de edición de ARN huérfano de C a U en el cromosoma 22". Genómica . 79 (3): 285–96. doi :10.1006/geno.2002.6718. PMID 11863358.
^ ab "Entrez Gene: enzima de edición de ARNm de apolipoproteína B APOBEC3D, polipéptido catalítico similar a 3D (putativo)".

Identificación de APOBEC3DE como otro factor antirretroviral de la familia APOBEC humana. Dang Y, Wang X, Esselman WJ, Zheng YH. J Virol. 2006 Nov;80(21):10522-33. doi: 10.1128/JVI.01123-06. Publicación electrónica 18 de agosto de 2006.

Enlaces externos

Ubicación del genoma humano APOBEC3D y página de detalles del gen APOBEC3D en el navegador de genoma de la UCSC .

Lectura adicional

Wedekind JE, Dance GS, Sowden MP, Smith HC (2003). "Edición de ARN mensajero en mamíferos: nuevos miembros de la familia APOBEC que buscan un papel en el negocio familiar". Trends Genet . 19 (4): 207–16. doi :10.1016/S0168-9525(03)00054-4. PMID 12683974.
Harris RS, Liddament MT (2004). "Restricción retroviral por proteínas APOBEC". Nat. Rev. Immunol . 4 (11): 868–77. doi :10.1038/nri1489. PMID 15516966. S2CID 10789405.
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et al. (1999). "La secuencia de ADN del cromosoma humano 22". Nature . 402 (6761): 489–95. Bibcode :1999Natur.402..489D. doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Secuenciación shotgun del transcriptoma humano con etiquetas de secuencia expresadas en ORF". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 97 (7): 3491–6. Bibcode :2000PNAS...97.3491D. doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias completas de ADNc humano y de ratón". Proc. Natl. Sci. EE. UU . . 99 (26): 16899–903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
Mariani R, Chen D, Schröfelbauer B, et al. (2003). "Exclusión específica de especie de APOBEC3G de los viriones del VIH-1 por Vif". Cell . 114 (1): 21–31. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00515-4 . PMID 12859895.
Sawyer SL, Emerman M, Malik HS (2006). "Evolución adaptativa antigua de la enzima de edición de ADN antiviral de primates APOBEC3G". PLOS Biol . 2 (9): E275. doi : 10.1371/journal.pbio.0020275 . PMC 479043 . PMID 15269786.
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, et al. (2005). "Un enfoque basado en la anotación del genoma para clonar el ORFeome humano". Genome Biol . 5 (10): R84. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604. PMID 15461802 .
Dang Y, Wang X, Esselman WJ, Zheng YH (2006). "Identificación de APOBEC3DE como otro factor antirretroviral de la familia APOBEC humana". J. Virol . 80 (21): 10522–33. doi :10.1128/JVI.01123-06. PMC 1641744 . PMID 16920826.
Kinomoto M, Kanno T, Shimura M, et al. (2007). "Todas las proteínas de la familia APOBEC3 inhiben de forma diferencial la retrotransposición de LINE-1". Nucleic Acids Res . 35 (9): 2955–64. doi :10.1093/nar/gkm181. PMC 1888823 . PMID 17439959.

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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000243811 – Ensembl , mayo de 2017

[2] "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[pmid11863358-3] Jarmuz A, Chester A, Bayliss J, Gisbourne J, Dunham I, Scott J, Navaratnam N (febrero de 2002). "Un locus específico de antropoides de enzimas de edición de ARN huérfano de C a U en el cromosoma 22". Genómica . 79 (3): 285–96. doi :10.1006/geno.2002.6718. PMID 11863358.

[entrez-4] "Entrez Gene: enzima de edición de ARNm de apolipoproteína B APOBEC3D, polipéptido catalítico similar a 3D (putativo)".