ADP-ribosilhidrolasa

ADP-ribosilhidrolasa
Estructura cristalina de la ribosilglicohidrolasa mj1187 de methanococcus jannaschii
Identificadores
SímboloARROYO
PfamPF03747
InterprofesionalIPR005502
SCOP21t5j / ALCANCE / SUPFAM
Estructuras de proteínas disponibles:
Pfam  estructuras / ECOD  
APPDB RCSB; PDBj
PDBsumaResumen de la estructura

En biología molecular, la familia de las ( ADP-ribosil)hidrolasas (ARH) contiene enzimas que catalizan la hidrólisis de las modificaciones de ADP -ribosilo de proteínas, ácidos nucleicos y moléculas pequeñas. [1]

Tipos

Esta familia tiene tres miembros en los humanos (ARH1-3): ARH1 , también denominada [proteína ADP-ribosilarginina] hidrolasa, escinde la ADP-ribosa-L-arginina, [2] ARH2 , que se predice que es enzimáticamente inactiva, [3] y ARH3 , que escinde principalmente la ADP-ribosa-L-serina, pero se ha demostrado que también hidroliza poli(ADP-ribosa), 1''- O -acetil-ADP-ribosa y alfa- nicotinamida adenina dinucleótido . [4] [5] [6] [7] La ​​familia también incluye la ADP-ribosil-(dinitrogen reductase) hidrolasa (DraG), conocida por regular la dinitrogenasa reductasa , una enzima clave de la vía de fijación de nitrógeno en bacterias, [8] [1] y, lo más sorprendente, las cristalinas de medusa , [8] [9] aunque estas últimas proteínas parecen haber perdido los presuntos residuos del sitio activo .

ClaseEspecies
Localización intracelular
ActividadFunción
BacteriaHumanoOtros
IARH1retículo endoplasmático, citoplasmaADP-ribosilarginina hidrolasainflamación, estabilidad genómica
IIARH2citoplasma, sarcómeros cardíacosinactivoexcrecencia de la cámara del corazón
IIIARH3Núcleo, citoplasmaADP-ribosilserina hidrolasaReparación del ADN
IVCrystallin J1 [9] y SelJ [10]inactivoCristalina
VArrastrarADP-ribosilarginina hidrolasaRegulación de la fijación del nitrógeno

Véase también

Referencias

  1. ^ ab Rack JG, Palazzo L, Ahel I (marzo de 2020). "(ADP-ribosil)hidrolasas: estructura, función y biología". Genes & Development . 34 (5–6): 263–284. doi :10.1101/gad.334631.119. PMC  7050489 . PMID  32029451.
  2. ^ Takada T, Iida K, Moss J (agosto de 1993). "Clonación y mutagénesis dirigida de la ADP-ribosilarginina hidrolasa humana". The Journal of Biological Chemistry . 268 (24): 17837–43. doi : 10.1016/S0021-9258(17)46780-9 . PMID  8349667.
  3. ^ Smith SJ, Towers N, Saldanha JW, Shang CA, Mahmood SR, Taylor WR, Mohun TJ (agosto de 2016). "La proteína cardíaca restringida ADP-ribosilhidrolasa-like 1 es esencial para el crecimiento de la cámara cardíaca y actúa sobre el ensamblaje del filamento de actina muscular". Biología del desarrollo . 416 (2): 373–88. doi :10.1016/j.ydbio.2016.05.006. PMC 4990356 . PMID  27217161. 
  4. ^ Fontana P, Bonfiglio JJ, Palazzo L, Bartlett E, Matic I, Ahel I (junio de 2017). "Reversión de la ADP-ribosilación de serina por la hidrolasa ARH3". eLife . 6 : e28533. doi : 10.7554/eLife.28533 . PMC 5552275 . PMID  28650317. 
  5. ^ Stevens LA, Kato J, Kasamatsu A, Oda H, Lee DY, Moss J (diciembre de 2019). "Las familias ARH y macrodominios de hidrolasas del receptor de ribosa α-ADP catalizan la hidrólisis de α-NAD +". Biología Química ACS . 14 (12): 2576–2584. doi :10.1021/acschembio.9b00429. PMC 8388552 . PMID  31599159. 
  6. ^ Ono T, Kasamatsu A, Oka S, Moss J (noviembre de 2006). "La glicohidrolasa poli(ADP-ribosa) de 39 kDa ARH3 hidroliza la O-acetil-ADP-ribosa, un producto de la familia Sir2 de acetil-histona desacetilasas". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 103 (45): 16687–91. Bibcode :2006PNAS..10316687O. doi : 10.1073/pnas.0607911103 . PMC 1636516 . PMID  17075046. 
  7. ^ Oka S, Kato J, Moss J (enero de 2006). "Identificación y caracterización de una glicohidrolasa poli(ADP-ribosa) de 39 kDa de mamíferos". The Journal of Biological Chemistry . 281 (2): 705–13. doi : 10.1074/jbc.M510290200 . PMID  16278211. S2CID  19256217.
  8. ^ ab Fitzmaurice WP, Saari LL, Lowery RG, Ludden PW, Roberts GP (agosto de 1989). "Genes que codifican el sistema reversible de ADP-ribosilación de la dinitrogenasa reductasa de Rhodospirillum rubrum". Genética molecular y general . 218 (2): 340–7. doi :10.1007/BF00331287. PMID  2506427. S2CID  35664554.
  9. ^ ab Piatigorsky J, Horwitz J, Norman BL (junio de 1993). "Las cristalinas J1 del cristalino de la medusa cubomedusa constituyen una nueva familia codificada en al menos tres genes sin intrones". The Journal of Biological Chemistry . 268 (16): 11894–901. doi : 10.1016/S0021-9258(19)50284-8 . PMID  8505315.
  10. ^ Castellano S, Lobanov AV, Chapple C, Novoselov SV, Albrecht M, Hua D, et al. (noviembre de 2005). "Diversidad y plasticidad funcional de las selenoproteínas eucariotas: identificación y caracterización de la familia SelJ". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 102 (45): 16188–93. doi : 10.1073/pnas.0505146102 . PMC 1283428 . PMID  16260744. 
Este artículo incorpora texto de dominio público de Pfam e InterPro : IPR005502
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